Манипулятор фотон цена: Доступ ограничен: проблема с IP

Содержание

Манипуляторы Foton | Фотон Мотор

Бортовые платформы от китайского производителя Фотон с манипуляторами идеально отвечают российским условиям эксплуатации. Для них характерна высокая надёжность, простота, лёгкость обслуживания — в России уже работает несколько десятков компаний, предлагающих полный сервис грузовиков. Кроме того, манипуляторы Foton, а также запасные части к ним и расходные материалы отличаются конкурентной ценой.

Преимущества манипуляторов Фотон

Грузовики с КМУ оснащаются несколькими типами двигателей мощностью от 105 до 240 л.с. — её вполне достаточно для решения широкого спектра задач. Сами моторы соответствуют европейским техническим и экологическим требованиям, безопасны, производительны и износостойки. К неоспоримым достоинствам манипуляторов Фотон, обеспечивших их распространённость в России и по всему миру, стоит отнести:

  • высокий уровень комфорта для водителя — отдельные модели оснащены спальниками
  • приятный дизайн, сочетающийся с эргономичным расположением органов управления
  • экономичное потребление топлива, высокая производительность
  • манёвренность при немалой грузоподъёмности.

Автоманипуляторы Фотон широко привлекаются в случаях, когда использование большого крана экономически нецелесообразно или технически невозможно. Что делает их оптимальными для строительных и обслуживающих компаний, работающих в условиях плотной городской застройки.

Как выбрать манипулятор Фотон

Прежде чем обратиться за покупкой автоманипулятора к дилеру, нужно уточнить ряд требований к технике — правильный подход позволит вам использовать машину для решения широкого круга задач, обеспечить её стабильную многолетнюю эксплуатацию.

Рекомендуется обратить внимание на следующие факторы:

  • грузоподъёмность. Минимальное значение составляет 3 тонны, оптимальное — 5 тонн. Только тогда монтаж КМУ критично не повлияет на массу грузовика
  • рекомендуемая длина кузова находится в пределах не менее 6-6,5 метра
  • непосредственно КМУ стоит выбирать в зависимости от типа груза: предусмотрены как крюковые манипуляторы, так и гидравлические с механизмами с захватов.

Официальный дистрибьюторский центр «Фотон Мотор» предлагает технику Foton в Москве, а также запасные части и расходные материалы к ней на выгодных условиях. Для консультации и помощи в выборе автоманипулятора позвоните специалистам центра по номеру 8 (800) 100-88-43 или напишите нам на почту.

Манипулятор на шасси «FOTON AUMAN-3» г п 6.3 тонны

Экологический стандарт

EGR, механическая  топливная аппаратура                                                       

Колесная формула

4*2

Грузоподъемность шасси (кг)

15 000

Габариты борта внутр. (мм)

6500*2420*580

Количество колес  (шт. )

6

Колесная база   (мм)

5 600

Двигатель

«Perkins» (модель «Phaser»)                                                                                 

Мощность двигателя

180 л.с. при 3600 об/мин.                                                                                

Объем двигателя  (л)

6,0

Тип КПП

6-ст. мех. КПП

Шины

9.0-R20 ( металлокорд )

ГУР, кондиционер, пневмогидроусилитель сцепления, спальное место.                                                                       

Крановая установка

Макс. грузоподъемность

6 300 кг

Макс. вылет стрелы

11,0 м

Количество секций стрелы

3

Малотоннажный грузовик Foton Ollin 1039 с краном манипулятором

Это аналог всем известной отечественной бортовой «Газели», которая отлично подходит именно для грузоперевозок по городу. Однако Foton отличается несравненно более высоким уровнем комфорта, чем в других автомобилях данной ценовой категории.

Манипулятор Foton 1039 малотоннажный грузовик, являющийся зарубежным аналогом «Газели». Он имеет, практически, такие же технические показатели, и комплектуется крано-манипуляторными установками, обладающими схожими характеристиками. Для работы в условиях крупного города это один из лучших вариантов, особенно при учете его низкой стоимости. Основными его привлекательными  чертами являются доступность и очень высокий уровень комфорта, который не может предоставить ни один другой автомобиль данной ценовой категории.

Кран-манипулятор Foton Ollin 1039 – одно из лучших предложений для тех, кто осуществляет перевозку относительно небольших грузов в городских условиях.

Конечно, крано-манипуляторные установки, которыми может комплектоваться бортовой фотон не могут похвастать высокой грузоподъемностью. Это КМУ гидравлического типа серии микро, с грузоподъемностью порядка 3 т/м. Если взять типичный вариант комплектации КМУ Fassi М30, которая имеет Г-образную конструкцию, то можно отемтить, что при максимальном вылете секций 6,8 м с размноженными механизмами удлинителями можно будет поднимать груз лишь 360 кг. Но при самом малом вылете в 2,5 метра можно будет манипулировать уже весом 1200 кг. Зато смонтировать такую установку можно и позади кабины, а также на задний свес, что в ряде случаев очень удобно.

В результате мы получаем маневренный, надежный, удобный бортовой фотон, с помощью которого можно осуществлять доставку грузов, который он будет самостоятельно загружать и разгружать. При необходимости этот автомобиль можно использовать не только для подвоза стройматериалов, но и в качестве небольшого подъемного крана, например при строительстве одноэтажных построек.

К сожалению, грейфер или гидробур установить на его вряд ли получится, но и необходимость в этом возникает не столько часто. Для Foton Ollin 1039 и так всегда найдется работа. Ведь необходимость в перевозках компактных грузов, небольших контейнеров, поддонов со стройматериалами и других подобных работах, существует всегда.

А учитывая уровень комфорта, который может обеспечить этот автомобиль за столь невысокую цену, мы получаем лучшее предложение по соотношению цена-качество в данном классе спецтехники.

Купить манипулятор Фотон 1039 с КМУ

и бортовой платформой можно в отделе продаж  ООО “СпецТехКомплект”,наши специалисты всегда будут рады Вам помочь!

Технические характеристики: Foton Ollin 1039

Тип транспортного средстваАвтомобиль бортовой с КМУ
Колесная формула 4×2
Тип двигателя/л. с BJ493ZQ3 турбодизель Евро 3 / 95
Коробка передач JC5-20, 5-ступ., механическая
Рулевое управление Гидроусилитель
Общее число мест 2
Размер бортовой платформы:ДхШхВ, мм. Min. 2,5×2,1×0,38 Max. 3,2×2,1×0,6
Масса перевозимого груза, кг. 1350-1180

Виды Foton Ollin 1039

Грузовой момент, т.м

Грузоподъёмность на min. вылетеГрузоподъёмность на max. вылетеТип КМУСтрана производитель
1.5 740кг.-2,10м. 515кг.-3,0м. 370кг.-3,95м. Гидравлический, крюковой Италия
3 995кг.-2.55м. 635кг.-4,7м. Гидравлический, крюковой Италия
3. 9 1075кг.-3,65м. 590кг.-6,30м. Гидравлический, крюковой

Италия

Надежный foton кран-манипулятор для прибрежных проектов

О продукте и поставщиках:

Достигайте, казалось бы, невозможных высот или расстояний для строительных работ на берегу и проектов технического обслуживания с помощью инновационных и мощных средств. foton кран-манипулятор доступно на Alibaba.com. Эффективные установки являются узкоспециализированными, и они требуют определенных экспертных знаний для правильной работы, высокой производительности и обслуживания. foton кран-манипулятор объединяют множество надежных компонентов и функций, включая замки для оборудования и скорость ветра индикаторы для повышения устойчивости, удобства и общей безопасности. Важнейшие факторы выбора включают конструкцию материала, дизайн, весовую категорию, предполагаемое использование, размеры лодки, простоту эксплуатации и водоем.

Alibaba.com предлагает большие и маленькие. foton кран-манипулятор, которые могут быть отключены или оснащены двигателями. Они просторны, поэтому водитель может удобно сидеть во время работы с машинами, а подъемниками для тяжелых условий эксплуатации можно управлять с помощью пультов дистанционного управления. Для выполнения уникальных требований и индивидуальных проектов плавучие подъемники объединяют в себе различное навесное оборудование, такое как молотки, цепные стропы и грейферные ковши для выемки грунта и удаления мусора.

Многие. foton кран-манипулятор включают альтернативные методы физического крепления для большей устойчивости конструкции и ее целостности от сильных ветров и волн. Некоторые из задач, которые пользователи могут выполнять с помощью удобных машин, включают, среди прочего, дноуглубительные работы, проектирование буксирных троп, подъем и транспортировку материалов к прибрежным участкам, работы по сносу и прокладку кабелей и трубопроводов вдоль буксирных троп.

Сравните умопомрачительные товары с хорошей скидкой. foton кран-манипулятор на Alibaba.com и соглашайтесь на невероятные предложения от проверенных производителей и продавцов оборудования. Эти изделия гарантированного качества поставляются с инструкциями по эксплуатации и техническому обслуживанию. Приобретите плавучие подъемники для более легких строительных работ.

Аренда манипулятора FOTON+TADANO Z300 в Москве и Московской области

  • Манипулятор Hyundai hd 120 +hiab 160t

    Цена: 14 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор-вездеход на базе КАМАЗ 43118 Kanglim

    Цена: 16 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор-вездеход на базе КАМАЗ 43118 Dongyang

    Цена: 16 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ. ..
  • Манипулятор MAN TGA

    Цена: 12 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Маз+hiab xs 3 тонны

    Цена: 10 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор длинномер

    Цена: 20 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Кран-манипулятор Nissan

    Цена: 14 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Daweoo novus +hiab 190

    Цена: 14 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Кран-манипулятор Mitsubishi Fuso

    Цена: 14 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ. ..
  • Манипулятор Daweoo novus+kanglim 1056

    Цена: 12 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Fuso+unic 370

    Цена: 10 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Volvo+palfinger 36002

    Цена: 18 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Hyundai +soosan

    Цена: 10 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Hyundai 120 + Unic 500

    Цена: 12 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • МАЗ Tadano Z 300

    Цена: 10 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ. ..
  • Манипулятор Isuzu+palfinger 12000

    Цена: 12 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Кран-манипулятор Hino

    Цена: 12 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • КАМАЗ 65117 с манипулятором

    Цена: 14 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Камаз 65117+dongyan 1506

    Цена: 12 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Daweoo novus 8м +css 160

    Цена: 14 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор вездеход стрела 7 тонн 19 метров

    Цена: 16 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ. ..
  • Манипулятор ford+fassi f 150

    Цена: 14 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Hyundai hd 170+soosan 736

    Цена: 14 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Isuzu +Kanglim

    Цена: 10 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Isuzu+nansei 263

    Цена: 9 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Iveco+fassi f 310 xp

    Цена: 18 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Volvo+palfinger 36002

    Цена: 18 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ. ..
  • Манипулятор Hyundai 120+soosan 513

    Цена: 12 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Манипулятор Iveco+fassi f 310 xp

    Цена: 18 000 Р (Смена 8 часов)

    Сделать заказ…
  • Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie

    Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности. Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.


    Настройка браузера на прием файлов cookie

    Существует множество причин, по которым файл cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее распространенные причины:

    • В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки браузера, чтобы принять файлы cookie, или спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
    • Ваш браузер спрашивает, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались. Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файл cookie.
    • Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Попробуйте другой браузер, если вы подозреваете это.
    • Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы это исправить, установите правильное время и дату на своем компьютере.
    • Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie. Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.

    Почему этому сайту требуются файлы cookie?

    Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Предоставить доступ без файлов cookie потребует от сайта создания нового сеанса для каждой посещаемой вами страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.


    Что сохраняется в файле cookie?

    Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в файле cookie; никакая другая информация не фиксируется.

    Как правило, в файле cookie может храниться только та информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, если вы не решите ввести его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступ к остальной части вашего компьютера, и только сайт, создавший файл cookie, может его прочитать.

    Однофотонные источники: Приближение к идеалу через мультиплексирование: Review of Scientific Instruments: Vol 91, No 4 Подсчитайте количество предвещающих событий в единицу времени

    Видимость интерференции Хонга-Оу-Манделя 50 50. Хонг С.К., Оу З.Ю. и Мандель Л., “Измерение субпикосекундных интервалов времени между двумя фотонами с помощью интерференции”, Физ. .Преподобный Летт. 59 , 2044–2046 (1987). https://doi.org/10.1103/physrevlett.59.2044 V HOM Видимость провала HOM, зарегистрированная при просмотре совпадений, когда два фотона падают на противоположные порты луча 50:50 C max , C min ) по падению, VHOM=Cmax-Cmin/Cmax
    Неразличимость I Неразличимость двух фотонов из разных источников или из одного и того же источника в разное время количественно определяет их способность интерферировать.Полная неразличимость ( I = 1) подразумевает идеальную интерференционную видимость », Физ. Преподобный Летт. 59 , 2044–2046 (1987). https://doi. org/10.1103/physrevlett.59.2044 между двумя режимами. Неразличимость равна видимости провала: I = V HOM
    Многофотонная составляющая Доля общего фотонного состояния, состоящая из фоковских состояний более чем одного фотона.Эвристическая, а не точная величина. количество источников, выходы которых объединены путем коммутации в мультиплексированный однофотонный источник Подсчитайте количество построенных вами источников
    Коэффициент выходного шума 52 52.Брида Г., Деджованни И.П., Дженовезе М., Мигдалл А., Пьячентини Ф., Поляков С.В., Руо Берчера И. Экспериментальная реализация объявленного источника одиночных фотонов с низким уровнем шума // Опт. Экспресс 19 , 1484–1492 (2011). https://doi.org/10.1364/oe.19.001484 Отношение в режиме вывода фотонного источника фоновых отсчетов к общему количеству выходных отсчетов (сумма фоновых и истинных отсчетов) Использовать совпадение времени гистограммы для определения истинного узкого фотонного пика и широкого фона. Разделите эти подсчеты фона на сумму подсчетов истинного и фона испускаются. Источники с числом Шмидта больше 1 производят фотоны без ограничения преобразования Измерьте необъявленное число gunh(2)(0) для любого фотона пары и найдите число Шмидта KS≈1/gunh(2)(0) −1
    Второй порядок g(2)(0) В одиночном режиме дает информацию о
    корреляционная функция gh(2)(0) многофотонная составляющая.Варианты, специфичные для, могут быть аппроксимированы следующим образом: разделить моду
    gunh(2)(0) парные источники – это объявленные gh(2)(0), на светоделителе 50:50, и поместите
    одиночных
    измеренных в зависимости от предвещающего события, фотонных детекторов на каждом выходе, записывая
    и непредвестный gunh(2)(0), измеренный 90 детектор S 1 и S 2 и
    безусловное совпадения C . Тогда, г (2) (0) ≈ S 1 S 2 / C
    Однофотонная скорость S DET Подсчет количества зарегистрированных событий детектирования одиночных фотонов в единицу времени (т. е. совпадений между сигналом и холостым сигналом)
    Частота повторения источника R src Частота попыток выделения одного фотона из источника Для пространственно мультиплексированных источников, как правило, такая же, как частота повторения лазера накачки.Для других случаев частота повторения этого источника часто намного ниже, чем частота повторения лазера накачки, поэтому будьте внимательны при подсчете количества сделанных попыток
    Сила сжатия сжимающее взаимодействие или параметрическое преобразование с понижением частоты; зависит от мощности накачки, нелинейности, кристаллогеометрии, фазового синхронизма Может быть определено по скорости счета одиночных фотонов в режиме низкого сжатия. Относится к параметру сжатия r как λ = tanh r

    . . Фотонные архитектуры с непрерывной переменной (CV) для квантовых вычислений и моделирования (

    1 ) требуют высококачественных масштабируемых устройств для генерации сжатого света, который является фундаментальным строительным блоком для многих приложений фотонной квантовой обработки информации.К ним относятся квантовые вычисления CV ( 2 ) и выборка гауссовых бозонов ( 3 ). Последнее является одним из наиболее многообещающих способов достижения краткосрочного квантового преимущества и включает в себя множество интригующих вариантов использования, включая моделирование молекулярно-вибронного спектра ( 4 ) и квантовые вложения графовых задач, таких как идентификация плотных подграфы ( 5 ), совершенные паросочетания ( 6 ), изоморфизм графов ( 7 ) и сходство графов ( 8 ).Выборка гауссовых бозонов также может использоваться для предсказания конфигураций стыковки молекул ( 9 ). Для реализации всего этого необходим масштабируемый источник сжатого света, который также можно использовать для улучшения оптического восприятия вблизи квантового предела ( 10 ). Естественной платформой для изучения этих масштабируемых сжатых источников света является интегрированная фотоника: стабильность и воспроизводимость технологичности, предлагаемые современными литографическими методами, открывают большие перспективы для реализации полезных квантовых технологий в масштабе.Интеграция квантовых источников света особенно важна в вариантах квантовых вычислений на основе CV. Это связано с острой фазовой чувствительностью сжатых состояний, которые служат основным ресурсом неклассичности в этих вариантах. На сегодняшний день прогресс в области интегрированного в чип сжатия был ограничен. Лензини и др. . ( 11 ), Mondain и др. . ( 12 ) и Стефски и др. . ( 13 ) продемонстрировали устройства на основе волноводов из ниобата лития с низким показателем преломления и большим поперечным сечением, в которых используются сегменты волноводов с периодической полярностью для генерации сжатого света в сочетании с линейной оптикой на монолитном кристалле. Хотя эта платформа привлекательна своей высокой нелинейностью второго порядка и электрооптическим откликом, а также простотой интеграции с оптоволоконными компонентами, в настоящее время ей не хватает масштабируемости, предлагаемой нанофотонными системами: низкое поперечное ограничение препятствует монолитной интеграции высоких -глубинные схемы с сотнями оптических элементов. Датт и др. . ( 14 ) предпринял первые набеги на высокоиндексные контрастные нанофотонные системы для сжатия, продемонстрировав сжатие разности интенсивностей от микрокольцевого оптического параметрического генератора (OPO) из нитрида кремния, управляемого выше порогового значения.Однако квадратурное сжатие не было достигнуто, и продемонстрированное яркое сжатие типа «двойного луча» выше порога обязательно сопровождается большими классическими средними полями и очень высокими уровнями избыточного шума, что делает его несовместимым с экспериментами или архитектурами, требующими подсчета фотонов. В этих архитектурах квантовая выборка (которая включает в себя применение выборки гауссовых бозонов) ( 4 9 ) предъявляет еще более строгие требования к характеру используемого сжатого источника света: помимо возможности масштабирования, такой источник должен быть способный создавать сжатые состояния в одном временном режиме ( 15 ). Это требование часто упускается из виду, поскольку его часто можно избежать в квантовых протоколах на основе одиночных фотонов с помощью адекватной спектральной фильтрации или постселекции событий обнаружения, которые происходят в пределах общего узкого временного окна. К сожалению, эти стратегии нельзя использовать для квантовой выборки CV: спектральная фильтрация приводит к неприемлемым потерям в системе, последствия которых нельзя обойти путем постселекции при успешном обнаружении событий; и временное окно не может быть применено к событиям обнаружения, в которых присутствуют вклады многих фотонов, из-за низкого временного разрешения доступных систем разрешения числа фотонов ( 16 ).Поскольку многофотонные события, как правило, важны во всей области применения квантовой выборки CV, а потери оказывают значительное вредное воздействие как на точность, так и на скорость счета ( 17 ), становится жизненно важным спроектировать источник, который сам по себе генерирует сжатые импульсы. состояний в одном временном режиме. Эта функция оказалась сложной на всех платформах и была наиболее тщательно исследована в периодически поляризованных кристаллических волноводах χ 2 ( 18 20 ), где приближение к работе в одном временном режиме требует очень тщательного расчета дисперсии.Эти соображения делают структуру временной моды ключевым показателем для оценки при квалификации сжатых источников света для практического использования. Здесь мы сообщаем о демонстрации сжатия вакуума с квадратурным сжатием и разности числа фотонов, созданного с помощью встроенного нанофотонного устройства. Мы используем спонтанное четырехволновое смешение (SFWM) в микрокольцевых резонаторах из нитрида кремния ( 21 ) — легкодоступную и проверенную технологию, доступную на коммерческих производственных платформах. Мы измеряем дисперсию всех квадратур сжатых мод с помощью сбалансированного гомодинного детектирования, а также проверяем совместимость этого источника с экспериментами по подсчету фотонов и приложениями для выборки путем непосредственного измерения фотонной статистики на выходе с помощью датчиков переходного фронта с разрешением числа фотонов (TES). ) ( 16 ).Оцениваются необработанные корреляции числа фотонов, и пристальное внимание уделяется структуре временных мод генерируемого света: выполняются необъявленные измерения корреляции второго порядка, чтобы гарантировать, что наше устройство может работать в одном временном режиме ( 22 ). Само устройство. прост: как квадратурное сжатие, так и сжатие разности числа фотонов генерируются в микрокольцевых резонаторах из нитрида кремния, точечно соединенных с канальными волноводами, с наложенными микронагревателями для настройки и стабилизации резонансной длины волны.Изготовление осуществлялось на коммерческом литейном заводе (LIGENTEC SA). Геометрия волновода состоит из стехиометрической проволоки Si 3 N 4 , полностью покрытой SiO 2 . Используемые сечения составляли 800 нм на 1000 нм для квадратурного сжатия и 800 нм на 1650 нм для измерений корреляции числа фотонов. Эта платформа была выбрана из-за ее низких линейных потерь при распространении, отсутствия двухфотонного поглощения и высокого нелинейного параметра третьего порядка, составляющего приблизительно 1 (Вт·м) -1 . Для генерации сжатия мы использовали SFWM: одиночная сильная накачка (но достаточно слабая, чтобы оставаться ниже любого порога ПГС), резонансная с одним из кольцевых резонансов, генерирует многомодовый сжатый вакуум в гребенке соседних резонансов (рис. 1). Нелинейный гамильтониан H NL , описывающий взаимодействие между модой накачки и конкретной парой сигнального и холостого резонансов, имеет вид bP†bPbP+2bP†bP(bS†bS+bI†bI))

    (1)

    где b x – оператор аннигиляции, связанный с модой резонатора x ∈ {P, S, I} , представляющие режимы накачки, сигнала и холостого хода соответственно.Здесь Λ — коэффициент, представляющий силу нелинейной связи между модами, и хорошо аппроксимируется формулой Λ≈ħω¯vg2γNL/L, где ω¯=(ωP2ωSωI)1/4, v g — групповая скорость, γ NL нелинейный параметр волновода, а L длина пути резонатора туда и обратно.

    Рис. 1 Общий вид устройства.

    ( A ) Схема устройства микрокольца, показывающая резонатор, боковой канал, микронагреватель (синий) и режимы рассеяния. ( B ) Изображение устройства под оптическим микроскопом.( C ) Иллюстрация внутрирезонаторного процесса SFWM, показывающая частотные сдвиги ΔSPM и ΔXPM, связанные с самомодуляцией и кросс-фазовой модуляцией (SPM и XPM, соответственно). ( D ) Репрезентативный спектр пропускания микрокольцевого устройства, показывающий три перевязанных резонанса вблизи 1550 нм.

    Первый член уравнения. 1 приводит к SFWM, в котором два фотона накачки аннигилируют и генерируется пара сигнального и холостого фотонов; в более высоком порядке этот процесс генерирует сжатое состояние, включающее сигнал и бездействие ( 15 , 24 ).Для сильного когерентного и непрерывного (CW) входного поля накачки мы можем рассматривать внутрирезонаторную накачку классически и заменить b P ее классическим математическим ожиданием βP=β¯Pe−i(ωP+∆P)t, где β ¯P – константа, а Δ P – отстройка входного поля накачки от резонанса. Эффекты самомодуляции и перекрестной фазовой модуляции (SPM и XPM, соответственно), представленные двумя последними членами в уравнении. 1, затем проявляются как зависящие от мощности накачки частотные сдвиги резонансов накачки, сигнала и холостого хода (рис.1С). Обратите внимание, что в уравнении 1, мы пренебрегаем влиянием ФСМ на сигнальный и холостой режимы, поскольку эти эффекты пренебрежимо малы в интересующем нас режиме значительно ниже порога ПГС. Поскольку волноводы, используемые в наших устройствах для квадратурного сжатия, работают в режиме нормальной дисперсии, эти частотные сдвиги губительны для одиночной схемы накачки, так как приводят к повышенному энергетическому рассогласованию резонансных частот вдали от идеальной рабочей точки для SFWM 2ω P = ω S + ω I .Несмотря на это, значительное квадратурное сжатие при скромных уровнях входной мощности все же было достигнуто без инженерной дисперсии.

    Статистику выходного сигнала и холостых полей можно рассчитать, используя теорию входа-выхода резонатора; полная информация доступна в дополнительных материалах. В последующих разделах мы сообщаем измеренную квадратуру и статистику числа фотонов с устройства, а затем сравниваем наши результаты с предсказаниями, основанными на этой теории.

    ОБСУЖДЕНИЕ

    То, что наш источник может генерировать почти одиночные временные сжатые состояния без специального проектирования дисперсии или согласования фаз, в первую очередь связано с его резонансной природой.Резонаторы обеспечивают внутреннее узкое ограничение спектра нелинейного усиления из-за узкой ширины линии, связанной с их резонансами, что упрощает предотвращение заполнения нежелательных временных мод фотонами. Измеренные величины г (2) не являются верхними границами: Путем выборочного проектирования добротности резонансов накачки, сигнала и холостого хода ( 37 ) или более тщательного расчета импульса накачки ( 38 ), могут быть сгенерированы сжатые состояния с g (2) , произвольно близкими к 2.Как и в большинстве интегрированных квантово-оптических устройств, потери являются основным фактором, ограничивающим производительность. В нашем случае ~1,5 дБ потерь связи, связанных с выделением сжатого света в волокно, ограничивает сжатие, доступное вне кристалла (при условии, что новое устройство с идеальной эффективностью выхода из кольца и при условии идеальной эффективности сбора и обнаружения) примерно до 5 дБ для как квадратурные, так и контексты измерения числа фотонов. Снижение выходных потерь до 0,5 дБ — сложная, но не нереалистичная цель — немедленно улучшит это ограничение почти до 10 дБ, после чего выходная эффективность резонатора станет доминирующим фактором, ограничивающим доступное сжатие.Улучшение внутрикристальных потерь при распространении привело бы к более высоким коэффициентам качества резонатора, что позволило бы реализовать более высокую эффективность утечки при сохранении или улучшении энергоэффективности, что привело бы к лучшему сжатию. По нашим оценкам, наиболее известные устройства с микрокольцевыми резонаторами способны генерировать более 10 дБ квадратурного сжатия на кристалле при мощности накачки менее 100 мВт ( 15 ). Повышение эффективности генерации также улучшит отношение сигнал/шум за счет уменьшения количества энергии, необходимой для работы на желаемом уровне сжатия, тем самым уменьшив количество фотонов, генерируемых в результате спонтанного рамановского рассеяния в компонентах волокна.Для некоторых приложений, включая наиболее общие архитектуры квантовой выборки CV, удобно или необходимо генерировать сжатие в одной «вырожденной» моде, ограниченной небольшим частотным диапазоном, а не распределенной по паре сигнальных и холостых мод. Это может быть достигнуто в нашем устройстве с использованием схемы двойной накачки, которая уже использовалась для источников вырожденных фотонных пар ( 39 ) и ПГС ( 40 ). Однако с таким устройством необходимо соблюдать осторожность, чтобы подавить ложные процессы SFWM, включающие сжатый резонанс и нежелательные резонансы; без такой схемы подавления прогнозируется заметное количество избыточного шума, который загрязняет выходной сигнал.Теоретически это обсуждалось ( 15 ) и является естественным следующим шагом для разработки интегрированных в чип источников света ( 41 , 42 ).

    МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

    Во всех экспериментах свет вводился в чип с помощью оптических волокон со сверхвысокой числовой апертурой (UHNA7), вручную выровненных по граням чипа. Для уменьшения отражений на границе раздела использовался гель для согласования показателей преломления. Температурная стабилизация чипа осуществлялась с помощью термоэлектрического охладителя с медленной пропорционально-интегрально-дифференциальной обратной связью, а для доступа к элементам микронагревателя использовались электрические щупы. Радиусы используемых микрокольцевых резонаторов составляли 120 и 200 мкм для экспериментов по квадратурному сжатию и сжатию по разнице числа фотонов соответственно.

    Измерения квадратурного сжатия были выполнены с использованием коммерческого сбалансированного приемника (Wieserlabs, BPD1GA), который имеет примерно 80% квантовую эффективность при 1550 нм. Балансировка проводилась с помощью перестраиваемого светоделителя с волоконной связью (Newport). Линейность детектора оценивали путем изменения уровня гетеродина при контроле разностных флуктуаций фототока на анализаторе электрического спектра; Затем локальный осциллятор был настроен на устранение темнового шума 13 дБ, хорошо в линейном режиме, но далеко за пределами насыщения, при оптической мощности 6 мВт.Добротность резонансов, использованных в этом эксперименте, составляла примерно 2 × 10 5 с эффективностью выхода примерно 75%. Длины волн накачки, сигнала и холостого хода составляли примерно 1550,2, 1548,7 и 1551,7 нм соответственно. Свободный спектральный диапазон резонатора составлял примерно 190 ГГц.

    Измерения разрешения числа фотонов проводились с помощью ТЭС, считывания индуктивным соединением с криогенным предусилителем на основе малошумящих когерентных сверхпроводящих квантовых интерференционных массивов устройств; эта система была предоставлена ​​Национальным институтом стандартов и технологий.Следы с выхода системы обнаружения дополнительно усиливались, а затем оцифровывались аналого-цифровым преобразователем (AlazarTech, ATS9440), который запускался электронным импульсом, синхронизированным с оптическими импульсами. Затем следы были проанализированы в программном обеспечении, чтобы присвоить каждому целое число, соответствующее его наиболее вероятному количеству фотонов, с использованием метода, основанного на анализе главных компонентов ( 43 ). Мы оцениваем вероятность неправильной категоризации фотона порядка 10 −3 в исследуемом режиме.Данные калибровки когерентного состояния были получены путем сильного ослабления импульсного лазерного источника, падающего на детекторы, и измерения соответствующих статистических данных, чтобы убедиться, что они соответствуют распределению Пуассона, которое согласуется со средним числом фотонов. Чтобы избежать насыщения детекторов, эксперименты по числу фотонов проводились с последовательностью импульсов накачки с частотой повторения 62,5 кГц. Добротность резонансов, использованных в этом эксперименте, составляла примерно 8 × 10 5 с эффективностью выхода примерно 80%.Длины волн накачки, сигнала и холостого хода составляли примерно 1554,2, 1551,4 и 1557,0 нм соответственно. Свободный спектральный диапазон резонатора составлял примерно 175 ГГц. Данные о количестве фотонов были получены наборами по 800 000 отсчетов для каждой точки данных. Каждый набор был использован для разработки шаблона для присвоения целочисленных номеров фотонов электрическим импульсам, взятым из детекторов TES. Полученные 800 000 целых чисел фотонов были разделены на восемь подмножеств по 100 000 образцов. Для каждого из этих подмножеств были рассчитаны такие величины, как коэффициент шумоподавления, дисперсия разности чисел и корреляционная статистика второго порядка; полученные средние значения и стандартные отклонения использовались для точек и планок погрешностей на рис. 4 и 5. Более подробная информация об этих и других аспектах экспериментального оборудования и техники доступна в дополнительных материалах.

    Поляритонная химия: мысли внутри (фотонной) коробки

    Изучение одиночных квантовых объектов, находящихся в замкнутых электромагнитных средах, является основным направлением квантовой электродинамики резонаторов (КЭД). Согласно недавнему историческому отчету лауреата Нобелевской премии 2012 года Сергея Ароша (1), истоки этой области можно проследить до первых дней квантовой механики, со знаменитым спором между Альбертом Эйнштейном и Нильсом Бором относительно мысленного эксперимента с фотоном. в коробке.Хотя Эйнштейн использовал фотон в ящике как теоретическую конструкцию, он, возможно, не предполагал, что такая концепция перевоплотится спустя десятилетия в одну из любимых экспериментальных площадок ученых для проверки, исследования и контроля квантовой механики. Фактически, атомы в оптических полостях стали одним из основных строительных блоков современных квантовых технологий, что привело к созданию высокоточных источников одиночных фотонов, платформ для воссоздания эффективных межфотонных взаимодействий или даже квантовых симуляторов систем многих частиц. В последние годы на стыке CQED и химии возник междисциплинарный подход, получивший название «поляритонная химия» (2, 3), который сосредоточен вокруг вопроса: могут ли материалы изменять свои химические свойства, просто будучи погруженными в оптический резонатор? Если ответ на этот вопрос положительный, могут последовать далеко идущие последствия, поскольку потенциально можно обойти трудоемкие синтетические модификации материалов, используя в качестве альтернативы эффекты CQED. Действительно, многие экспериментальные (4⇓–6) и теоретические данные (7⇓–9) указывают на то, что при определенных обстоятельствах модификации фотохимической и кинетики основного состояния, переноса энергии и переноса заряда возможны с использованием оптических полости.В PNAS Schäfer et al. (10) представить убедительные теоретические и расчетные доказательства в поддержку этих утверждений. Шефер и др. проведите исследование минималистической квантово-механической модели, которая демонстрирует, что энергия молекулярного возбуждения и процессы переноса заряда могут быть нетривиально изменены при сильной связи молекулярного димера с модой оптического резонатора.

    Когда связь между фотоном |ph〉 и материальным (двухуровневая система) возбуждением |exc〉 сильнее, чем индивидуальные скорости затухания (g≫Γ,κ, где Γ и κ — ширина линии материала и резонатора), описание сложной системы свет-материя опирается на модель Джейнса-Каммингса (ДК), которая предсказывает, что собственные состояния связанной системы представляют собой поляритоны, когерентные суперпозиции состояний света и материи.На рис. 1 A показано, что низшими по энергии собственными состояниями модели JC при резонансе свет-материя (частоты возбуждения равны, ωph=ωexc) являются нижний поляритон (LP) и верхний поляритон (UP) |∓〉= 12(|exc〉±|ph〉), которые представляют собой симметричные и антисимметричные комбинации отдельных возбуждений и имеют собственные частоты ℏω∓=ℏωexc ∓g, где g=−ℏωph3ϵ0Vµ задается проекцией однофотонного электрического поля ( ℏ — приведенная постоянная Планка, ϵ0 — диэлектрическая проницаемость вакуума, V — объем моды резонатора) на переходном диполе μ материала; разница энергий Ω=2g между UP и LP известна как расщепление Раби. Симметрии этих поляритонов напоминают симметрии связывающих и разрыхляющих орбиталей молекулы водорода.

    Рис. 1.

    ( A и B ) Различные ароматы молекулярной сильной связи с одной молекулой ( A ) и с N>1 молекулами ( B ). Энергетический спектр задается моделью JC ( A ) и моделью TC ( B ). При резонансе свет-материя (ℏωph=ℏωexc) UP и LP представляют собой состояния полусвета-полуматерии, разделенные расщеплением Раби Ω, которое в два раза превышает одномолекулярное взаимодействие света и вещества g для A и дважды муфта коллективная Ng для B .Сверхизлучающее усиление связи в B происходит за счет наличия N−1 темных состояний, припаркованных на энергии возбуждения материала. N>107 является макроскопическим числом в типичных экспериментах и ​​служит очень эффективной релаксационной ловушкой как для UP, так и для LP.

    На первый взгляд, союз ККЭД с химией кажется противоречащим принципам квантовой оптики, которые делают упор на первозданные и хорошо управляемые физические системы. Однако, если мы захотим использовать набор оптических резонаторов, принимая во внимание сложность химических систем, мы можем открыть двери для нового поколения молекулярных материалов, чьи каталитические или оптоэлектронные свойства могут переключаться по требованию для синтеза, спектроскопии и сенсорных приложений. .В частности, в контексте сильной связи света и материи гибридизация между светом и материей позволяет использовать лучшее из обоих миров для изменения физико-химических свойств молекулярных систем. Учитывая младенчество химии поляритонов, крайне важно разработать простые и удобные теоретические модели, которые обеспечивают интуицию и руководство для понимания экспериментальной феноменологии, а также для разработки плодотворных экспериментальных стратегий. Шефер и др. (10) исследовать одну из простейших ab initio квантово-химических моделей, которые могут быть построены для поляритонной химии: одномерный электронный гамильтониан, состоящий из двух электронов, которые взаимодействуют через мягкие кулоновские потенциалы между собой и с двумя зажатыми ядрами и, в то же время, время, пара в однофотонный режим. Эта модель служит минимальным описанием донорно-акцепторной пары хромофоров, которая при фотовозбуждении донора передает энергию акцептору посредством виртуального продольного фотонного (механизм Фёрстера) или электронного (механизм Декстера) обмена; влияние сильной связи света и вещества (измеряемой в единицах g/ωph) на эти химические процессы анализируется путем характеристики собственных состояний гамильтониана, а также соответствующей динамики, зависящей от времени. Эти механизмы передачи энергии возбуждения (EET) лежат в основе многих процессов сбора света и фотохимии в биологических и искусственных антеннах.С одной стороны, эффективность Förster EET обычно масштабируется как R−6 (R – межхромофорное расстояние), учитывая, что их опосредуют диполь-дипольные взаимодействия; этот факт позволяет Förster EET служить молекулярной линейкой в ​​биофизических приложениях. С другой стороны, эффективность процессов Dexter EET экспоненциально падает с R из-за быстрого затухания перекрытия волновых функций между хромофорами. В своем исследовании Schäfer et al. (10) демонстрируют, что пространственная делокализация фотонной моды (см.11⇓–13 для аналогичных результатов) и его одновременное взаимодействие с электронами делает процессы переноса Декстера и Ферстера значительно улучшенными с точки зрения их типичных пространственных диапазонов работы. Это замечательное открытие, особенно с учетом того, что процессы Декстера обычно действуют только в пределах межмолекулярных контактных расстояний. Уникальной ценностью этой модели реального пространства является возможность точного вычисления показателей квантовой запутанности для электронов или фотонов, вызванных взаимодействием света и материи.Из наших знаний квантовой химии не секрет, что продольные фотоны, лежащие в основе кулоновских взаимодействий, могут индуцировать значительные электронные корреляции; однако авторы обнаруживают, что это справедливо и для поперечных фотонов, хотя и в меньшей степени, чем для их продольных аналогов. Наконец, авторы обнаруживают, что фотоны развивают ангармонизм из-за их сильного взаимодействия с электронами. Это опять-таки ожидается из нашего понимания нелинейной оптики, согласно которой эффективное взаимодействие между фотонами может быть воссоздано ангармонической материальной средой.Красота результата Schäfer et al. Однако (10) состоит в том, что оно естественным образом возникает из ab initio нерелятивистской квантовой механики взаимодействующих электронов и фотонов в целом.

    Таким образом, выделенное исследование служит большим стимулом для экспериментаторов к разработке систем, демонстрирующих сильную связь света и материи на уровне одной или нескольких молекул. Широкая ширина молекулярных линий часто превосходит одномолекулярную связь, Γ ≫ g, что делает этот режим труднодостижимым с типичными микрополостями Фабри-Перо.Важно отметить, что недавние эксперименты tour de force продемонстрировали возможность входа в режим сильной связи с одной молекулой с использованием экстремального удержания электромагнитной моды в плазмонных соединениях, хотя и ценой повышенных электромагнитных потерь из-за металла (14). Однако за счет тщательного проектирования резонаторных структур, в результате чего потери и объем мод оптимизируются, должны быть достигнуты более обтекаемые реализации режима сильной связи с одной молекулой.

    Шефер и др.проведите исследование минималистической квантово-механической модели, которая демонстрирует, что энергия молекулярного возбуждения и процессы переноса заряда могут быть нетривиально изменены при сильной связи молекулярного димера с модой оптического резонатора.

    С другой стороны, множество интригующих экспериментов при комнатной температуре (2) за последнее десятилетие продемонстрировали различные эффекты химии поляритонов из-за сильной связи света и вещества между ансамблями N>107 молекулярных диполей и резонаторной модой. , сценарий, который может быть описан так называемой моделью Тэвиса-Каммингса (ТК) (рис.1 В ). Эти реализации продемонстрировали существенные изменения скоростей и механизмов химических процессов (4⇓–6, 15) при возникновении сильной связи. В этих архитектурах бремя достижения сильной связи на уровне одной молекулы обходится требованием менее строгого условия, Ω = Ng ≫ Γ, κ, а именно, что коллективное взаимодействие света и материи, которое сверхизлучательно усиливается N, больше ширины линий независимого возбуждения. Действительно, недавно были продемонстрированы гигантские расщепления Раби 2Ng, равные ∼1 эВ для электронных переходов в органических хромофорах (16) или ∼60 мэВ для колебательных возбуждений в металлоорганических соединениях (17), что соответствует так называемому режиму сверхсильной связи, где расщепление Раби составляет значительную долю оптической щели материала (18).Однако это сверхизлучательное усиление связи света и материи дорого обходится: оптический режим выбирает полностью симметричную (сверхизлучающую) линейную комбинацию диполей, с которой следует смешивать, и оставляет макроскопическое число (N−1) темных (субизлучающих) комбинаций. припаркованы при той же энергии, что и голые молекулярные возбуждения (3). На рис. 1 B показаны эти низкоэнергетические возбуждения модели TC. Опять же, на помощь приходит аналогия с теорией молекулярных орбиталей: в то время как симметрия поляритонных состояний напоминает симметрию связывающих и разрыхляющих орбиталей, темные состояния соответствуют несвязывающим орбиталям, которые не имеют подходящей симметрии для образования химической связи.

    Хотя существуют очевидные общие черты между одиночной молекулой и ансамблевой сильной связью, наличие макроскопического темного резервуара в последней может привести к различным явлениям. Начнем с того, что модель JC характеризуется сильной малофотонной нелинейностью из-за быстрого насыщения одной молекулы, тогда как в модели TC эти эффекты ослаблены. Более связанные с обсуждаемой работой предыдущие экспериментальные демонстрации дистанционной передачи энергии с помощью поляритона в ансамблевом режиме показали почти независимую от расстояния скорость передачи энергии между ансамблями донорных и акцепторных хромофоров, оба из которых сильно связаны с полостью (5). , 15), вывод, полученный также в работе Schäfer et al.(10). Независимость от расстояния как в случае одиночной молекулы, так и в случае ансамбля проистекает из дальнодействующей когерентности фотонного компонента, из которого состоит поляритон. Однако кинетика ансамблевой системы заметно отличается от сценария одиночной молекулы из-за роли, которую темновые состояния играют в посредничестве EET между поляритонами посредством колебательной релаксации (11, 12) в механизме, который очень напоминает режим Редфилда ВОСТОЧНОЕВРОПЕЙСКОЕ ВРЕМЯ. Неэмпирическая квантово-механическая обработка ансамблевого режима сильной связи слишком сложна в вычислительном отношении.Таким образом, ожидается, что синергетическая комбинация функционала плотности CQED (19) и теории среднего поля (20) вместе с (соответственно!) крупнозернистыми низкоэнергетическими моделями даст информативную характеристику этих сложных систем.

    Подводя итог, мы надеемся убедить читателя в том, что поляритонная химия, являющаяся зарождающейся областью исследований, направленных на разработку ККЭД для химии и материаловедения, открывает привлекательные перспективы для фундаментальной и прикладной науки. Были выделены некоторые технические проблемы как с теоретической, так и с экспериментальной точки зрения, для которых мы ожидаем, что в ближайшем будущем будут представлены творческие решения.Применяя концепции CQED в химии и материаловедении, можно выйти за рамки традиционных подходов, основанных на синтезе, и сконструировать материю, когерентно комбинируя возбуждение материала со светом. Поэтому мы ожидаем, что поляритонная химия создаст новое поколение квантовых технологий, которые выйдут за рамки стандартных приложений квантовых вычислений и моделирования на нетронутых платформах и вместо этого предложат творческие способы управления сложными химическими системами. В конце концов, может быть, стоит творчески мыслить «внутри (фотонной) коробки».”

    Благодарности

    Мы выражаем благодарность Министерству энергетики США, Управлению науки, Фундаментальным энергетическим наукам в рамках программы «Физическое поведение материалов» Award DE-SC0017760 (для VMM) и Программы изучения конденсированных фаз и межфазных молекулярных исследований, Ранние исследования Премия программы DE-SC0019188 (для JY-Z. ).

    Сноски

    • Вклад авторов: J.Y.-Z. и В.М.М. написал бумагу.

    • Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

    • См. сопутствующую статью на стр. 4883 в выпуске 11 тома 116.

    Высокопроизводительный, экономичный микроскоп с открытым исходным кодом для сканирующей двухфотонной микроскопии, модульный и легко адаптируемый

    Abstract

    Двухфотонная лазерная сканирующая микроскопия произвела революцию в возможности определения клеточных и физиологических функций в остро изолированных тканях и в естественных условиях . Однако для многих лабораторий существуют препятствия для приобретения двухфотонных микроскопов.Кроме того, типичные системы, если они находятся в собственности, трудно модифицировать с учетом быстро развивающихся методологий. Потенциальное решение этих проблем состоит в том, чтобы дать ученым возможность построить свою собственную высокопроизводительную и адаптируемую систему, преодолев нехватку ресурсов. Здесь мы представляем подробный аппаратный ресурс и протокол для создания вертикального, модульного и адаптируемого двухфотонного лазерного сканирующего флуоресцентного микроскопа, который можно использовать для приложений в vitro или в vivo .Микроскоп состоит из высококачественных компонентов на каркасе из готовых совместимых оптико-механических деталей. Специальная конструкция позволила визуализировать ткань мозга мыши на глубине около 1 мм, а соотношение сигнал/шум превзошло все протестированные коммерческие двухфотонные системы. В дополнение к подробному списку деталей, инструкциям по сборке, тестированию и устранению неисправностей, наш план включает в себя полные трехмерные компьютерные модели, которые значительно сокращают базу знаний, необходимую для неопытного пользователя.Этот ресурс с открытым исходным кодом снижает барьеры, чтобы оснастить больше лабораторий высокопроизводительной двухфотонной визуализацией и помочь нам лучше понять клеточные и физиологические функции живых систем.

    Образец цитирования: Rosenegger DG, Tran CHT, LeDue J, Zhou N, Gordon GR (2014) Высокопроизводительный, экономичный микроскоп с открытым исходным кодом для сканирующей двухфотонной микроскопии, модульный и легко адаптируемый. ПЛОС ОДИН 9(10): е110475. https://дои.org/10.1371/journal.pone.0110475

    Редактор: Christof M. Aegerter, Университет Цюриха, Швейцария

    Поступила в редакцию: 16 июня 2014 г.; Принято: 28 августа 2014 г .; Опубликовано: 21 октября 2014 г.

    Авторское право: © 2014 Rosenegger et al. Это статья с открытым доступом, распространяемая в соответствии с лицензией Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания оригинального автора и источника.

    Доступность данных: Авторы подтверждают, что все данные, лежащие в основе выводов, полностью доступны без ограничений. Все соответствующие данные содержатся в документе и файлах со вспомогательной информацией. Однако для просмотра 3D-моделей в приложении необходимо загрузить и установить бесплатное программное обеспечение Solidworks eDrawings (для Mac или ПК).

    Финансирование: Heart and Stroke Foundation of Canada, www.heartandstroke.ca, GG. Канадские институты исследований в области здравоохранения, www.cihr-irsc.gc.ca, для GG. Канадские исследовательские кафедры, www.chairs-chaires.gc.ca. Alberta Innovates Health Solutions, www.aihealthsolutions.ca, для DG и CT. Спонсоры не участвовали в разработке исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.

    Конкурирующие интересы: Авторы заявили об отсутствии конкурирующих интересов.

    Введение

    Двухфотонные лазерные сканирующие микроскопы имеют явные преимущества перед конфокальными и деконволюционными системами видимого света, поскольку они способны отображать глубоко в тканях с высоким рассеянием света, имеют встроенные оптические срезы и ограничивают повреждение клеток [1], [2]. ].Однако многие лаборатории не могут приобрести такие полезные микроскопы из-за различных препятствий, в том числе из-за отсутствия подробных ресурсов с открытым исходным кодом, которые позволяют неопытным пользователям выполнять самостоятельные работы. Кроме того, при наличии микроскопа большинство коммерческих и некоторых пользовательских платформ трудно адаптировать к быстро меняющимся технологиям.

    Изготовленные на заказ сканирующие микроскопы для двухфотонной визуализации существуют в лабораториях уже более двух десятилетий [3], [4], [5], [6], [7], [8].Несмотря на многочисленные разработки для повышения производительности [4], [9], [10], [11], [12], [13], [14], [15], [16], существует лишь несколько аппаратные платформы, на которых базируются пользовательские системы. Во-первых, двухфотонная система может быть создана путем модернизации коммерческого конфокального лазерного сканирующего микроскопа видимого диапазона [5], [17], [18], [19], [20]. Одним из преимуществ этого метода является то, что микроскоп уже имеет сканирующую головку, а также оптику и порты камеры для других типов световой микроскопии. Недостатками являются необходимость в дорогом конфокальном микроскопе, а конечный продукт после модернизации остается трудно адаптируемым.Во-вторых, специальный двухфотонный лазерный сканирующий микроскоп может быть построен путем сборки отдельных оптико-механических элементов на рельсах с использованием деталей от Thorlabs, Newport или Edmund Optics. Преимущество этой платформы в том, что она является экономичной, модульной и адаптируемой благодаря доступности и совместимости различных частей. Явными недостатками являются необходимая база знаний в области микроскопии, необходимая для первоначального проектирования, и отсутствие подробных ресурсов для построения высокопроизводительной системы (хотя см. [7]).Кроме того, в типичных оптико-механических системах отсутствует путь проходящего света для светлопольной микроскопии; тем самым ограничивая их применение. Наконец, пользовательские двухфотонные конструкции можно бесплатно получить на фермах Janelia Farms по адресу openwiki.janelia. org , на веб-сайте лабораторных технологий с открытым исходным кодом под названием labrigger.com и в лаборатории Parker в Калифорнийском университете в Ирвине по адресу http://parkerlab. био.uci.edu. Системы Janelia предназначены для в экспериментах vivo и представляют собой комбинацию оптико-механических деталей и изготовленных на заказ компонентов.Преимущества заключаются в том, что предоставляется подробный ресурс, а специальный дизайн делает эти системы высокопроизводительными для их предполагаемого использования. Недостатки заключаются в том, что общая конструкция требует множества деталей, изготовленных по индивидуальному заказу, что делает систему менее гибкой по сравнению с системами, основанными в основном на стандартных оптико-механических деталях. Таким образом, необходима комбинация этих различных платформ.

    Здесь мы предоставляем подробный аппаратный план с открытым исходным кодом для создания двухфотонного лазерного сканирующего микроскопа, который мы называем TIMAHC (произносится как tie-mac ), что означает двухфотонное изображение, которое является модульным, адаптируемым, высокопроизводительным и экономичным. эффективный.TIMAHC сочетает в себе многие сильные стороны различных описанных выше стратегий работы с нестандартными микроскопами: 1) TIMAHC почти полностью построен из готовых совместимых оптико-механических деталей от Thorlabs, к которым можно легко прикрепить и адаптировать высококачественные компоненты; 2) специально подобранное аппаратное обеспечение, наряду с простыми, но эффективными световыми путями, позволяет получить глубокое изображение (около 1 мм в ткани с высоким светорассеянием) и отличное соотношение сигнал/шум; 3) Чтобы восполнить пробелы в знаниях по сборке микроскопов, мы предоставляем цифровые 3D-модели (просматриваемые в свободном доступе в SolidWorks eDrawings), полный список деталей, инструкции по сборке, а также советы по тестированию и устранению неполадок; 4) В дополнение к аппаратному обеспечению, необходимому для сканирования, моторизации и двухканального сбора флуоресценции (подробно описанному ниже), TIMAHC имеет ФЭУ под столиком для обнаружения проходящего лазерного излучения и установку некогерентного освещения Келера для визуализации тканей; 5) TIMAHC оптимизирован для работы с остро изолированной тканью, но может быть адаптирован в течение нескольких минут для двухфотонной визуализации в vivo . Наконец, хотя этот ресурс предназначен для того, чтобы облегчить неопытному пользователю создание пользовательской системы двухфотонной визуализации, следует подчеркнуть, что такая попытка является важным мероприятием.

    Методы и результаты: Микроскоп сборки

    Нашей целью было создание высокоэффективного микроскопа для лазерного сканирования двухфотонной флуоресцентной визуализации, который можно было бы использовать как для в vitro , так и для в vivo приложениях, а также в сочетании с другими методологиями, такими как электрофизиология накладных зажимов под визуальным контролем.Основная цель состояла в том, чтобы сделать микроскоп как можно более гибким и доступным без необходимости дорогостоящей и трудоемкой обработки по индивидуальному заказу. Эти цели привели к созданию TIMAHC (рис. 1; модель S1 — сборка микроскопа, просмотренная с помощью SolidWorks eDrawings; таблица S1 — полные детали и прайс-лист).

    Рис. 1. Полная сборка TIMAHC.

    Указаны все подузлы, включая: подузел детектора, подузел сканирования, подузел конденсатора, подузел кинематического подузла, подузел координатно-двигательного столика, подузел предметного столика и подузел оптики стола.Красная линия указывает путь лазера Ti:Sapph. Показан вид в перспективе под углом (сверху), вид спереди (слева) и вид сбоку (справа) (см. Модель S1 — сборка микроскопа).

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g001

    Программное обеспечение управления и оборудование микроскопа

    TIMAHC предназначен для работы в паре с существующим и широко распространенным программным обеспечением управления с открытым исходным кодом. TIMAHC был тщательно протестирован с помощью ScanImage [21] ( openwiki.janelia.org ).ScanImage работает в среде Matlab и использует оборудование для управления и сбора данных от National Instruments. Список совместимого оборудования микроскопа приведен в документации ScanImage. Таким образом, TIMAHC включает в себя 5-мм гальванометрические сканеры (Cambridge Tech, номер по каталогу 6210H), детекторы GaAsP PMT (Hamamatsu, номер по каталогу h20770PA-40), ячейки Поккеля для быстрого управления мощностью лазера (Conoptics, номер по каталогу 350-80LA) и xyz. моторизация (Sutter, часть № MP-285; Dover Motion, часть № XYR-8080). TIMAHC также можно контролировать с помощью других программных платформ с открытым исходным кодом, таких как Helioscan [22] или MPScope [23], но эти платформы не тестировались.

    Детектор в сборе

    Подузел детектора (рис. 2) был разработан с коротким (13,5 см) фиксированной длиной пути сбора флуоресценции, измеряемым от задней апертуры линзы объектива до детекторов ФЭУ. Это было достигнуто за счет соединения всего узла детектора, включая линзу объектива, с шаговым двигателем z-моторизации (Sutter, номер по каталогу MP-285). Принцип конструкции заключался в том, чтобы свести к минимуму потери сигнала флуоресценции, вызванные невозможностью длинного пути сбора света для захвата рассеянных (небаллистических) фотонов [1], [24].Подузел детектора включает в себя два GaAsP-детектора ФЭУ (Hamamatsu, артикул № h20770PA-40), которые обладают большей чувствительностью, чем стандартные двухщелочные или многощелочные ФЭУ. Для направления испускаемого света мы использовали флуоресцентную оптику нестандартного размера и стандартную коллекционную оптику. Во-первых, первичное дихроичное зеркало (Chroma, артикул № 695cxxr) обеспечивает прохождение луча Ti:Sapph к образцу, отражая при этом эпифлуоресцентный свет с длиной волны короче 695 нм в сторону детекторов. После отражения близко расположенная 1-дюймовая собирающая линза (Thorlabs, номер по каталогу LA1708-A) фокусирует флуоресцентный свет на вторичное дихроичное зеркало.Мы используем зелено-красный сплиттер (Chroma, артикул T560LPXR), но при желании можно использовать альтернативный дихроик с соответствующими эмиссионными фильтрами. Затем разделенный свет проходит по отдельным путям либо к зеленому (Chroma, артикул № ET525/50m-2P), либо к оранжево-красному (ET605/70m-2P) эмиссионному фильтру, прежде чем пройти через окончательную асферическую линзу (Thorlabs, артикул № LA1805). -A), который фокусирует свет на GaAsP ФЭУ. TIMAHC позволяет использовать объективы с высокой числовой апертурой (NA) 0,8–1,1, погружаемые в воду. Мы тщательно протестировали использование 40X, NA1.0 (Zeiss, артикул № 441452990), который имеет крутой угол доступа и хорошее рабочее расстояние (2,5 мм) для патч-пипеток. Альтернативные линзы объектива могут использоваться по желанию, принимая во внимание максимальный диаметр луча, возможный на TIMAHC, и диаметр задней апертуры объектива (см. узел сканирования и обсуждение). Для каждой линзы объектива необходимо приобрести переходную муфту, чтобы соединить линзу с оптомеханикой (Thorlabs: резьбовые адаптеры для оптических компонентов). Для облегчения смены объективов можно добавить магнитные ошейники (не показаны на модели Thorlabs, номер детали CP90f).Наконец, моторизованный ползунок оси Z (Sutter, номер по каталогу MP-285-1z, высоконагруженный подшипник) обеспечивает перемещение на 1 дюйм до линзы объектива и может перемещаться с шагом 0,1 мкм для сбора данных по оси Z (модель S1 — детектор сборочный узел; см. рис. S1 для помощи при выравнивании установки извещателя).

    Рис. 2. Детектор в сборе.

    Слева ) Зеленым кружком обозначен блок детектора на TIMAHC. Верх ) Основные указанные детали, включая: ФЭУ GaAsP, флуоресцентные кубы, линзу объектива и z моторизованный слайдер. Внизу ) Поперечное сечение, показывающее внутреннюю оптику: первичный и вторичный дихроики, зеленый и красный эмиссионные фильтры, первичную собирающую линзу и асферические линзы ФЭУ (см. Детектор модели S1 в сборе).

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g002

    Сканирующий узел

    Сканирующий узел TIMAHC (рис. 3) включает в себя установленные гальванометрические сканеры (Cambridge Tech, номер по каталогу 6210H), которые направляют луч Ti:Sapph сначала в сканирующую линзу (Thorlabs, номер по каталогу LSM04-BB), а затем через дублетную ахроматическую линзу. тубусная линза (Thorlabs, AC508-200-B).Эти два элемента объектива отделены друг от друга суммой их фокусных расстояний (∼254 мм). Линзы вызывают расширение диаметра луча в 3,7 раза. Сканирующие зеркала на TIMAHC могут принимать пучок диаметром до 5 мм, а учитывая коэффициент расширения 3,7, указанный выше, самый большой пучок, достигающий задней апертуры объектива, составляет 18,5 мм. Это позволяет использовать объективы с малым увеличением и высокой числовой апертурой, которые имеют большую заднюю апертуру.

    Рис. 3. Сканирующий узел.

    Слева ) Зеленый кружок обозначает сканирующий узел на TIMAHC. Справа ) Основные части указанного сканирующего узла, включая: гальванометрические сканирующие зеркала, сканирующую линзу, тубусную линзу, подвижный куб, устройство смены линз и NIR-камеру. Внизу ) Различные положения скользящего зеркального куба показаны для выбора либо для двухфотонной визуализации, либо для изображения образца, переданного светодиодом/камерой (см. модель S1 — сканирующий узел).

    https://дои.org/10.1371/journal. pone.0110475.g003

    В сканирующем блоке TIMAHC есть ручной скользящий зеркальный куб и оборудование для установки чувствительной к ближней инфракрасной области (NIR) камеры для визуализации тканей (Dage MTI, часть #IR- 1000). Когда скользящее зеркало расположено на оптической оси, оно направляет проходящий свет от светодиода 940 нм под столиком на камеру. Когда скользящий куб перемещается от оптической оси, он позволяет лучу Ti:Sapph двигаться вниз по оптической оси микроскопа для двухфотонной флуоресцентной визуализации.Эта конфигурация была выбрана из-за того факта, что выходы светодиода и Ti:Sapph перекрываются в диапазоне длин волн NIR, что делает неподвижное (нескользящее) дихроичное зеркало несостоятельным. Между скользящим зеркальным кубом и камерой мы встроили систему магнитных воротников, чтобы можно было легко добавлять или удалять линзы с разным фокусным расстоянием с пути света, чтобы обеспечить различное увеличение передаваемого изображения без переключения объективов. Отсутствие линзы в магнитном ошейнике обеспечивает максимальное увеличение, в то время как линза с фокусным расстоянием ∼150 мм (Thorlabs, номер по каталогу AC254-150-B) обеспечивает полное поле зрения.По низкой цене пользователь может добавить линзы для желаемого увеличения (модель S1 — сканирующий узел).

    Конденсатор в сборе

    TIMAHC включает конденсор (рис. 4) с компонентами для освещения Келера, аналогичными тем, что используются во многих световых микроскопах. Имеется полевая диафрагма (Thorlabs, номер по каталогу SM1D12SS) для управления размером области просмотра и помощи при центрировании конденсора. Конденсорная диафрагма управляет числовой апертурой передаваемого изображения, а также яркостью и контрастностью.Конденсорная линза с высокой числовой апертурой (0,69) (Thorlabs, номер по каталогу C330TME-B) обеспечивает четкое передаваемое изображение образца вплоть до поля зрения примерно 100 микрон. Конденсорная линза установлена ​​внутри элемента z-перемещения (Thorlabs, номер детали SM1Z), который позволяет точно регулировать высоту, чтобы сделать плоскость изображения сопряженной с полевой диафрагмой. Дополнительная xy-скользящая пластина (Thorlabs, часть № SPT1) позволяет пользователю центрировать полевую диафрагму и, следовательно, конденсорную линзу относительно оптической оси для завершения установки Келера.TIMAHC использует светодиодный источник света NIR (940 нм) (Thorlabs, номер по каталогу M940L3), который может четко отображать толстые светорассеивающие образцы тканей, такие как остро изолированные срезы мозга. Кроме того, весь узел конденсора (вместе со столиком) можно легко опустить, чтобы увеличить пространство по оси Z под объективом для в экспериментах vivo . Если желательны большие препараты в vivo , узел конденсатора можно полностью снять, а за счет перехода на более короткие стойки столика можно получить гораздо больше места.Наконец, блок конденсора включает в себя расположенный под столиком ФЭУ, чувствительный к ближней ИК области (Thorlabs, номер по каталогу PMM02), для захвата передаваемого изображения ткани, генерируемого лучом Ti:Sapph. Возможно обнаружение передаваемых длин волн до 950 нм (Модель S1 – конденсаторный узел).

    Рис. 4. Конденсатор в сборе.

    Слева ) Зеленым кружком обозначен узел конденсатора на TIMAHC. Справа ) Показаны основные части конденсора, в том числе: линза конденсора, полевая линза, диафрагма конденсора, полевая диафрагма, точный транслятор оси z, разделительный куб 50/50, коллимационная линза, светодиод 940 нм и ФЭУ, чувствительный к БИК (см. Модель S1– узел конденсатора).

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g004

    Настольная оптика в сборе

    Для управления пучком Ti:Sapph и направления его в микроскоп требуется различная настольная оптика (рис. 5). Из лазерной головки луч Ti:Sapph сначала попадает на светоделитель 50/50 (Thorlabs, номер по каталогу CM1-BS015). Это вдвое меньше мощности луча, идущего на TIMAHC, потому что мощность обычно избыточна, или для разделения луча для подачи на другую экспериментальную установку. Следующим на пути луча является затвор формирования изображения (Thorlabs, номер по каталогу SH05), который открывается и закрывается в соответствии с началом и окончанием получения изображения. После затвора мы направляем луч на кинематическое зеркало, которое отклоняет луч на регулируемый угол (Thorlabs, часть № KM100). Кинематическое зеркало необходимо для точной настройки нисходящего пути луча вдоль стола через различную оптику. Далее идет ячейка Поккеля или электрооптический модулятор (Conoptics, номер по каталогу 350-80LA) для микросекундного быстрого управления мощностью лазерного луча.Ячейка Поккеля обеспечивает простую регулировку мощности лазера в режиме реального времени во время визуализации, но, что наиболее важно, она необходима для экспериментов, включающих быструю фотостимуляцию, таких как распаковка [25] или обесцвечивание, такие как FRAP [26]. Затем луч проходит через пару коллимирующих и расширяющих пучок дуплетно-ахроматических выпуклых линз (Thorlabs, номер по каталогу AC254-30-B и -60-B). Две линзы разделены суммой их фокусных расстояний (90 мм), а соотношение фокусных расстояний определяет степень расширения (2X).Эта пара линз необходима для создания соответствующего диаметра луча, принимаемого сканирующими зеркалами, и для точной настройки коллимации с помощью поступательной оси (Thorlabs, часть № PT1). Коллимация имеет решающее значение, когда луч попадает в заднюю апертуру объектива, чтобы линза работала должным образом. Диаметр луча также имеет решающее значение для заполнения задней апертуры объектива для реализации NA. Поскольку пучок имеет гауссовский профиль, это достигается, когда по крайней мере 1/ e 2 интенсивности луча равняется диаметру задней апертуры [1], [8].После расширения и коллимации луч входит в кинематический узел прицела. Обратите внимание, что дополнительные стандартные (некинематические) крепления для зеркал могут быть добавлены в любую точку траектории луча стола, когда требуется поворот на 90 градусов. Мы используем широкополосные диэлектрические зеркала на столе и в микроскопе (Thorlabs, номер по каталогу BB1-E03) (модель S1 — настольная оптика в сборе).

    Рис. 5. Подузел оптики стола.

    Слева ) Зеленым кружком обозначена сборка настольной оптики по отношению к TIMAHC. Верх ) Показаны основные компоненты подузла, включая: светоделитель 50/50, формирующий затвор, поглотители луча, кинематическое поворотное зеркало, ячейку Поккеля и штатив, фиксированное поворотное зеркало (зеркала), а также детали для расширения и коллимации луча. (две ахроматические дуплетные линзы и транслятор). Красная линия указывает путь лазера Ti:Sapph через оптическую систему стола (см. модель S1 — узел оптической системы стола).

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g005

    Кинематический узел и моторизация xy

    TIMAHC относительно уникален в том смысле, что сам микроскоп перемещается в направлениях x и y, а столик, на котором находится образец in vitro или целое животное, является стационарным (рис.6). Это выгодно для в установках vivo , в которых животное нельзя перемещать во время эксперимента. Основная оптическая направляющая TIMAHC крепится к моторизованной трансляционной платформе xy (Dover Motion, номер по каталогу XYR-8080). Это устройство может выдерживать высокую нагрузку (∼125 кг) и имеет большой диапазон движения в направлениях x и y (15 см по каждой оси). Примечательно, что устройство можно перемещать настолько сильно, что узел конденсатора может соприкасаться с предметным столиком для образца. Чтобы избежать этого, мы вкручиваем стальные стойки (Thorlabs, детали № TR2 и TR3) в оптический стол, окружающий XYR-8080, чтобы ограничить смещение xy.Зеркала наведения луча установлены на осях поступательного движения XYR-8080 таким образом, чтобы сохранять выравнивание луча при перемещении микроскопа. Первое из них — поворотное зеркало, установленное на передней панели XYR-8080, которое движется только в направлении x. Второе и третье зеркала наведения установлены в нижнем и верхнем кинематических узлах, которые перемещаются как в направлении x, так и в направлении y. Кинематические зеркала используются для точного направления луча Ti:Sapph на гальванометрические сканирующие зеркала и вниз по оптической оси (Модель S1 – кинематический подузел и подузел столика xy).

    Рис. 6. Кинематические зеркала и узлы двухкоординатного моторного столика.

    Слева ) Зеленые кружки обозначают расположение кинематических зеркал и xy моторных столиков на TIMAHC. Справа ) Показаны верхнее и нижнее кинематические зеркала, а также поворотное зеркало, которое направляет луч на сканирующие зеркала. Внизу ) показаны моторный столик xy и одноосное поворотное зеркало. Это позволяет TIMAHC двигаться в направлении xy, сохраняя при этом выравнивание луча (см. Модель S1 — кинематический узел).

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g006

    Компьютеры и блоки питания

    TIMAHC работает на обычном компьютере: четырехъядерный процессор с тактовой частотой 3,5 ГГц, 16 ГБ оперативной памяти, блок питания мощностью 500 Вт и жесткий диск на 2 ТБ. Мы используем монтируемый в стойку компьютер 4 U от Superlogics. Мы воздерживаемся от указания точной материнской платы и компонентов, поскольку компьютерные технологии быстро меняются. Пользователь должен убедиться, что используемая материнская плата имеет соответствующие слоты расширения для установки карт National Instruments, требуемых программной платформой с открытым исходным кодом (т.е. СканИзображение). В корпусе компьютера высотой 4 U достаточно места для большой платы управления/сбора данных (National Instruments, номер по каталогу PCI-6110). Кроме того, для некоторых компонентов микроскопа требуются линейные источники питания, включая сканирующие зеркала, предварительные усилители для сигналов ФЭУ на основе GaAsP, ФЭУ на основе GaAsP и ФЭУ под столиком. Для питания этих элементов мы используем универсальные линейные источники питания (Topward, № по каталогу 6303D и 3815D), за исключением специально разработанных источников питания для GaAsP-ФЭУ (Hamamatsu, № по каталогу C7169).Источники питания для ФЭУ также обеспечивают регулировку усиления.

    Сборка сцены

    Мы разработали специальный столик для образцов, который позволяет быстро и легко адаптироваться к изменяющимся потребностям эксперимента (рис. 7). На самом микроскопе необходимо выполнить только две нестандартные операции обработки (оба для сканирующего узла и держателя сканирующего зеркала). Для пользовательского столика для образцов требуются дополнительные три элемента: верхняя часть столика, дно столика и специальная ванна для тканей. Верхняя и нижняя части столика быстро регулируются по высоте и могут быть настроены для экспериментов vivo в течение нескольких минут.В верхней части сцены есть многочисленные резьбовые отверстия для крепления небольших ручных манипуляторов, встроенных нагревателей или других предметов, необходимых для эксперимента. Нижняя ступень представляет собой платформу для башен манипулятора. Как положение башен на нижней ступени, так и высоту башен можно легко отрегулировать для гибкости. Наконец, тканевая ванна была разработана для острых срезов головного мозга, но многие другие типы тканей возможны в пространственных пределах ванны. Имеются входной и выходной порты для буферного раствора, а также желоб для перелива и отверстие для подключения трубки. Последнее помогает избежать разливов раствора, которые могут повредить диафрагмы под столиком, светодиод и ФЭУ (модель S1 — сборочный узел столика).

    Рис. 7. Образец предметного столика в сборе.

    Слева ) Зеленым кружком обозначена сборка предметного столика по отношению к TIMAHC. Справа ) Показаны основные части сборочного узла сцены, включая верхнюю часть сцены, нижнюю часть сцены, ванночку для ткани, регулируемые по высоте ножки и башни манипулятора. Нижняя часть ) Показан крупный план ванны для тканей с выделением отсека для образца, входных/выходных каналов, желоба для перелива и дренажного отверстия для перелива (см. модель S1 — столик в сборе).

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g007

    Дополнительные расходы

    TIMAHC — это доступное и гибкое решение для сканирующего микроскопа (около 65 тысяч долларов США), однако типичный двухфотонный лазерный источник света стоит дорого. Наиболее распространенным является Ti:Sapph лазер, который представляет собой широко перестраиваемый (∼690–1040 нм), мощный (∼3 Вт) сверхбыстрый генератор (∼80 МГц). В зависимости от модели диапазон стоимости составляет 140–220 тысяч долларов США. Более доступные альтернативы с фиксированной длиной волны (например,грамм. при 780 или 1040 нм) и меньшей мощности, так как многие флуорофоры все еще могут возбуждаться. Мы используем Coherent Chameleon Ultra II (средняя мощность 4 Вт, длительность импульса 140 фс, 80 МГц, 670–1080 нм). Для лабораторий, которые не могут получить источник света для флуоресцентной визуализации, мы предоставляем 3D-модель с подробным описанием модифицированной версии TIMAHC, предназначенной для инфракрасной визуализации и фотостимуляции (модель S2 — IMEPS). Наконец, для любого сканирующего микроскопа требуется стол с виброизоляцией (5–15 тыс. долл. США). Требуемая степень виброизоляции (размер столешницы, сердцевина и демпфирование) должна быть оценена в месте, где будет размещаться система (проконсультируйтесь с поставщиком). Как минимум, для TIMAHC и Ti:Sapph-лазера потребуется площадь поверхности стола 4×4 фута и толщина не менее 8 дюймов (1,2 м×1,2 м×210 мм). Мы используем серию Newport S-2000 с размерами 4×8 футов и толщиной 8 дюймов (1,2 м×2,5 м×210 мм). Большая площадь поверхности используется для разделения луча Ti:Sapph и его подачи в другую систему визуализации на том же столе.

    Методы и результаты: характеристики микроскопа

    Технические характеристики микроскопа

    Используя стандарт разрешения ВВС США (Edmund Optics, номер по каталогу 58–198), мы определили размер поля зрения, отображаемого с помощью TIMAHC.Используя объектив Zeiss 40X NA1.0 с углом сканирования 15 градусов, мы измерили поле зрения 292 2 мкм (рис. 8а). Далее мы рассмотрели предел разрешения. Используя зеленые флуосферы диаметром 100 нм (Life Technologies, # F-8803) и визуализацию с длиной волны 770 нм, мы обнаружили, что TIMAHC имеет радиальное (xy) разрешение 0,440 мкм и осевое (z) разрешение 1,680 мкм (полная ширина полумакс. (FWHM) гауссовой подгонки, n = 8 бусин, рис. 8b). По сравнению с теоретическим пределом разрешения 0,385 мкм для радиального и 1.540 мкм по оси на этой длине волны, TIMAHC работает близко к пределу дифракции. Также не было значительной сферической аберрации, поскольку осевая функция рассеяния точек точно соответствовала ожидаемой гауссовской аппроксимации [27] (рис. 8b слева). Далее мы рассмотрели эффективность сбора данных в системе. При различной мощности возбуждающего света (усиление детектора 60%) мы визуализировали раствор SR-101 (100 мкМ, Sigma, # S7635) при 850 нм и регистрировали красную флуоресценцию в диапазоне 570–640 нм. Мы либо измерили сигнал флуоресценции, обнаруженный с помощью ФЭУ (рис.8c слева) или использовал фотодиодный измеритель мощности (Thorlabs, номер по каталогу S121C), который был непосредственно навинчен на блок детектора путем замены ФЭУ (возбуждение 1 мВт = 122 собранных мВт, 2 мВт = 178 мкВт, 5 мВт = 427 мкВт, 10 мВт = 834 мкВт, 20 мВт = 1630 мкВт, рис. 8в справа).

    Рис. 8. Характеристики микроскопа: поле зрения, разрешение и отношение сигнал/шум.

    A ) Поле зрения с использованием объектива Zeiss 40X NA1.0 при угле сканирования 15 градусов было определено путем визуализации цели ВВС США со стандартным разрешением.Темная полоса соответствует элементу 1 группы 1 на мишени шириной 250 микрон. Рассчитанная ширина поля составила 292 микрона. B ) Функции разброса точек, показывающие осевой (слева) и радиальный (справа) пределы разрешения, определенные путем визуализации 100-нм флуосферных шариков при возбуждении 770 нм. C ) Сбор флуоресценции, определяемый либо с помощью значений серого, генерируемых ФЭУ, на 12-битном изображении при усилении детектора 60% (слева), либо путем измерения мощности собранного света с помощью фотодиодного измерителя мощности (справа) при возбуждении красного красителя SR- 101 при разных мощностях возбуждения. D ) Средний сигнал красной флуоресценции и связанное с ним стандартное отклонение (слева) и отношение сигнал/шум: среднее значение/стандартное отклонение (справа) для SR-101, полученных при различных мощностях возбуждения. Данные сравнивают TIMAHC с тремя коммерческими двухфотонными системами: Olympus FV300, Nikon A1 и Leica SP5 II.

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g008

    Затем мы проанализировали отношение сигнал/шум на TIMAHC и сравнили его с тремя коммерческими системами двухфотонной визуализации: Olympus FV300, Nikon A1 и Leica. СП5 II.Для этого сохранялись длина волны возбуждения (850 нм), мощность возбуждения (5, 10 и 20 мВт), время пребывания пикселя или частота кадров (~3,2 мкс или 1 Гц), поле зрения (~150 мкм), пиксель плотность (512 2 ) и битовая глубина изображения (12 бит) постоянны между разными микроскопами. Во всех микроскопах в качестве источника света использовался лазер Coherent Chameleon, благодаря чему ширина импульса и частота повторения также сохранялись постоянными. Мы отметили объективную числовую апертуру (диапазон от 0,8 до 1,1) и изобразили раствор SR-101 (100 мкМ). Для данного изображения мы максимально приблизили самый яркий пиксель к точке насыщения (значение серого 4096), увеличив усиление детектора. Мы рассчитали средний сигнал по стандартному отклонению (SD) сигнала для каждого изображения. Мы обнаружили, что TIMAHC имеет характеристики сигнал-шум, которые превышают характеристики протестированных коммерческих микроскопов (S-to-N при 5, 10 и 20 мВт: TIMAHC obj 40x NA1.0 = 11,0, 13,1, 19,9; Olympus FV300 obj 20x NA1.0 = 8.1, 11.4, 18.5; Nikon A1 obj 25x NA1.1 = 5.1, 7.4, 12.8; Nikon A1 obj 16x NA0.8 = 4.3, 6.7, 11.0; Leica SP5 II = 1.7, 2.9, 5.7, рис. 8г). Эти данные демонстрируют преимущества простых путей возбуждения и сбора света, а также специально подобранного оборудования на TIMAHC.

    Чтобы подтвердить, что TIMAHC не подвержен хроматической аберрации или радиальному искажению, мы визуализировали однородный флуоресцентный стандарт с тонкими структурами, который мог широко возбуждаться и широко излучать ( Convallaria ). Чтобы проверить наличие хроматической аберрации, мы количественно определили наложение сигнала флуоресценции, используя выборку пикселей сверхнайквиста (пиксель = 0,125 мкм) между 1) излучением зеленого и красного излучения при возбуждении на фиксированной длине волны (850 нм) и 2) наложением сигнала между зеленое излучение при возбуждении на двух разных длинах волн (850 и 950 нм). Разница в FWHM тонких структур (зеленое и красное излучение: 0,46+/-0,08 пикселя или 0,057+/-0,01 мкм, n = 5, рис. 9a–c; возбуждение 850 против 950: 2,55+/-0,3 пикселя или 0,31+/-0,03 мкм, n = 5, рис. 9d–f) и разность координат xy пика этих структур (зеленое и красное излучение: 0,18+/−0,06 пикселя или 0,057 мкм, n = 5, рис. 9a–c, возбуждение 850 против 950: 0,90+/–0,28 пикселя или 0,11+/–0,03 мкм, n = 5, рис. 9d–f) было ниже предела разрешения. Чтобы протестировать радиальную дисторсию, мы переместили тонкую структуру (клеточную стенку) образца Convallaria по всему полю зрения на обычные физические расстояния (45 микрон, как определено калиброванной моторизацией) и сделали одиночные изображения на разных расстояниях. путешествовал.Мы обнаружили, что измерения линейных расстояний с ожидаемыми шагами в 45 микрон были точными до 45 микрон в пределах разрешения (ожидаемое = 45 мкм; измеренное = 45,07+/−0,05 мкм, n = 3, рис. 9g, h) и что кумулятивный измерения точно соответствовали в пределах 0,5 мкм от общего ожидаемого расстояния (ожидаемое = 270 мкм; измеренное = 270,43+/−0,25 мкм, n = 3, рис. 9g, h). Эти данные свидетельствуют о том, что индивидуальная оптическая система на TIMAHC не страдает от хроматической аберрации или радиального искажения.

    Рисунок 9.Характеристики микроскопа: тесты на хроматическую аберрацию и радиальное искажение.

    A ) Convallaria Образец, возбужденный при длине волны 850 нм, собирает зеленую и красную флуоресценцию (небольшие изображения слева) (каналы объединены справа). Линии представляют проанализированные профили. B ) Ширина зеленой и красной структуры (FWHM) и положение пика (подгонка по Гауссу) от линии, отмеченной звездочкой в ​​ A . C ) Сводка, показывающая расстояние в пикселях для зеленого и красного FWHM и разницу в расстоянии в пикселях между двумя пиками аппроксимации кривой. D ) Образец Convallaria , возбужденный при 850 нм и 950 нм, регистрирующий зеленую флуоресценцию (маленькие изображения слева) (изображения объединены справа). Линии представляют проанализированные профили. E ) Ширина структуры 850 и 950 (FWHM) и положение пика (подгонка по Гауссу), от линии, отмеченной звездочкой в ​​ D . F ) Сводка, показывающая расстояние в пикселях для FWHM 850 и 950 и разницу в расстоянии между пикселями между двумя пиками аппроксимации кривой. G ) Последовательные изображения в полном поле зрения (обрезанные прямоугольники), каждое из которых было получено после того, как столик был перемещен на 45 микрон в одном линейном направлении за счет моторизации.Красные стрелки указывают на конкретную функцию, чтобы показать перевод изображений. H ) Ожидаемое (пунктирная линия) и измеренное (символ) расстояние до мелкой детали при ее перемещении с шагом 45 микрон по всему полю зрения. Были проведены сегментарные (синий кружок) и кумулятивные (фиолетовые ромбы) измерения.

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g009

    Анализ биологических образцов под микроскопом

    Заявление об этике.

    Работа выполнена в строгом соответствии с рекомендациями комитета по уходу и использованию животных Университета Калгари.Все процедуры были одобрены этим комитетом и подробно описаны в институциональных протоколах M11002 и M11032. Были предприняты все усилия, чтобы устранить или свести к минимуму страдания. Хирургические процедуры использовали анестезию изофлураном на уровне подавления рефлекса (5% индукция, ~2% поддержание) и послеоперационный анальгетик бупренорфин (IP 0,1 мг/кг). В качестве конечных точек животных подвергали глубокой анестезии с использованием изофлюрана и обезглавливали с помощью гильотины для грызунов либо для подготовки ткани к экспериментам с острыми срезами головного мозга, либо после завершения визуализации.

    Мы исследовали способность TIMAHC обнаруживать слабые или яркие физиологические сигналы от остро изолированной ткани. Острые изолированные срезы головного мозга (полученные, как описано ранее [28]) были получены от трансгенных мышей Cre-Lox, у которых специфический для астроцитов промотор GLAST (JAX #012586) вызывал cre-зависимую экспрессию генетически кодируемого индикатора Ca2+ GCaMP3 (JAX #014538). (рис. 10а, б). Благодаря использованию гемизиготных мышей GCaMP3 и низкому сигналу GCaMP3 при уровнях Ca2+ в покое [29] мы наблюдали слабую базальную флуоресценцию в астроцитах при изображении при 940 нм (значения серого 13.3+/-0,5) по сравнению с SR-101 (серые значения 137,5+/-0,8). Тем не менее, TIMAHC зафиксировал спонтанные микродоменные переходные процессы Ca2+ в тонких отростках астроцитов с отличным соотношением сигнал/шум (ΔF/F = 142,1+/−16,6, исходное SD = 1,2, n = 8, рис. 10b, c). Чтобы изучить яркий сигнал, мы электрически вызывали транзиенты Ca2+ в астроцитах и ​​нейронах, используя концентрический биполярный стимулирующий электрод (FHC) и стимулятор Grass S88X. Это было выполнено на срезах мозга, взятых у крыс Sprague Dawley (p25). Срезы массово загружали Rhod-2/AM (10 мкМ, 0.1% ДМСО, 0,05% плюроновая кислота, инкубация 45 мин при 34°С). Rhod-2 — синтетический индикатор Ca2+ с большим динамическим диапазоном, более ярким сигналом покоя, но с близким Kd по сравнению с GCaMP3 [29]. Мы возбудили Rhod-2 на длине волны 850 нм и обнаружили, что краткая электрическая стимуляция (1 с, 50 ​​Гц при 1,6 В) афферентных аксонов вызывает большие транзиенты Ca2+ в нейронах неокортекса и астроцитах с небольшим фоновым шумом (ΔF/F = 213,4+/−39,5, исходный уровень). SD = 0,5, n = 6, рис. 10г, д).

    Рис. 10. Характеристики микроскопа: визуализация Ca2+ в остро изолированной ткани.

    A ) Двухфотонные флуоресцентные изображения срезов мозга, взятых у мышей GLAST-Cre LSL-GCaMP3. Экспрессия индикатора Ca2+ GCaMP3 в астроцитах показана колокализацией к SR-101. Дерево астроцитов обведено желтым. B ) Астроцит крупным планом показывает интересующие микродоменные области. C ) Необработанные сигналы Ca2+ из интересующих областей в B . Вставка показывает ΔF/F. D ) Нейроны и астроциты, загруженные Rhod-2/AM (серые), и артериолы, заполненные FITC-декстраном (зеленые) в неокортексе.Показаны интересующие регионы. E ) Необработанные сигналы Ca2+, обнаруженные в интересующих областях D, в ответ на 1-секундную электрическую стимуляцию афферентных волокон частотой 50 Гц. Вставка показывает ΔF/F.

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g010

    Чтобы проверить, насколько глубоко TIMAHC может отображать ткани с высоким светорассеянием, мы провели анализ зависимости глубины от мощности возбуждения в коре головного мозга мыши в vivo . Для равномерной концентрации флуорофора по всей глубине ткани в хвостовую вену вводили ФИТЦ-декстран (7 мг в 0.15 мл лактата Рингера) у мышей p35 C57Bl/6 с имплантированным черепным окном [30]. Используя объектив Nikon 16X 0,8NA, TIMAHC зафиксировал изображение кортикальной микрососудистой сети размером ∼725 2 мкм (рис. 11a, b). На поверхности мозга средняя мощность возбуждения составила 1,2 мВт на длине волны 780 нм. На глубине TIMAHC визуализировал до 960 мкм при средней мощности возбуждения 204,6 мВт на длине волны 780 нм до тех пор, пока фоновый сигнал почти не сравнялся с сигналом, исходящим от микроциркуляторного русла (значение капиллярного серого: 75. 89+/-0,74, значение серого фона: 65,33+/-1,0, соотношение 1,16, n = 5). На меньших глубинах TIMAHC также визуализировал клетки Ca2+ (астроциты, загруженные Rhod-2/AM) в большом поле зрения в пределах краниального окна (рис. 11c). С помощью объектива Zeiss 40X NA1.0 мелкие клеточные структуры, такие как небольшие проникающие артериолы, капилляры и отростки астроцитов, можно было четко визуализировать в узком поле зрения в vivo (рис. 11d).

    Рис. 11. Характеристики микроскопа: В vivo Глубина в зависимости от мощности и визуализация Ca2+ в широком и малом полях.

    A ) Демонстрация зависимости глубины изображения от мощности. Микрососуды заполнены FITC-декстраном. Четыре стековых изображения максимальной интенсивности толщиной 50 мкм, полученные на разной глубине неокортекса мыши с использованием объектива Nikon 16X 0,8NA, от поверхности мозга до 950 мкм. B ) Полный стек 3D-объемов с максимальной глубиной 960 мкм (с вычитанием фона). Слева показаны секции стека, показанные в A . Справа показана глубина изображения в зависимости от средней мощности возбуждения при 780 нм. C ) Широкоугольное изображение Ca2+ с объективом Nikon 16X NA0,8. Астроциты массово нагружали Rhod-2/AM. D ) Визуализация Ca2+ в ближнем поле. Показана одиночная проникающая артериола, капилляры (зеленый цвет), концевая ножка астроцита и отростки (серый цвет) с использованием объектива Zeiss 40X NA1.0.

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g011

    Затем мы протестировали использование TIMAHC для визуально контролируемого накладного зажима. Либо система светодиодов и камер использовалась для некогерентного патчирования NIR (рис.12a) или клетки были нацелены на двухфотонный патч-клэмп [31] (Fig. 12b). Мы использовали стандартный внутренний раствор K-глюконата, содержащий 100 мкМ гидразида натрия Alexa 488 (Life Technologies, A-10436), используя методы, описанные ранее [28]. ФЭУ нижнего столика, который собирает передаваемый сигнал от ткани, использовался для облегчения двухфотонного наведения, позволяя визуализировать пипетку с пластырем и саму клетку-мишень (рис. 12b). Это позволяет зафиксировать немеченую клетку или флуоресцирующую клетку без необходимости флуоресцентной молекулы в пипетке для заплаты (но показано здесь с красителем, чтобы продемонстрировать успешную заплату; рис.12б справа). После цельной клетки могут быть выполнены записи отдельных клеток и исследования флуоресценции (рис. 12c).

    Рис. 12. Работа микроскопа: накладной зажим с визуальным контролем.

    A ) Изображение, переданное с помощью NIR-светодиода и камеры остро изолированных срезов неокортекса головного мозга (слева) и гиппокампа (справа). B ) Передаваемое изображение ткани, созданное лучом Ti:Sapph, полученное на ФЭУ под предметным столиком. Патч-пипетку и клетки можно визуализировать (слева).Успешный патч показан с заполнением Alexa 488 (справа). C ) Пэтч-кламп цельноклеточного коркового пирамидного нейрона (слева) и астроцита (справа), каждый из которых подвергался диализу со стандартным внутренним раствором K-глюконата, содержащим 100 мкМ Alexa-488 (зеленый). Изображения отображаются в виде максимальной проекции для захвата клеток и пипетки.

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g012

    ФЭУ под столиком предлагает несколько других преимуществ при стандартном захвате флуоресцентного сигнала.Во-первых, небольшие синхронные флуктуации сигнала были обнаружены при сравнении флуоресценции и сбора в проходящем свете (корреляция r = 0,89, стандартное отклонение зеленого излучения: 0,91+/−0,10, стандартное отклонение пропускаемого сигнала: 0,85+/−0,17, n = 5, рис. 13а– в). Этот коррелированный шум не был результатом электронного шума, поскольку сигналы, генерируемые батареей на 1,5 В, питающей каждый канал, не имели корреляции (r = −0,015+/−0,36, n = 3) и были близки к нулю SD, и, таким образом, вероятно, результате небольших колебаний мощности возбуждения. Примечательно, что соотношение зеленой флуоресценции и переданного сигнала может значительно уменьшить базовый шум (отношение зеленый / транс: 0, 35 +/- 0, 07, n   =   5, p   =   0,002 по сравнению с SD зеленой флуоресценции, рис. 13c). Во-вторых, в изолированной ткани в течение более длительного периода времени мы заметили другую корреляцию, проявляющуюся в виде небольших волнистостей, возникающих как при флуоресценции (астроциты, загруженные SR-101), так и при пропускании (рис. 13d, e). Чтобы изучить эту более медленную связь, мы объединили данные за 5 с, чтобы удалить синхронный шум, наблюдаемый при 1 Гц выше (рис.13а–в). После бинирования два канала по-прежнему имели высокую корреляцию (r = 0,86+/−0,06, n = 5, вставка на рис. 13f), и использование соотношения уменьшило волнистость сигнала (SR-101 SD = 2,65+/−0,5, отношение СР-101/Транс SD = 1,73+/−0,5, p = 0,004, рис. 13е). Эти данные показывают, что передаваемый канал можно использовать для обнаружения небольших оптических изменений в ткани, которые могут влиять на флуоресценцию. Это может помочь экспериментатору понять, является ли небольшое изменение, например, показателя Ca2+ результатом изменения Ca2+ или результатом изменения оптических свойств ткани.В-третьих, визуализируя ткань с помощью коэффициента пропускания, можно зафиксировать грубые структуры, морфологию/площадь клеток или, как показано здесь, изменения диаметра кровеносных сосудов (рис. 13g). Наконец, ФЭУ на нижней стадии на TIMAHC можно использовать для изучения внутренних оптических сигналов от ткани, таких как сигналы, генерируемые увеличением синаптической активности [32] (рис. 13h) или патологическими событиями, такими как распространяющаяся депрессия [33] (рис. 13и).

    Рис. 13. Характеристики микроскопа: канал передачи под предметным столиком.

    A ) Просвечиваемое изображение (слева) и зеленая флуоресценция (справа) стандартного образца Convallaria . B ) Кривые, показывающие быстрый коррелированный шум между зеленым и передаваемым каналом. Соотношение двух сигналов устраняет синхронный шум и уменьшает SD в сигнале. C ) Сводная гистограмма. На вставке показана корреляция между зеленым и передаваемым сигналом r = 0,89. D ) Кривые, показывающие медленные коррелированные колебания между красным (SR-101) и передающим каналом в изолированной ткани, полученные из области, показанной на E .Соотношение SR-101/Trans в значительной степени устраняет волнистость и уменьшает стандартное отклонение для 5-секундных группированных данных, обобщенных в F . На вставке показана корреляция между красным и передаваемым сигналом для 5-секундных группированных данных (r = 0,97). G ) Передаваемые изображения небольшой артериолы до (слева) и после вазоконстрикции (справа), вызванной агонистом рецептора тромбоксана U46619 (200 нМ). Внутренние оптические сигналы (IOS), захваченные ФЭУ на нижней стадии в ответ на синаптическую активность ( H ) и волну распространяющейся депрессии (SD) ( I ).

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.g013

    Альтернативные сборки

    TIMAHC можно легко адаптировать, расширить или упростить. Мы предлагаем четыре дополнительные модели в качестве примеров модификаций TIMAHC: 1) сборка с расширенной оптикой стола и кинематической сборкой, так что TIMAHC может принимать два лазерных луча; 2) уменьшенная сборка для в исследованиях vivo , в которой нет NIR-камеры или подсценической оптики; 3) включение быстродействующего затвора в сборочный узел детектора для блокировки ФЭУ во время комбинированных экспериментов по двухфотонной визуализации и фотостимуляции видимым светом, когда флуорофор имеет спектры излучения, перекрывающиеся со светом возбуждения, и 4) сборка микроскопа. позвоните в IMEPS, что означает «Инфракрасный микроскоп для электрофизиологии и фотостимуляции».IMEPS не предназначен для двухфотонной флуоресцентной визуализации и, следовательно, не нуждается в соединении с дорогостоящим Ti:Sapph лазером. Однако можно получить переданное изображение ткани с помощью простого диодного лазера NIR (Thorlabs, номер по каталогу CPS192), гальванометрических сканеров и ФЭУ под столиком. Гальванометрические сканеры также можно использовать для выбора областей для фотоактивации видимой лазерной линией, которая будет контролироваться затвором и/или ячейкой Поккеля. Кроме того, заменив вышеописанные ФЭУ светодиодами, можно было бы осуществлять точечную фотостимуляцию в центре поля зрения при различных размерах светящихся точек.Обратите внимание, что эти альтернативные сборки не были полностью протестированы, и подробные детали и прайс-листы не предоставляются (модель S2).

    Изображение и статистический анализ

    Весь анализ изображений был выполнен с использованием программы обработки с открытым исходным кодом ImageJ. Статистический анализ, который включал t-тесты (парные и непарные по мере необходимости), линейные регрессии и корреляции, выполняли с использованием программного обеспечения Graphpad Prism 5.

    Осторожно

    TIMAHC представлен с открытым путем луча, чтобы лучше показать сборку, но путь света должен быть закрыт для повышения безопасности с использованием линзовых трубок и пластиковых трубок (Thorlabs, детали № SM1L XX, SM2L XX и SC1L24, SC2L24) .Кроме того, хотя этот ресурс предназначен для облегчения неопытного пользователя в построении системы двухфотонной визуализации, следует подчеркнуть, что такая попытка является важным мероприятием. Ответственность за тестирование, устранение неполадок и исправление лежит на пользователе. Несмотря на то, что мы пытались дать подробные рекомендации в разделах по сборке и устранению неполадок в дополнительной информации (Приложение S1), наши усилия на этом фронте не являются исчерпывающими.

    Обсуждение

    В нашей лаборатории TIMAHC зарекомендовал себя как надежный исследовательский инструмент по доступной цене.TIMAHC: 1) работает близко к теоретическому пределу дифракции, 2) имеет отношение сигнал/шум, превышающее три коммерческих двухфотонных микроскопа, 3) может отображать изображения на глубине около 1 мм в мозге мыши, 4) не ухудшается хроматическая и сферическая аберрация или радиальное искажение, 5) способно отображать изображение в широком поле с использованием объективов с низким увеличением, но с высокой числовой апертурой, 6) улавливает устойчивые сигналы Ca2+ из клеточных и субклеточных компартментов и 7) может быть легко адаптировано.

    Одной из наиболее важных характеристик флуоресцентного микроскопа является отношение сигнал/шум.Мы проверили это при трех различных мощностях возбуждения, сохраняя при этом постоянное максимальное значение серого пикселя, чтобы обеспечить контраст между различными системами визуализации. TIMAHC продемонстрировал отличное соотношение сигнал/шум, однако в представленном сравнении важно уточнить, что существуют переменные, которые нельзя поддерживать постоянными между различными двухфотонными системами, такими как модель объектива, модель ФЭУ (хотя Nikon A1 также имел GaAsP ФЭУ), несколько оптических элементов и сложность пути возбуждения и сбора света.Однако сравнение номинальной стоимости ценно, поскольку приравнивание всех или большинства переменных между системами сводит на нет тест. Именно общий дизайн и детали, выбранные для TIMAHC, представляли интерес для сравнения с готовыми коммерческими системами, чтобы оценить различия в производительности.

    Несмотря на специальную оптическую ось на TIMAHC, состоящую из обычной сканирующей линзы и тубусной линзы, которые соединяются с различными коммерческими объективами, мы измерили разрешение, близкое к теоретическому пределу, определяемому дифракцией света. Мы также обнаружили, что система не имеет обнаруживаемых хроматических и сферических аберраций или радиальных искажений, таких как подушкообразная или бочкообразная деформация поля зрения. Отчасти это было ожидаемо, потому что большая часть характеристик изображения микроскопа зависит от числовой апертуры линзы объектива и поправок, сделанных в линзе объектива. Кроме того, сканирующая линза корректирует внеосевой свет, генерируемый сканирующими зеркалами, чтобы предотвратить деформацию плоскости фокусировки. Сканирующая линза, выбранная для TIMAHC, была разработана для имплантации в специальные установки для визуализации (Thorlabs, номер по каталогу LSM04-BB).Коммерческие тубусные линзы обычно оптимизируют парфокальность (для сохранения одной и той же плоскости изображения) в сочетании с их коммерческими целями (см. раздел «Соображения и ограничения»). Мы выбрали трубчатую линзу с большим фокусным расстоянием, чтобы свести к минимуму системные артефакты, вызванные внеосевыми лучами, а также потому, что большее фокусное расстояние повышает гибкость при добавлении оптики на световой путь.

    TIMAHC визуализировал впечатляющие 960 мкм глубины коры головного мозга мыши (p35). Этот тип ткани и возраст имеют константу длины светорассеяния около 100 мкм [16], а достигаемая глубина изображения близка к теоретическому пределу для этой длины волны (780 нм) [15].Таким образом, должна быть возможна еще более глубокая визуализация с использованием более длинных длин волн для изображения красных флуоресцентных молекул, если мощность возбуждения не ограничивается [14]. Отличное соотношение сигнал-шум, геометрия собирающего светового тракта и использование объектива с малым увеличением, но с высокой числовой апертурой, вероятно, способствовали получению изображения с глубиной, близкой к 1 мм [16].

    Основа конструкции TIMAHC, в которой различные узлы скользят по основной оптической направляющей, обеспечивает большую гибкость в отношении предельной высоты линзы объектива.Например, для в визуализации vivo критично только относительное положение между верхними узлами кинематики, сканирования и детектора, а не их абсолютная высота над оптическим столом. Все три подузла можно перемещать вверх или вниз по рельсу вместе, чтобы изменить распределение пространства по оси z под объективом для различных экспериментальных препаратов. Кроме того, узел конденсатора можно легко снять с направляющей, а столик для образцов можно либо отрегулировать по высоте, либо убрать его аспекты.Таким образом, практически любой исследовательский препарат можно было визуализировать за относительно короткий промежуток времени, например, кроликов, кошек или даже обезьян [34]. Даже препарат бодрствующей мыши, при котором животное выполняет бег на беговой дорожке [35], требует большого пространства под объективом. Нам неизвестно ни о каком коммерческом двухфотонном микроскопе, который мог бы вносить столь существенные изменения в геометрию, а также с относительной легкостью восстанавливать изображение образца in vitro с использованием оптики под предметным столиком.

    Мы предоставляем четыре дополнительные модели 3D CAD с подробным описанием вероятных адаптаций к TIMAHC, но возможны и многие другие модификации. Во-первых, TIMAHC можно адаптировать для визуализации генерации второй гармоники. В этом сценарии мы рекомендуем переконфигурировать подсборку оптики стола и подсборку конденсора в соответствии с деталями и протоколами, описанными в другом месте [36]. Во-вторых, Ti:Sapph-лазеры могут включать или дополняться оптическим параметрическим генератором для более длинных волн и, следовательно, более глубокого изображения тканей [14].Хотя TIMAHC может выполнять визуализацию с большей длиной волны, его электрооптический модулятор и оптика оптимизированы для выхода Ti:Sapph в диапазоне 700–1100 нм. Таким образом, если волны за пределами этого диапазона будут основным подходом, мы рекомендуем выбрать более подходящую ячейку Поккеля (например, серию кристаллов LTA от Conoptics), а также зеркала и линзы с покрытиями, которые оптимизируют отражательную способность и пропускание (серебро). зеркала или покрытие Thorlabs C). Также следует убедиться, что интересующий объектив был протестирован на хорошее пропускание в расширенном диапазоне длин волн NIR. В-третьих, TIMAHC можно адаптировать для визуализации с помощью ультракоротких лазерных импульсов, чтобы можно было использовать широкую полосу спектра для одновременного возбуждения нескольких флуорофоров. Поскольку сверхкороткие импульсы сильно подвержены дисперсии, следует приобрести зеркала для компенсации дисперсии (Thorlabs, номер по каталогу DCMP175) и монтажное оборудование, а также, возможно, приборы для измерения ширины импульса.

    Состоящий из оптико-механических частей и обладающий открытой архитектурой, TIMAHC может использоваться в качестве учебного пособия для продвинутой микроскопии.Например, несколько студентов, работающих с инструктором, могут построить TIMAHC как семестровый курс. Сочетание сборки, испытаний, измерений и устранения неполадок с лекциями по темам может научить многим различным принципам работы с микроскопом. Это включает в себя, но не ограничивается: основную оптику, источники света, оптический путь, сканирование, объективы, обнаружение и многие другие подробности о модальностях визуализации. Это будет экспериментальное обучение на самом высоком уровне.

    Соображения и ограничения

    Существует ряд вопросов для обсуждения, которые любой потенциальный человек должен рассмотреть перед использованием этого ресурса.Во-первых, TIMAHC включает в себя 5-мм сканирующие зеркала от Cambridge Tech, и, учитывая расширение луча, обеспечиваемое сканирующей линзой и трубчатой ​​линзой (3,7x), максимальный диаметр луча на задней апертуре линзы объектива составляет 18,5 мм. Таким образом, TIMAHC оптимизирован для использования объективов с задней апертурой меньше этого диаметра. Если желательны большие или меньшие максимальные диаметры луча или если требуются другие максимальные скорости сканирования, можно изменить/модифицировать несколько элементов в сканирующем подузле. Во-первых, использование сканирующих зеркал большего размера позволит увеличить диаметр луча, но снизит максимальную скорость сканирования.И наоборот, зеркала меньшего размера уменьшают максимальный диаметр луча, но обеспечивают более быстрое сканирование. Кроме того, две изготовленные на заказ детали в сканирующем подузле TIMAHC потребуют модификации, чтобы соответствовать другому креплению сканирующего зеркала, если сканирующие зеркала будут заменены. Изменение фокусного расстояния (расстояний) и, следовательно, коэффициента расширения сканирующей линзы и/или тубусной линзы также может изменить диаметр луча. Обратите внимание, что соотношение расстояний между сканирующими зеркалами, сканирующей линзой, тубусной линзой и задней апертурой объектива необходимо изменить, чтобы они соответствовали новому фокусному расстоянию (ям) [7], [8], и, таким образом, расстояния в представленной дополнительной модели не изменятся. дольше применять.

    В качестве альтернативы можно сохранить конфигурацию TIMAHC и учитывать недостатки задних отверстий, превышающих 18,5 мм. Во-первых, у объектива не будет ограничений по дифракции [1], [8]. Это приемлемо, если интересует большее поле зрения, а не субмикронный масштаб. Например, мы регулярно используем объектив Nikon 16X 0,8NA (задняя апертура 20 мм) для картирования микрососудов головного мозга и локализации пространственно распределенных сигналов Ca2+ в vivo с использованием субпиксельной выборки Найквиста (1024 2 ). На самом деле, выборка Найквиста с дифракционно-ограниченной линзой с высокой числовой апертурой и малым увеличением требует очень высокой плотности пикселей и такого медленного получения кадров, что этот подход может быть непрактичным, особенно с гальванометрическими сканерами. Во-вторых, объективы с большой задней апертурой могут привести к небольшим потерям сигнала, поскольку мы используем 1-дюймовую собирающую линзу в качестве первой линзы в сборке детектора после первичной дихроичной. Это связано с тем, что испускаемая флуоресценция рассеянных небаллистических фотонов, выходящих из большой задней апертуры, может не попасть в 1-дюймовую собирающую линзу [1], [24].Однако фиксированный короткий путь сбора TIMAHC предназначен для минимизации потерь сигнала. Полученная глубина изображения (960 мкм) предполагает, что 1-дюймовая коллекторная линза не является серьезным ограничением. Наконец, парфокальное расстояние между разными объективами (например, между объективами с высокой числовой апертурой и резко различающимися увеличениями) может быть настолько значительным, что диапазон в 1 дюйм на ползунке z не позволяет использовать обе линзы на данной высоте предметного столика. Либо предметный столик и высоту конденсора можно сконфигурировать и оптимизировать для конкретного объектива, либо можно добавить удлинительные кольца (Thorlabs, артикул № SM1L XX ) к более коротким объективам для выравнивания парфокального расстояния.

    Для сканирующего оборудования TIMAHC мы рекомендуем определенные максимальные скорости двунаправленного сканирования при определенных коэффициентах масштабирования (или, скорее, при определенных углах сканирования), чтобы не превышать возможности системы. Тестируя устойчивую стабильность сканирования на различных скоростях, мы обнаружили, что стабильное изображение достигается, когда не превышаются следующие значения: масштабирование 1 при 2 мс/строку, масштабирование 1,3 при 1 мс/строку, масштабирование 3,5 при 0,5 мс/строку, масштабирование 10 при 0,25. мс/строка (данные не показаны). Все эти настройки удерживают силу тока, потребляемую платой сервосканирования, ниже нуля.75 ампер на канал, что позволяет избежать искажений при сканировании.

    Мы используем стандартный ахроматический трубчатый объектив с большим фокусным расстоянием (200 мм) (Thorlabs, номер по каталогу AC508-200-B). При использовании коммерческого объектива, не предназначенного для тубуса, передаваемое изображение, генерируемое светодиодом под столиком, не будет парфокальным с двухфотонным изображением. При использовании погружного объектива 40X 1.0NA от Zeiss мы обнаружили, что эти две плоскости изображения смещены друг относительно друга примерно на 150 микрон.Это легко преодолеть, перемещая линзу объектива на это расстояние по оси z при переключении со светодиодного изображения в проходящем свете на двухфотонное изображение или наоборот. Важно отметить, что в TIMAHC используется универсальная тубусная линза, поэтому мы можем выбрать лучший коммерческий объектив, доступный для конкретной экспериментальной задачи, и нам не нужно оставаться верным конкретному бренду.

    Количество флуоресцентных детекторов и связанных с ними оптических/аппаратных средств можно увеличить, но необходимо учитывать вес ползунка моторизации z. Для большего количества каналов флуоресценции рекомендуется другая конструкция, в которой блок детектора крепится к основной оптической направляющей (с сохранением оптической оси), а не непосредственно к приводу z. При последовательном добавлении флуоресцентных детекторов к сборке фокусные расстояния линз в сборочной сборке детектора должны измениться, чтобы должным образом сфокусировать излучаемую флуоресценцию на каждом ФЭУ [7].

    При использовании этого ресурса необходимо учитывать соотношение стоимости и времени.Хотя экономия затрат на TIMAHC может легко превысить 150 тысяч долларов США для сопоставимого двухфотонного микроскопа, требуется значительное время для сборки и, в некоторых случаях, устранения неполадок. Например, одному-двум опытным людям (непосредственно или технически склонным) потребуется две-три недели, чтобы создать оптимизированную систему. При небольшом опыте одному-двум людям может понадобиться пара месяцев. Кроме того, трудно предсказать, какие действия по устранению неполадок потребуются, что может затянуть процесс. Мы представили как можно больше потенциальных проблем и решений в дополнительных материалах, чтобы ускорить процесс окончательной доработки (Приложение S1). Также необходимо учитывать время выполнения определенных деталей для TIMAHC. Ti:Sapph-лазер, флуоресцентная оптика и GaAsP-ФЭУ имеют самое длительное время разработки (до нескольких месяцев), но это сравнимо со временем разработки полных коммерческих систем.

    Дополнительная информация

    Рисунок S1.

    Вспомогательное приспособление для выравнивания монтажа узла извещателя. Крупный план детекторного узла (ФЭУ и объектив сняты) и нижней части сканирующего узла. Детали, окрашенные в синий цвет (CP02, ER6 x 2, LCP02), предназначены для облегчения выравнивания при монтаже. Чтобы добавить средство для выравнивания, тубусную линзу следует снять со сканирующего узла. Нижняя часть пластины CP02 должна касаться верхней части первичного дихроичного куба так, чтобы задняя апертура объектива находилась примерно в 200 мм от середины тубусной линзы. Важно отметить, что это положение соответствует тому, что ползунок z опущен почти до конца (положение визуализации, а не когда линза объектива поднята для загрузки ткани или доступа пипетки).Инструмент необходим для установки узла детектора на уровне оптической оси и под нужным углом, чтобы создать пространство для доступа микроманипулятора к ванне для тканей.

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.s001

    (TIF)

    Модель S1.

    Предоставляется трехмерная CAD-модель всего микроскопа, включая отдельные модели для каждого из узлов, составляющих полный узел. Можно визуализировать точное положение и ориентацию каждой детали в сборке.Модели просматриваются в SolidWorks eDrawings (бесплатное программное обеспечение для загрузки в Интернете) или непосредственно в SolidWorks.

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.s004

    (ZIP)

    Модель S2.

    Четыре альтернативные сборки или модификации TIMAHC предоставляются в виде 3D-моделей CAD. К ним относятся 1) упрощенная модель только для в приложениях vivo , 2) модель, в которой TIMAHC может принимать два луча, например, для экспериментов по визуализации и стимуляции видимой линии, 3) альтернативный блок детектора с быстрым затвором для защиты ФЭУ во время фотоактивации видимым светом и 4) вызов сборки микроскопа IMEPS, который не используется для флуоресцентной визуализации, а вместо этого используется для инфракрасной микроскопии в сочетании с электрофизиологией и фотостимуляцией.Каждая альтернативная сборка содержит полную модель, а также отдельные модели для каждого узла, содержащегося в полной сборке. Модели просматриваются в SolidWorks eDrawings (бесплатное программное обеспечение для загрузки в Интернете) или непосредственно в SolidWorks.

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110475.s005

    (ZIP)

    Благодарности

    Мы благодарим доктора Брайана Маквикара из Университета Британской Колумбии за поддержку первоначальной разработки TIMAHC в его лаборатории. Спасибо д-ру Роджеру Томпсону, визуализацию которого провел Николас Вейлингер, за возможность сбора данных отношения сигнал-шум на многофотонном микроскопе Leica SP5 II. Спасибо Крейгу Бридо из лаборатории доктора Питера Стайса за помощь в сборе данных отношения сигнал-шум на многофотонном микроскопе Nikon A1. Спасибо докторам. Пине Коларуссо и Катажине Стивенс за помощь в сборе данных отношения сигнал-шум на их многофотонной системе Olympus FV300. Мы также признательны разработчикам и распространителям программного обеспечения ScanImage с открытым исходным кодом: лаборатории Карела Свободы в Janelia Farms и лаборатории Гордона Шеперда в Northwestern, а также предыдущим первоначальным разработчикам в лабораториях Cold Spring Harbour Laboratories.Мы также благодарим Виджая Айера из Janelia Farms, ключевого разработчика и контактного лица по вопросам программного обеспечения.

    Авторские взносы

    Задумал и разработал эксперименты: DR CT JL NZ GG. Выполнены опыты: ДР КТ ГГ. Проанализированы данные: ДР КТ ГГ. В написании рукописи участвовали: DR CT JL NZ GG.

    Каталожные номера

    1. 1. Helmchen F, Denk W (2005)Двухфотонная микроскопия глубоких тканей. Nat Methods 2: 932–940
    2. 2. So PT, Dong CY, Masters BR, Berland KM (2000) Двухфотонная флуоресцентная микроскопия возбуждения.Annu Rev Biomed Eng 2: 399–429
    3. 3. Denk W, Strickler JH, Webb WW (1990)Двухфотонная лазерная сканирующая флуоресцентная микроскопия. Наука 248: 73–76.
    4. 4. Soeller C, Cannell MB (1996)Конструирование двухфотонного микроскопа и оптимизация длительности импульса освещения. Арка Пфлюгера 432: 555–561.
    5. 5. Konig K, Simon U, Halbhuber KJ (1996) Трехмерная двухфотонная флуоресцентная микроскопия живых клеток с использованием модифицированного конфокального лазерного сканирующего микроскопа.Cell Mol Biol (Noisy-le-grand) 42: 1181–1194.
    6. 6. Mainen ZF, Maletic-Savatic M, Shi SH, Hayashi Y, Malinow R, et al. (1999) Двухфотонная визуализация в срезах живого мозга. Методы 18: 231–9–181.
    7. 7. Цай П.С., Нисимура Н., Йодер Э.Дж., Уайт А., Дольник Э. и др. (2002) Принципы, дизайн и конструкция двухфотонного сканирующего микроскопа для исследований in vitro и in vivo. В методах оптической визуализации функций мозга in vivo, Фростиг Р. (2002). КПР Пресс.113–171.
    8. 8. Зипфель В.Р., Уильямс Р.М., Уэбб В.В. (2003) Нелинейная магия: многофотонная микроскопия в биологических науках. Nat Biotechnol 21: 1369–1377
    9. 9. Ким К.Х., Бюлер С., Со П.Т. (1999) Высокоскоростной двухфотонный сканирующий микроскоп. Заявка Опция 38: 6004–6009.
    10. 10. Nguyen QT, Callamaras N, Hsieh C, Parker I (2001)Конструирование двухфотонного микроскопа для визуализации Ca(2+) со скоростью видео. Клеточный кальций 30: 383–393.
    11. 11. Jiang R, Zhou Z, Lv X, Zeng S (2012)Широкополосные акустооптические дефлекторы для двухфотонного микроскопа с большим полем зрения. Rev Sci Instrum 83: 043709
    12. 12. Tan YP, Llano I, Hopt A, Wurriehausen F, Neher E (1999) Быстрое сканирование и эффективное фотодетектирование в простом двухфотонном микроскопе. J Neurosci Methods 92: 123–135.
    13. 13. Дрисколл Дж. Д., Ших А. И., Айенгар С., Филд Дж. Дж., Уайт Г. А. и др. (2011) Подсчет фотонов, цензурные поправки и визуализация времени жизни для улучшения обнаружения в двухфотонной микроскопии. Дж. Нейрофизиол 105: 3106–3113
    14. 14. Кобат Д., Хортон Н.Г., Сюй С. (2011)Двухфотонная микроскопия in vivo до 1.Глубина 6 мм в коре головного мозга мыши. J Biomed Opt 16: 106014
    15. 15. Theer P, Hasan MT, Denk W (2003)Двухфотонная визуализация на глубину 1000 микрон в живом мозге с использованием регенеративного усилителя Ti:Al2O3. Opt Lett 28: 1022–1024.
    16. 16. Oheim M, Beaurepaire E, Chaigneau E, Mertz J, Charpak S (2001)Двухфотонная микроскопия в тканях головного мозга: параметры, влияющие на глубину изображения. J Neurosci Methods 111: 29–37.
    17. 17. Николенко В., Юсте Р. (2013) Как построить двухфотонный микроскоп с конфокальной сканирующей головкой.Протокол Cold Spring Harb 2013.
    18. 18. Диаспро А., Коросу М., Рамойно П., Робелло М. (1999) Адаптация системы компактного конфокального микроскопа к архитектуре флуоресцентной визуализации с двухфотонным возбуждением. Microsc Res Tech 47: 196–205
    19. 19. Wier WG, Balke CW, Michael JA, Mauban JR (2000) Изготовленный на заказ конфокальный и двухфотонный цифровой лазерный сканирующий микроскоп. Am J Physiol Heart Circ Physiol 278: h3150–h3156.
    20. 20. Маевска А., Ю Г., Юсте Р. (2000) Изготовленный на заказ двухфотонный микроскоп и система деконволюции.Арка Пфлюгера 441: 398–408.
    21. 21. Пологруто Т.А., Сабатини Б.Л., Свобода К. (2003) ScanImage: гибкое программное обеспечение для работы с лазерными сканирующими микроскопами. Биомед Инж Онлайн 2: 13
    22. 22. Лангер Д., Ван ‘т Хофф М., Келлер А.Дж., Нагарая С., Пфаффли О.А. и др. (2013) HelioScan: программная среда для управления установками микроскопии in vivo с высокой аппаратной гибкостью, функциональным разнообразием и расширяемостью. J Neurosci Methods 215: 38–52
    23. 23. Nguyen QT, Tsai PS, Kleinfeld D (2006) MPScope: универсальный программный пакет для многофотонной микроскопии.J Neurosci Методы.
    24. 24. Beaurepaire E, Mertz J (2002)Коллекция эпифлуоресценции в двухфотонной микроскопии. Appl Opt 41: 5376–5382.
    25. 25. Петтит Д.Л., Ван С.С., Джи К.Р., Августин Г.Дж. (1997) Химическое двухфотонное освобождение от клеток: новый подход к картированию рецепторов глутамата. Нейрон 19: 465–471.
    26. 26. Коской С., Вахарт Ф., Готро А., Мартин М., Лувар Д. и др. (2002) Молекулярный анализ микроскопической динамики эзрина с помощью двухфотонного FRAP.Proc Natl Acad Sci USA 99: 12813–12818
    27. 27. Коул Р. В., Джинадаса Т., Браун К.М. (2011)Измерение и интерпретация функций разброса точек для определения разрешения конфокального микроскопа и обеспечения контроля качества. Нацпроток 6: 1929–1941
    28. 28. Gordon GRJ, Iremonger KJ, Kantevari S, Ellis-Davies GCR, MacVicar BA, et al. (2009)Опосредованная астроцитами распределенная пластичность в гипоталамических глутаматных синапсах. Нейрон 64: 391–403
    29. 29. Tian L, Hires SA, Mao T, Huber D, Chiappe ME, et al.(2009)Визуализация нейронной активности у червей, мух и мышей с улучшенными показателями кальция GCaMP. Nat Methods 6: 875–881
    30. 30. Холтмаат А., Бонхёффер Т., Чоу Д.К., Чакоури Дж., Де Паола В. и др. (2009)Долговременная визуализация с высоким разрешением неокортекса мыши через хроническое черепное окно. Nat Protoc 4: 1128–1144
    31. 31. Китамура К., Юдкевитц Б., Кано М., Денк В., Хойссер М. (2008) Целевые записи патч-зажимов и одноклеточная электропорация немеченых нейронов in vivo. Nat Methods 5: 61–67
    32. 32. MacVicar BA, Hochman D (1991)Визуализация синаптически вызванных внутренних оптических сигналов в срезах гиппокампа. J Neurosci 11: 1458–1469.
    33. 33. Zhou N, Gordon GRJ, Feighan D, MacVicar BA (2010)Временное набухание, закисление и митохондриальная деполяризация происходят в нейронах, но не в астроцитах во время распространяющейся депрессии. Кора головного мозга 20: 2614–2624
    34. 34. Heider B, Nathanson JL, Isacoff EY, Callaway EM, Siegel RM (2010)Двухфотонная визуализация кальция в трансфицированных вирусом полосатых кортикальных нейронах обезьяны.PLoS ONE 5: e13829
    35. 35. Домбек Д.А., Хаббаз А.Н., Коллман Ф., Адельман Т.Л., Танк Д.В. (2007)Визуализация крупномасштабной нейронной активности с клеточным разрешением у бодрствующих подвижных мышей. Нейрон 56: 43–57
    36. 36. Chen X, Nadiarynkh O, Plotnikov S, Campagnola PJ (2012)Микроскопия генерации второй гармоники для количественного анализа фибриллярной структуры коллагена. Нацпроток 7: 654–669

    границ | Методология испытаний роботизированного манипулятора на радиационную устойчивость перед обращением с ядерными отходами

    1.Введение

    Ядерная промышленность в Великобритании и во всем мире все чаще ищет экономически эффективные методы для внедрения удаленных технологий, позволяющих вывести из эксплуатации устаревшие установки по обработке и обращению с отходами для снижения остаточной опасности, практика, настоятельно рекомендованная Международным агентством по атомной энергии (Iqbal et al., 2012). В то время как современные роботы повсеместно используются в других отраслях, таких как производство, в атомной промышленности еще предстоит добиться значительного внедрения, что принесло бы большую пользу от более широкого использования робототехники, если бы они были реализованы для выполнения работы, слишком опасной или сложной для людей. рабочие.На старых ядерных объектах требуются удаленные операции для целей инспекции, определения характеристик, резки, демонтажа, сортировки и разделения опасных отходов перед сносом зданий. Опасности, обычно встречающиеся на старых ядерных объектах, включают агрессивные химические вещества, радиоактивные материалы, излучающие альфа-, бета- или гамма-излучение, и асбест. Часто перед выводом из эксплуатации требуется понимание характера и распределения этих типов опасностей, и поэтому обеспечение этой улучшенной ситуационной осведомленности и возможности выполнять задачи удаленно — это то, где новые роботизированные технологии могут принести пользу отрасли.

    Консервативная нормативно-правовая база и высокие стандарты безопасности заставляют операторов атомных станций консервативно подходить к внедрению новых технологий, поэтому перед использованием любые новые системы должны быть продемонстрированы и тщательно протестированы в моделируемой среде. Многие объекты, вышедшие из эксплуатации, были построены в 1950-60-х годах по простой, но эффективной технологии.

    Использование простых удаленных систем не является чем-то новым для отрасли, но внедрение было медленным и ограниченным: Houssay (2000) описывает несколько уже опробованных систем, в том числе для рутинного мониторинга и наблюдения в Саванна-Ривер в США, а также для очистки пара. генераторы на электростанции в Индиан-Пойнт-2 еще в 1989 году.

    Современная электроника позволяет более разумно использовать роботизированные системы, но это сопряжено со своими проблемами. Многие в отрасли считали, что радиация немедленно выводит из строя любые современные электронные компоненты, поэтому электроники обычно избегали. Известно, что несколько роботов, использовавшихся для исследования активной зоны реактора Фукусима-дайити, подверглись чрезвычайно высоким дозам облучения, что привело к их очень быстрому выходу из строя. Такие экстремальные значения радиации не являются обычным явлением в области вывода из эксплуатации ядерных объектов, и поэтому эта статья направлена ​​на то, чтобы бросить вызов общепринятому мнению о том, что радиация и электроника несовместимы.В текущей работе мы демонстрируем, что электронные технологии действительно можно использовать в радиоактивных средах с успешными результатами. Представление о том, что «никакое электронное оборудование не может выдержать радиацию» и, следовательно, его нельзя использовать ни для каких задач по выводу из эксплуатации, неверно, и наши эксперименты с использованием высокоактивного источника излучения на основе кобальта-60 показали, что полезную работу можно выполнять с помощью сложных роботов.

    Радиационная устойчивость многих электронных компонентов, безусловно, имеет первостепенное значение для функциональности роботов (Garg et al., 2006). Часто исследователи или производители пытались сделать свои электронные устройства более устойчивыми к излучению, изменяя конструкцию интегральных схем, увеличивая амплитуду сигнала или просто экранируя (Ferlet-Cavrois, 2011). Однако в некоторых случаях наиболее экономичным решением для использования электроники в радиоактивных средах является использование стандартных компонентов и планирование их замены. Ясно, что есть случаи, когда замена невозможна (например, космические исследования или долгосрочная установка в резервуар для переработки), однако, понимая условия воздействия, создаваемые каждым приложением, и требуемый срок службы компонентов, можно разработать соответствующие решения. .Центральное место в оценке каждого приложения занимает знание устойчивости к излучению каждого компонента, а также системы в целом.

    Многие испытания электронных компонентов на облучение исследуют отдельные интегральные схемы или микросхемы (например, работа Katz and Some, 2003; Nagatani et al. , 2011; Ducros et al., 2017), в то время как наше испытание было направлено на проверку всей роботизированной системы. руку, чтобы лучше имитировать то, что может произойти в реальной промышленной среде, содержащей высокорадиоактивный материал.Предлагается методология планирования экспериментов по оценке производительности системы промышленного робота при выполнении роботом динамической задачи. Таким образом, можно наблюдать деградацию роботизированной системы во время ее работы, и поэтому тест обеспечивает более содержательную оценку эксплуатационных проблем по сравнению с оценкой производительности, проводимой на отдельных компонентах или когда робот неподвижен.

    Это самая первая работа, в которой оценивается системная производительность серийного промышленного робота-манипулятора.Производителям не было ясно, будет ли KUKA iiwa LBR800 работать вообще при тех же уровнях радиации, что и на объектах, работающих с отходами средней активности (ILW). В этой статье мы описываем эксперимент по проверке радиационной устойчивости робота-манипулятора в качестве исследовательского теста для определения серийной радиационной устойчивости такой системы и понимания того, какие улучшения можно было бы внести, чтобы повысить ее пригодность для вывода из эксплуатации. Приложения.

    2. Методика оценки производительности промышленных роботов

    Роботизированные системы, содержащие электронные компоненты, могут быть повреждены в той или иной форме, вызывая изменение функциональности при воздействии радиации, и этот эффект будет зависеть от дозы облучения. Для многих задач вывода из эксплуатации материалы, испускающие излучение, не будут четко определены, поэтому измерение мощности дозы в окружающей среде вполне может быть одной из задач роботизированной инспекции.

    Воздействие радиации на компоненты зависит от материала и хорошо изучено.Металл-оксид-полупроводники (МОП) имеют измененные электронные свойства (Ma and Dressendorfer, 1989), эластомерные материалы, используемые в уплотнениях, могут становиться хрупкими (Wündrich, 1984), а оптические компоненты, как известно, со временем изменяют свою прозрачность и показатели преломления (Brichard). и др., 2001). Изменения в величине измеренных ошибок в моторном контроле наблюдали Howard et al. (2018). При достаточном излучении эти изменения механических, оптических или электронных свойств могут в конечном итоге привести к выходу из строя восприимчивых компонентов, что потенциально может привести к поломке робота.

    Воздействие радиации на роботизированную систему может зависеть от ее рабочего состояния, а «стационарный» метод оценки может не демонстрировать изменения производительности всей системы. Для систем, работающих в динамическом движении, крайне важно гарантировать производительность системы всего робота (Aitken et al., 2018; Tsitsimpelis et al., 2019), чтобы робот мог выполнять свои задачи для конкретной миссии. Недавно были предложены различные готовые промышленные роботы, например, iiwa 14 LBR820, предложенный Aitken et al.(2018 г.) и прототипы систем, финансируемые Управлением по выводу из эксплуатации ядерных установок Великобритании (2019 г.). Развертывание готовых роботов избавляет от необходимости разрабатывать и производить специальные роботы-манипуляторы для конкретных требований, ускоряя развертывание на ядерных объектах, но большинство готовых промышленных роботов не испытывали в радиационной среде. Для соблюдения строгих нормативных требований и для создания аргументов в пользу безопасности важно квалифицировать работу системы промышленного робота-манипулятора во время воздействия радиоактивных материалов, чтобы снизить риск аварии.

    В этом документе предлагается систематическая методология оценки производительности промышленного робота, состоящая из следующих шагов:

    1. Определение критических мест в манипуляторе, содержащих (часто электронные) компоненты, потенциально подверженные радиационному облучению.

    2. Планирование движения робота для конкретных приложений с учетом любых ограничений безопасности и физических ограничений.

    3. Измерение мощности экспозиционной дозы в каждой критической точке.

    4. Сбор данных и контроль работоспособности имеющихся параметров и показателей при повторяющемся движении по заданной траектории под воздействием радиации.

    5. После наблюдаемого снижения производительности оценка точки отказа с использованием «стационарного» метода.

    Шаг 1. Из-за высокой сложности готовых промышленных роботов часто бывает очень сложно создать аналитические модели систем, на которые может влиять радиация (Howard et al., 2018). Тем не менее, можно определить компоненты, которые наименее устойчивы к радиации, и оценить их аварийную дозу путем испытаний на облучение отдельных компонентов. Как правило, управляющие процессоры и интегральные схемы (ИС) датчиков считаются наименее радиационно стойкими компонентами по результатам стационарных оценок (Katz and Some, 2003; Nagatani et al., 2011; Ducros et al., 2017). ). Также может быть необходимо учитывать деградацию других материалов, таких как эластомерные полимеры (для структурной целостности; Wündrich, 1984) и оптические волокна (для связи между устройствами; Brichard et al., 2001).

    Этап 2. Необходимо провести оценку промышленного робота в радиационной среде с требуемой мощностью дозы в течение заданного времени воздействия (Katz and Some, 2003; Nagatani et al., 2011; Ducros et al. , 2017; Tsitsimpelis et al. , 2019). Этого легко добиться при обычных стационарных оценках, поскольку отдельные электронные компоненты могут подвергаться воздействию постоянной мощности дозы. Для более точного моделирования реальной работы мы рекомендуем использовать динамический тест, в котором робот выполняет повторяющиеся движения, предоставляя убедительные доказательства того, с какими видами отказов можно столкнуться во время реальной работы.Сравнение рабочих параметров, собранных во время каждого цикла повторяющихся действий в периоды воздействия и до воздействия, можно использовать для отображения или прогнозирования изменений в производительности робота. Траектория робота должна обходить препятствия в случае неисправности, особенно с радиоактивными источниками.

    Шаг 3. На практике мощность экспозиционной дозы варьируется в зависимости от близости каждого компонента робота к источнику излучения, и различия могут быть значительными. Важно точно измерить мощность дозы в представляющих интерес местах, особенно в менее устойчивых к радиации компонентах, чтобы характеристики можно было соотнести с дозой облучения. Мощность дозы в каждом положении следует измерять в течение нескольких динамических рабочих циклов, для чего требуется радиометрический прибор в режиме реального времени, такой как детектор алмазного излучения, как описано Hutson (2018).

    Этап 4. Все возможные измерения, связанные с работой роботизированной системы, должны быть записаны для последующего анализа деградации под воздействием радиации. Ховард и др. (2018) записали все входные и выходные сигналы каждого воспринимающего и управляющего компонента с высокой частотой дискретизации, равной 1.25 кГц, во время их тестового облучения с помощью рентгеновских лучей. Тем не менее, такие сигналы аппаратного уровня часто труднодоступны в промышленных роботах, но можно наблюдать, по крайней мере, ошибки управления от контроллеров роботов.

    Набор эталонных данных, собранных во время движения по запланированной траектории, но до любого воздействия, желателен для анализа любого непосредственного воздействия излучения на работу робота.

    Этап 5. Последним этапом оценки промышленного робота является запуск стационарной работы робота для определения общей устойчивости системы к излучению при сконфигурированной мощности дозы до тех пор, пока не произойдет отказ системы (как в Nagatani et al., 2011; Дюкрос и др., 2017). В результате на этапе оценки определяется экстремальная общая переносимость дозы промышленного робота и любые конкретные аппаратные/программные проблемы, ограничивающие всю систему.

    Предлагаемая методология использовалась в текущем исследовании для оценки производительности системы манипулятора KUKA iiwa 7 LBR800, расположенного на расстоянии ~1,60 м от источника кобальта-60 мощностью 20 ТБк ( 60 Co ).

    3. Экспериментальная установка

    3.1. Тестируемый робот

    3.1.1. KUKA iiwa 7 LBR800 Робот

    Роботизированный манипулятор KUKA iiwa 7 LBR800 производства KUKA Deutschland GmbH (2019 г.) был предложен для нескольких применений в атомной промышленности, включая обеззараживание перчаточных ящиков. Он имеет 7 шарниров вращения, обеспечивающих 7 степеней свободы, и имеет максимальную полезную нагрузку 7 кг при радиусе действия 926 мм. Робот обладает высокой гибкостью, что позволяет ему легко обходить препятствия. На рис. 1 показано расположение суставов робота. В каждом суставе робот имеет три различных типа датчиков, позволяющих измерять температуру, угловое положение и силу-крутящий момент.На каждом шарнире два энкодера используются для измерения углового положения, чтобы добиться хороших характеристик позиционирования рабочего органа на уровне миллиметра. Использование двух энкодеров обеспечивает некоторую избыточность, которую можно использовать для обнаружения отказа датчика, а сравнение их обратной связи используется для механизма безопасности управления роботом. Датчики силы и момента используются для обнаружения любых внешних сил, приложенных к роботу, что делает его «безопасным для человека» для работы, в которой люди сотрудничают с роботом.

    Рисунок 1 . Робот KUKA iiwa 7 LBR800, используемый для испытаний на радиационную устойчивость. На левом изображении показан робот в его «нулевом» положении со всеми соединениями робота в исходных нулевых положениях. Указаны положительные направления каждого сустава. На правой фотографии показан робот во время макетных испытаний, в которых была запрограммирована периодическая траектория. Области красного цвета показывают места установки детектора излучения.

    3.1.2. Идентификация компонентов с наименьшей радиационной устойчивостью

    В каждом шарнире есть несколько электронных компонентов, таких как интегральные схемы моторных приводов, энкодеры и датчики крутящего момента, которые заключены в алюминиевый корпус.Эта совмещенная электроника представляет собой интересующие места, поэтому были проведены измерения мощности дозы, как показано на рисунке 1. Наиболее важным из них был «конечный эффектор», отвечающий за перенос инструментов, захватов и комплектов датчиков. Рабочий орган также, вероятно, получит более высокую дозу, чем другие компоненты, во время операций, связанных с радиоактивным материалом.

    3.1.3. Испытательный источник облучения

    Испытания на радиацию проводились в лаборатории Совета медицинских исследований (MRC) в Харуэлле.Как показано на рисунке 2, источник излучения состоял из четырех источников 60 Co с общей активностью около 20 ТБк. Источники 60 Co производят интенсивное гамма-излучение посредством распада до 60 Ni , как показано на схеме распада на рисунке 3. Источник можно грубо рассматривать как точечный источник, расположенный в положении, отмеченном на рисунке 2B. .

    Рис. 2. (A) Роботизированный манипулятор KUKA iiwa перед источниками кобальта-60 (B) .

    Рисунок 3 . Бета-распад C2760o сопровождается гамма-излучением N2860i с энергиями 1,17 и 1,33 МэВ (Camp and Van Hise, 1976).

    В процессе распада образовавшиеся бета-частицы поглощались корпусом трубки-источника, оставляя только гамма-кванты с энергиями 1,17 и 1,33 МэВ. 60 Co используется в качестве удобного источника излучения, поскольку он присутствует в ядерных отходах и испускает фотоны, близкие по энергии к фотонам, испускаемым при распаде 137 Cs , основной вклад в гамма-излучение живые ядерные отходы.Чтобы обнажить камеру, четыре источника 60 Co были протолкнуты телефлексными кабелями через защитные трубы, проходя в камеру через свинцовый замок в четыре выступающие трубы для облучения. Источники могли быть изъяты в любой момент эксперимента.

    3.2. Планирование траектории робота для динамического теста производительности

    Робот-манипулятор был закреплен на месте, прикрепленном к тяжелому основанию, предназначенному для стабилизации робота в случае неожиданно высокого импульса в случае катастрофического отказа управления роботом.Робот был расположен так, чтобы все объекты были вне досягаемости, как показано на рисунке 2.

    Плоскость x-z робота была выровнена с источниками, а трубки-источники были параллельны оси Y робота (см. исходные координаты робота на рис. 1). Исходное положение робота было примерно в 1,6 м от центра источников по его оси x.

    Робот управляется для следования по заданной траектории, имитируя выполнение роботом повторяющейся задачи. Непрерывное движение манипулятора робота разработано таким образом, чтобы каждый из двигателей был активен в любое время.Следовательно, это оценивает, может ли каждый сустав оставаться физически способным двигаться во время воздействия (см. результаты в разделе 4). Рабочий орган робота считается наиболее важным компонентом системы, и его целевое воздействие составляет ~ 10 Гр / ч. В идеале рабочий орган робота должен управляться по дуговой траектории, сохраняя постоянное расстояние до предполагаемого точечного источника. Практически это невозможно, так как очень небольшие изменения расстояния от рабочего органа до источника приводят к заметным изменениям мощности дозы.Эти изменения легко преодолевались с помощью дозиметрии, работающей на частоте 20 Гц.

    От центра точечного источника поток гамма-излучения затухает по мере увеличения расстояния от источника по закону обратных квадратов. Планировалось, что траектория рабочего органа робота будет следовать по дуге радиусом 1 м от предполагаемого точечного источника. Рабочий орган перемещался по дуговой траектории со скоростью 20 мм/с за период времени 1 мин, огибая источники излучения по повторяющейся схеме.Траектории были рассчитаны с помощью обратного кинематического алгоритма на основе матрицы Якоби, как описано Мередит и Мэддок (2004).

    Манипулятор был подключен кабелем управления роботом (кабель X21-X31) к шкафу управления KUKA Sunrise, как показано на рис. 4. Блок управления располагался за пределами комнаты облучения (за бетонными стенами), что означало, что он получил небольшую дозу облучения. Хост-ПК был подключен через соединение RJ45 к блоку управления. По команде 1-минутного цикла хост-компьютер проинструктировал новые значения положения для каждого сустава в блоке управления, который передал их соответствующим суставам. В частности, была разработана управляющая программа на языке C++, обеспечивающая связь в режиме реального времени между стандартным хост-компьютером и Sunrise Cabinet. В программе управления использовался интерфейс прикладного программирования под названием KUKA Fast Robot Interface (KUKA Deutschland GmbH, 2019). Эта конструкция свела к минимуму задержку связи и, следовательно, обеспечила скорость управления/сбора данных 100 Гц.

    Рисунок 4 . Настройка, обеспечивающая управление и запись данных робота LBR800.

    3.3. Измерение мощности дозы в критических положениях

    Основная цель испытаний заключалась в том, чтобы понять устойчивость к радиации, и для этого требовалось измерение дозы облучения робота. Требовалось измерение в режиме реального времени для точного количественного определения дозы, полученной до выхода из строя каждого интересующего компонента. Пассивное дозиметрическое измерение не подходило бы для этого испытания, поскольку нельзя было предсказать время до отказа, и отказ мог произойти, когда экспериментаторы не присутствовали, чтобы извлечь источники излучения и прекратить облучение.

    Требуемые измерения особенно обременительны для детекторов излучения, поскольку воздействия было достаточно, чтобы повлиять на работу электроники. Наиболее подходящим доступным детектором был алмазный детектор излучения, откалиброванный для измерения мощности дозы кермы в воздухе, система, уже используемая в Селлафилде и описанная Hutson (2018). Этот детектор был выбран среди других полупроводниковых детекторов и сцинтилляционных детекторов за его превосходную радиационную устойчивость, и он уже был соответствующим образом откалиброван для целевой мощности экспозиционной дозы.В детекторе использовался монокристалл алмаза, выращенный методом химического осаждения из газовой фазы, размером 4,5 × 4,5 × 0,5 мм. Система алмазного детектора применяет калибровки мощности дозы, полученные с использованием как цезия-137, так и кобальта-60, и выдает значения мощности дозы кермы в воздухе каждые 50 мс. Детектор, работающий в текущем режиме, не имеет известного верхнего предела мощности дозы и доказал свою исключительную устойчивость к гамма-излучению.

    Детектор по очереди размещали в нескольких местах вдоль манипулятора для количественной оценки экспозиции каждой связки электронных схем и датчиков, как показано на рис. 5.Для каждой позиции мощность дозы в реальном времени измерялась в течение 10 мин. После того, как экспозиция каждого сустава была измерена, алмазный детектор был присоединен к концевому эффектору робота на оставшуюся часть эксперимента для продолжения радиометрических измерений в реальном времени. Компонент концевого исполнительного элемента подвергся наибольшей дозе облучения и представлял наибольший интерес для испытаний, потому что в реальной операции по выводу из эксплуатации ядерной установки мог бы удерживать любой режущий инструмент или датчик.

    Рисунок 5 .Мощность экспозиционной дозы варьировалась по длине манипулятора робота, поэтому алмазный детектор был установлен в разных местах на манипуляторе KUKA iiwa во время испытания на радиационную устойчивость, чтобы обеспечить возможность измерения мощности дозы, как показано на рис. 7.

    3.4. Выявление снижения производительности робота

    Было несколько индикаторов, помогающих определить снижение производительности и отказ манипулятора:

    1. Требуемые и измеренные значения крутящего момента и положения в суставах записывались в режиме реального времени в электронную таблицу данных с частотой дискретизации 100 Гц.Перед облучением были зарегистрированы значения дуговой траектории робота для эталонного набора значений, которые можно было сравнить со значениями, записанными во время облучения. Любые различия в значениях до облучения и облучения будут свидетельствовать об ухудшении производительности робота.

    2. Две веб-камеры записывали непрерывное видео в течение всего эксперимента по облучению. Примеры изображений приведены на рис. 6, показывая, что отснятый материал можно использовать для наблюдения за роботом в режиме реального времени и выявления любых неожиданных движений роботизированной руки.

    3. Система KUKA отображала сообщения об ошибках манипулятора. Ожидалось, что программное обеспечение робота отключит систему из соображений безопасности в случае отказа компонента.

    Рисунок 6 . Роботизированная рука наблюдалась во время динамического испытания на облучение с помощью двух веб-камер, расположенных внутри камеры облучения. Спекл можно наблюдать на обоих изображениях.

    Таким образом, мы следовали описанной здесь методологии, состоящей из: (1) выявления уязвимых компонентов; (2) программирование повторяющейся траектории; (3) измерение мощности дозы облучения уязвимых компонентов; (4) измерение деградации; и (5) наблюдение за отказом системы.

    4. Результаты и обсуждение

    4.1. Измерение мощности экспозиционной дозы

    Обязательно на разном расстоянии от источников излучения и при движении по дуге каждый набор датчиков и приводов подвергался воздействию разных потоков излучения. Поэтому для каждого интересующего места на роботе измерялся отдельный профиль мощности дозы, чтобы охарактеризовать условия облучения для каждого сустава. Эти профили мощности дозы, измеренные с помощью детектора алмазного излучения, показаны на рисунке 7.

    Рисунок 7 . Усредненные измерения мощности дозы и углового положения каждого цикла динамической оценки (в течение 60 с) в течение 10 циклов. Угловое положение и мощности экспозиционной дозы показаны для каждого сустава: (А) в суставе 7; (B) на стыке 6; (C) на стыке 5; (D) на стыке 4; (E) на стыке 3; (F) в Стыке 2; и (G) в стыке 1.

    4.2. Производительность робота до отказа

    Во время первоначального динамического эксперимента робот должен был повторяться по запланированной траектории в течение ~6.3 ч. Это было преднамеренно повторяющееся действие, направленное на детальное понимание любых изменений параметров, происходящих в результате накопленного радиационного поражения. Эти хронические симптомы было важно понять, если они имеют какое-либо отношение к общему контролю над роботом.

    • Отсутствие изменений траектории робота в результате воздействия было достаточно большим, чтобы его можно было заметить визуально с помощью изображений с веб-камеры.

    • Никаких изменений траектории робота в результате облучения не было заметно по изменению профиля мощности дозы при сравнении дозиметрического профиля в начале и в конце динамической оценки.

    • Небольшие изменения в стандартном отклонении ошибки управления соединением 2 начали происходить через 5 часов этого теста (в общей сложности после 8-часового воздействия) (показано красным цветом на рис. 8).

    • Никакие другие соединения не претерпели такого увеличения ошибки управления во время облучения, что наводит нас на мысль, что это могло быть вызвано небольшим первоначальным дефектом в соединении 2, не обязательно вызванным исключительно радиационным повреждением.

    Рисунок 8 . Оценка эффективности управления угловым положением робота в каждом суставе. (A) Среднеквадратичное значение (RMS) ошибки управления для каждого сустава. (B) Стандартное отклонение (S.D.) ошибки управления для каждого сустава.

    4.3. Острая недостаточность

    Робот вышел из строя во время стационарного воздействия по причине повреждения оптического энкодера в концевом эффекторе (шарнир 7). Этот компонент преобразует угловое положение шарнира в цифровой сигнал для обратной связи с контроллером. Поврежденный компонент был диагностирован самой системой управления KUKA с сообщением «ошибка энкодера датчика крутящего момента» и «безопасное положение оси недействительно», в результате чего контроллер предотвратил дальнейшую работу робота.Попытки перезагрузки, ремастеринга и восстановления движения робота по прошествии времени не увенчались успехом: этот неисправный компонент был безвозвратно уничтожен.

    4.4. Мощность экспозиционной дозы и общая доза

    Мощность дозы, измеренная дозиметрической системой с алмазным детектором, показана для каждого сустава в таблице 1 как для динамических, так и для стационарных оценок. Эти измерения были использованы для расчета общего воздействия на каждый сустав, как указано в таблице 2.

    Таблица 1 .Мощность дозы воздействия кермы в воздухе на каждом суставе робота, измеренная с помощью системы мощности дозы алмаза.

    Таблица 2 . Доза воздействия кермы в воздухе на каждое сочленение робота, измеренная с помощью системы мощности дозы алмаза.

    Неопределенность измерения дозы составляет ±0,6 Гр при динамической оценке в течение примерно 9,3 ч. В рамках следующей статической оценки измерение дозы облучения имеет погрешность ±0,49 Гр за период около 7,5 часов. Доза облучения системы составляет приблизительно ±1.09 Гр неопределенность.

    5. Обсуждение

    Робот KUKA LBR800 перестал работать после большой дозы облучения 164,55 (±1,09) Гр на его концевой эффектор, а компонентом, вызвавшим отказ, был оптический энкодер. Неисправность этого компонента была отмечена управляющим ПО и контроллером smartPAD, что в последующем препятствовало работе робота. Встроенные функции интеллектуального программного обеспечения смогли отлично контролировать ситуацию, и мы смогли продемонстрировать, что после сбоя кодировщика программное обеспечение Kuka заблокировало робота в безопасном состоянии.Этот механизм отказоустойчивости в программном обеспечении был бы невозможен в других, более традиционных типах роботов, использующих меньшее количество электронных компонентов, поэтому такой подход к программному обеспечению следует рассматривать как существенное преимущество в плане безопасности для любого оператора ядерной установки, если такие сбои произойдут на объекте, имеющем ядерную лицензию. Наше испытание показывает, что стандартные функции безопасности помогают предотвратить аварию при обращении с ядерным материалом из-за медленного отказа системы.

    На ядерной установке было бы полезно поддерживать показания кумулятивной дозы на соединениях (используя алмазные детекторы или другие миниатюрные детекторы аналогичного размера), чтобы гарантировать, что система может быть подвергнута профилактическому обслуживанию или замене компонентов, скажем, на 75% ее дозы. срок службы до отказа, а не ожидание отказа устройства на неудобной стадии процесса.

    Целевая мощность дозы 10 Гр/ч была выбрана как консервативно высокая величина облучения для объектов САО, и в действительности она более точно соответствует мощности дозы, наблюдаемой на объектах, работающих с высокоактивными отходами. Мощность контактной дозы на объектах по обращению с САО, как правило, составляет 1 Гр/ч и ниже, поэтому для более точного моделирования объектов с САО было бы целесообразно использовать более низкие дозы облучения для будущих программ испытаний.

    В этом документе представлена ​​методология тестирования готовых роботов в радиационной среде на системном уровне.Такие тесты на системном уровне имеют значительные преимущества, предоставляя справочные данные для развертывания робота в практических операциях, тем самым укрепляя уверенность в том, что система может использоваться в радиоактивных средах. Тесты на системном уровне также позволяют определить наименее устойчивый к радиации компонент. Ясно, что испытание на уровне системы является необходимой начальной оценкой для применения готовой системы в радиационной среде.

    Обратите внимание, что инвестиции, необходимые для покупки полных готовых систем, таких как робот, протестированный в этой работе, значительны.Поэтому, несмотря на то, что важно проводить тесты на системном уровне для повышения уверенности в средах, существующих в реальных приложениях, стоимость уничтожения большого количества роботов будет непомерно высокой. Следовательно, для получения разумной уверенности в ожидаемом сроке службы рекомендуется следующая методология:

    1. Испытание на системном уровне для проверки того, что готовый робот может удовлетворить первоначальные проектные требования в радиоактивной среде.

    2. Идентификация отдельных компонентов, восприимчивых к излучению, путем покомпонентного анализа облученного робота.

    3. Воздействие на статистически значимое количество идентифицированных восприимчивых компонентов, что позволяет оценить срок службы системы в зависимости от различных условий, таких как воздействие при нескольких мощностях дозы, различных температурах и других режимах нагрузки/работы робота. В сопоставимом исследовании были испытаны два образца каждого отдельного компонента для разработки радиационно стойкого робота для атомной промышленности (Sharp and Decreton, 1996). Находясь в хорошем компромиссе между статистической точностью и стоимостью, Oomichi et al.(2007) протестировали от 7 до 30 образцов различных компонентов. Для тестирования на уровне компонентов мы рекомендуем облучать и анализировать не менее 20 образцов, чтобы обеспечить строгий статистический анализ.

    5.1. Рекомендации по дальнейшей работе

    Из-за консервативного подхода к использованию новых технологий в атомной промышленности крайне важно, чтобы до их использования полностью понималась радиационная устойчивость новой технологии. В этом эксперименте аварийная доза гамма-излучения для манипулятора KUKA составила 164 Гр.Однако из-за вероятностного характера взаимодействия фотонов с веществом существует вероятность (которая основана на энергии фотонов и электронном материале), что когда фотон падает на электронное устройство в роботизированной руке, он не будет поглощен. Кроме того, процесс производства электронных компонентов приводит к распределению характеристик, поэтому, если эксперимент повторить, доза отказа может быть выше или ниже измеренной нами. Таким образом, дальнейшие испытания облучения обеих нескольких полных систем роботизированного манипулятора были бы полезны для подтверждения результата дозы отказа.Очевидно, что это будет иметь значительные финансовые последствия, поэтому мы рекомендуем вместо этого проводить испытания на облучение большого количества наименее устойчивых к радиации электронных компонентов (например, оптического энкодера). Это по-прежнему обеспечит точную цифру радиационной устойчивости всей системы.

    Вторая рекомендация — починить/заменить сломанный энкодер в концевом эффекторе робота и попытаться восстановить полную функциональность робота. После того, как робот будет модернизирован, можно будет провести дополнительные испытания на облучение.Это было бы полезно для промышленности, поскольку продемонстрировало бы, что робота можно чинить и переустановить, а также предоставило бы больше данных об облучении руки.

    Защита особенно уязвимых компонентов внутри робота может увеличить срок службы системы в радиоактивной среде. Было бы полезно испытать некоторые микроэкраны вокруг таких компонентов, как оптический энкодер в каждом соединении, ограниченные воздействием дополнительного веса от экранирования, что уменьшит возможную полезную нагрузку любых датчиков или исполнительных механизмов (например,г., захваты или резаки). Селективное экранирование может при ограниченных затратах существенно увеличить срок службы робота.

    Следует рассмотреть возможность замены компонентов радиационно-устойчивыми альтернативами, если готовый робот оказался непригодным. Например, функцию, выполняемую оптическими энкодерами, могли бы выполнять поворотные энкодеры, которые, как известно, менее подвержены радиационному повреждению. Анализ затрат и выгод будет учитывать дополнительные затраты на внедрение новых компонентов и деньги, сэкономленные за счет увеличения срока службы робота.

    Небольшие изменения в функциях безопасности программного обеспечения робота-манипулятора могут быть изменены, чтобы позволить роботу восстановиться в случае отказа сустава во время выполнения задачи. Робот с семью сочленениями имеет значительную кинематическую избыточность в положениях в пределах досягаемости, поэтому робот может выполнять свою задачу без работающего сочленения. Это еще больше продлит срок службы робота, в качестве альтернативы это может позволить роботу выполнять свои непосредственные задачи, а затем вернуться в безопасное состояние, готовое к ремонтному обслуживанию.

    Будущие исследования могут моделировать/моделировать повреждения, нанесенные электронике робота, с использованием программного обеспечения для моделирования методом Монте-Карло, такого как пакет Geant4, разработанный CERN. Предыдущее исследование, подобное этому, было выполнено для применения радиационного повреждения электроники, используемой в космосе, Feng et al. (2007) и Xiao et al. (2018). Для такого моделирования потребуются более подробные сведения о распределении источников излучения, чем это обычно доступно для вывода из эксплуатации ядерных установок.

    6. Выводы

    В данной работе изучалось контролируемое воздействие гамма-излучения на робота KUKA iiwa LBR для определения его устойчивости и работоспособности в высокорадиоактивных средах, аналогичных объектам по переработке и хранению ядерных отходов.

    Робот подвергся воздействию гамма-излучения от источника кобальта-60 мощностью 20 ТБк и продемонстрировал значительную радиационную устойчивость, при этом произошел отказ оптического кодировщика после совокупного облучения в 164,55 Гр за период 16.8 ч.

    Результаты показывают, что силовые роботы, которые предлагают повышенный уровень точности для манипулирования объектами, потенциально жизнеспособны для приложений по переработке ядерных отходов. Используемые в соответствующих приложениях роботизированные технологии с использованием современного программного обеспечения для датчиков и управления могут оказать большое влияние на отрасль с точки зрения экономии средств, безопасности и сокращения сроков вывода из эксплуатации. В будущей работе следует рассмотреть альтернативные устойчивые к излучению замены оптических энкодеров, а также изучить методы микроэкранирования уязвимых компонентов для увеличения срока службы роботизированных систем.

    Заявление о доступности данных

    Все наборы данных, созданные для этого исследования, включены в статью/дополнительный материал.

    Вклад авторов

    TS, CH и KZ внесли свой вклад в концепцию и дизайн исследования. СН организовал облучение и измерил мощности дозы. JK и KZ запрограммировали управление, сбор данных робота-манипулятора, выполнили обработку данных и статистический анализ. CH, JK и KZ написали основные разделы рукописи.И KZ, и CH контролировали JK. TS и GH являются основными исследователями, связанными с этим проектом. Все авторы внесли свой вклад в доработку рукописи, прочитали и одобрили представленную версию.

    Финансирование

    Мы хотели бы поблагодарить UK Research and Innovation (UKRI) за их поддержку и финансирование, полученное через грант Национального центра ядерной робототехники (NCNR) EP/R02572X/1; из гранта Робототехники и искусственного интеллекта в ядерной области (RAIN) EP/R026084/1; и от Rad-Hard Diamond Detectors для гражданских ядерных приложений (грант ST/P001823).Финансирование также подтверждено Jacobs Engineering Group.

    Конфликт интересов

    Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могли бы быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

    Благодарности

    Авторы хотели бы поблагодарить компанию KUKA AG за поддержку, предоставившую программное обеспечение интерфейса приложения и предложившую потенциальные точки отказа. Мы хотели бы поблагодарить Боба Соколовски из Медицинского исследовательского совета, который поддержал экспериментальный доступ к радиационным установкам в Харвелле.Мы благодарим Эстель Талфан Дэвис за корректуру этой рукописи.

    Ссылки

    Айткен, Дж. М., Верес, С. М., Шаукат, А., Гао, Ю., Кукко, Э., Деннис, Л. А., и соавт. (2018). Автономное обращение с ядерными отходами. IEEE Intel. Сист. 33, 47–55. doi: 10.1109/MIS.2018.111144814

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Бришар Б., Боргерманс П., Фернандес А. Ф., Ламменс К. и Декретон А. (2001). Эффект излучения в кварцевом оптическом волокне, подвергнутом воздействию интенсивного поля смешанного нейтронно-гамма-излучения. IEEE Trans. Нукл. науч. 48, 2069–2073. дои: 10. 1109/23.983174

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Кэмп, Д., и Ван Хайз, Дж. (1976). Слабые гамма-лучи наблюдаются при распаде co 60 . Физ. Ред. C 14:261. doi: 10.1103/PhysRevC.14.261

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Ducros, C., Hauser, G., Mahjoubi, N., Girones, P., Boisset, L., Sorin, A., et al. (2017). RICA: Гусеничный робот для отбора проб и радиологической характеристики в ядерной области. Дж. Полевой робот. 34, 583–599. doi: 10.1002/роб.21650

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Фэн, Ю.-Дж., Хуа, Г.-Х., и Лю, С.-Ф. (2007). Радиационная стойкость для космической электроники. Дж. Астронавт. 28, 1071-1080

    Академия Google

    Ферле-Кавруа, В. (2011). «Электронное радиационное упрочнение — обеспечение радиационной стойкости и демонстрация технологий», в JUICE Instrument Workshop (Дармштадт).

    Академия Google

    Гарг, Р. , Джаякумар, Н., Хатри, С.П., и Чой, Г. (2006). «Подход к проектированию радиационностойкой цифровой электроники», в материалах Proceedings of the 43rd Annual Design Automation Conference (Сан-Франциско, Калифорния: ACM), 773–778.

    Академия Google

    Houssay, LP (2000). Робототехника и радиационное упрочнение в атомной отрасли (кандидатская диссертация). Государственный университет Флориды, Гейнсвилл, Флорида, США.

    Академия Google

    Ховард, Дж., Барт, Э., Шримпф Р., Рид Р., Адамс Л., Вибберт Д. и др. (2018). Методология выявления радиационных эффектов в роботизированных системах с вариациями механических и управляющих характеристик. IEEE Trans. Нукл. науч. 66, 184–189. doi: 10.1109/TNS.2018.2886242

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Хатсон, К. (2018). Алмазная дозиметрия для измерений в высокорадиоактивных ядерных средах (кандидатская диссертация). Бристольский университет, Бристоль, Великобритания.

    Академия Google

    Икбал, Дж., Тахир, А.М., ул Ислам, Р., и др. (2012). «Робототехника для атомных электростанций — проблемы и перспективы», в 2012 2-й Международной конференции по прикладной робототехнике для энергетики (CARPI) (Цюрих: IEEE), 151–156.

    Академия Google

    Кац Д.С. и Соме Р.Р. (2003). НАСА продвигает роботизированное исследование космоса. Компьютер 36, 52–61. doi: 10.1109/MC.2003.1160056

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    KUKA Deutschland GmbH (2019). LBR iiwa 7 r800, LBR iiwa 14 R820 Спецификация .

    Академия Google

    млн лет, Т.-П., и Дрессендорфер, П.В. (1989). Эффекты ионизирующего излучения в МОП-устройствах и схемах . Джон Уайли и сыновья.

    Академия Google

    Мередит, М., и Мэддок, С. (2004). Обратная кинематика в реальном времени: возвращение якобиана . Технический отчет, Технический отчет № CS-04-06, Департамент компьютерных наук, Шеффилдский университет.

    Академия Google

    Нагатани К., Кирибаяси С., Окада Ю., Отаке К., Йошида К., Тадокоро С. и др. (2011). «Испытание гамма-излучением электрических компонентов спасательного мобильного робота-айвы», в IEEE International Symposium on Safety, Security and Rescue Robotics , 2011 г. (Киото: IEEE), 56–60.

    Академия Google

    Управление по выводу из эксплуатации ядерных объектов (2019 г.). Очищение нашего ядерного прошлого: быстрее, безопаснее и быстрее .

    Академия Google

    Омичи, Т., Исодзаки Ю. и Кодзима М. (2007). Практическое проектирование роботов, работающих в радиационных средах. Доп. Робот. 21, 515–532. дои: 10.1163/156855307780108286

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Шарп Р. и Декретон М. (1996). Радиационная устойчивость компонентов и материалов в приложениях ядерных роботов. Надежный. англ. Сист. Саф. 53, 291–299. doi: 10.1016/S0951-8320(96)00054-3

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Цицимпелис, И. , Тейлор, С.Дж., Леннокс, Б., и Джойс, М.Дж. (2019). Обзор наземных роботизированных систем для характеристики ядерных сред. Прог. Нукл. Энергия 111, 109–124. doi: 10.1016/j.pnucene.2018.10.023

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Вюндрих, К. (1984). Обзор радиационной стойкости пластиковых и эластомерных материалов. Рад. физ. хим. 24, 503–510. дои: 10.1016/0146-5724(84)-7

    Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

    Сяо, Х., Хайдас В., Бовивр С., Краэнбюль Д., Зите Р. и Банерджи Н. (2018). «Моделирование радиационного повреждения в камере космического корабля для миссии ESA JUICE», в 2018 Международная конференция по радиационным эффектам электронных устройств (ICREED) (Хейлунцзян: IEEE), 1–4.

    Академия Google

    Недорогая электроника и программное обеспечение для фотонной статистики и корреляционной спектроскопии

    Am J Phys. Авторская рукопись; доступно в PMC 2016 26 февраля.Гамари

    Физический факультет Массачусетского университета, Амхерст, Массачусетс 01002

    Dianwen Zhang

    Физический факультет Массачусетского университета, Амхерст, Массачусетс 01002

    Richard E. Buckman

    Амхерстский университет, Массачусетский физический факультет, Массачусетс , Массачусетс 01002

    Пекер Милас

    Физический факультет Массачусетского университета, Амхерст, Массачусетс 01002

    Джон С. Денкер

    AT&T Laboratories Research (в отставке.), Florham Park NJ, 07932

    Hui Chen

    Wadsworth Center, Департамент здравоохранения штата Нью-Йорк, 120 New Scotland Ave, Albany, New York 12208

    Hongmin Li

    Wadsworth Center, Департамент здравоохранения штата Нью-Йорк, 120 New Scotland Ave, Albany, New York 12208 и Департамент биомедицинских наук, Школа общественного здравоохранения, Государственный университет Нью-Йорка в Albany, PO BOX 509, Albany, New York 12201-0509

    Лори С. Голднер

    Факультет физики Массачусетского университета, Амхерст, Массачусетс 01002

    Бенджамин Д.Гамари, факультет физики Массачусетского университета, Амхерст, Массачусетс 01002;

    a Текущий адрес: Институт передовых наук и технологий Бекмана, Иллинойский университет в Урбана-Шампейн, 405 North Mathews, Urbana, Illinois 61801.

    Окончательная отредактированная версия этой статьи доступна на сайте Am J Phys. в PMC, которые ссылаются на опубликованную статью.

    Abstract

    Микроскопия и спектроскопия, чувствительные к отдельным молекулам, преобразуют лаборатории биофизики и материаловедения.Такие методы, как флуоресцентная корреляционная спектроскопия (FCS) и чувствительный к одной молекуле резонансный перенос энергии флуоресценции (FRET), в настоящее время широко доступны в исследовательских лабораториях, но пока редко доступны в учебных лабораториях. Мы описываем недорогую электронику и программное обеспечение с открытым исходным кодом, которые устраняют этот пробел, делая современные исследовательские возможности доступными для студентов, интересующихся биофизикой. Мы включили обсуждение корреляционной функции интенсивности, относящейся к FCS, и того, как ее можно определить по времени прихода фотонов.Мы демонстрируем систему с измерением гидродинамического радиуса белка с использованием FCS, которая подходит для учебной лаборатории бакалавриата. Электроника на основе FPGA, которую легко сконструировать, также подходит для более сложных измерений, и здесь описано несколько приложений. В реализованном виде система имеет временное разрешение 8 нс, может управлять четырьмя лазерными источниками и может собирать информацию с четырех детекторов, считающих фотоны.

    I. ВВЕДЕНИЕ

    Благодаря таким методам, как флуоресцентная корреляционная спектроскопия (FCS) и динамическое светорассеяние (DLS), фотонная статистика уже более 40 лет открывает окно в свойства молекул и материалов.Общим для этих широко используемых методов является необходимость быстрого и эффективного сбора фотонов и расчета функций корреляции фотонов с временным разрешением менее 1 мкс. В последние годы обычным явлением стали фотодетекторы с высоким квантовым выходом и малым темным счетом, что снизило предел обнаружения до уровня, позволяющего регулярно наблюдать флуоресценцию отдельных молекул. В то же время наличие быстрой схемы синхронизации означает, что время прихода каждого обнаруженного фотона может быть определено с высоким разрешением. 1,2 Подробная информация о потоке фотонов предоставила много новых возможностей для изучения статистики фотонов. 1,2 Измерения флуоресценции, чувствительные к отдельным молекулам, которые в настоящее время революционизируют наше понимание молекулярной биофизики, особенно выиграли от лучшего оборудования. Высококачественные коммерческие инструменты 1–3 и программное обеспечение 1,4,5 для оценки статистики фотонов обычно используются в лабораториях биофизики, материаловедческих исследований и оптики.Однако стоимость этих систем, которая колеблется от нескольких тысяч до десятков тысяч долларов, не по карману почти всем учебным лабораториям и многим исследовательским лабораториям. Наша цель состоит в том, чтобы предоставить недорогую электронику и программное обеспечение с открытым исходным кодом, которые привносят в учебную лабораторию современные возможности измерения и анализа фотонной статистики, а также дают ценный урок приборостроения для бесстрашных студентов. Мы включили педагогическое обсуждение корреляционной функции интенсивности, относящейся к FCS, и ее вычисление непосредственно из времени прихода фотонов, которые составляют данные большинства современных инструментов.Эта работа также может оказаться полезной для аспирантов или других исследователей, заинтересованных в создании или лучшем понимании собственного аппаратного и программного обеспечения.

    Все примеры и приложения, описанные здесь, включают обнаружение флуоресценции. Использование флуоресцентных красителей для изучения биологических или органических материалов очень распространено, и многие студенты могут иметь хотя бы некоторый опыт окрашивания. Окрашивание часто состоит из случайного введения красителей и полезно в основном для визуализации. В молекулярной биофизике принято модифицировать конкретную биомолекулу путем ковалентного присоединения флуорофора (молекулы красителя).В той мере, в какой фотофизические свойства флуорофора связаны с физическим движением (включая линейную и вращательную диффузию, складывание, скручивание и изгиб) или химической кинетикой (связыванием) биомолекулы-хозяина, краситель можно использовать в качестве наноскопического репортера эти молекулярные свойства. Фотоны, испускаемые флуорофором, несут информацию о биомолекуле, которая принимается детектором и оборудованием для измерения времени и декодируется с помощью статистического анализа.

    В FCS флуктуации яркости красителя, которые связаны с молекулярной укладкой или связыванием, можно использовать для определения корреляции или времени релаксации для этих процессов. 6 Полезность метода вытекает из соотношения между коэффициентом диффузии D и размером молекулы, определяемым соотношением Стокса-Эйнштейна, 7

    где k B — постоянная Больцмана, T — абсолютная температура, η — динамическая вязкость среды, R h — гидродинамический радиус диффундирующей частицы. В FCS флуоресцентные молекулы могут свободно диффундировать через объем обнаружения (≅ 1 фл) конфокального микроскопа.Время диффузии через объем определяется броуновским движением частицы, которое, в свою очередь, зависит от коэффициента диффузии. Если концентрация флуорофоров достаточно мала, то самые большие флуктуации интенсивности флуоресценции происходят просто потому, что среднее число молекул в объеме детектирования существенно колеблется по мере диффузии молекул внутрь и наружу. Типичное время диффузии молекулы для пересечения объема обнаружения в плоскости, перпендикулярной оптической оси микроскопа, определяется выражением τD=ω02/4D, где ω 0 — радиус цилиндрически симметричный объем обнаружения.Это время диффузии отражено в корреляционной функции интенсивности флуоресценции как характерное время затухания, подробно рассмотренное в гл. III. Если ω 0 известно, определение времени диффузии τ D с использованием FCS дает D и, следовательно, также R ч с использованием уравнения. (1); конкретный пример описан в гл. IV A. Мы отмечаем, что использование FCS для наблюдения за броуновской диффузией и измерения констант равновесия с помощью простого прибора было темой предыдущей статьи в этом журнале, 8 , в которой также были затронуты дополнительные темы, такие как моделирование и подбор данных корреляционной функции. .

    Примерно десять лет назад корреляционные функции фотонов обычно генерировались аппаратными средствами, разработанными специально для этой цели. Этот процесс эффективен, но затратен с точки зрения информации, поскольку представление исходного потока фотонов не сохраняется. В качестве альтернативы запись интенсивности как функции времени может быть сохранена в виде количества фотонов, обнаруженных в последовательных интервалах времени; этот подход используется в работе. 8. Для фотонов, обнаруженных во временных бинах шириной менее 1 мкс, данные об интенсивности могут быть очень разреженными.В FCS нет ничего необычного в том, что средняя скорость счета фотонов составляет несколько кГц; даже при ширине бина 1 мкс подавляющее большинство бинов будет пустым. Лучшей альтернативой является запись времени прихода каждого фотона. Этот метод имеет явное преимущество, заключающееся в том, что он предоставляет наибольшую информацию о потоке фотонов в компактной форме. Корреляционная функция, заданная в FCS

    G(τ)=〈Ia(t)Ib(t+τ)〉〈Ia(t)〉〈Ib(t)〉

    (2)

    можно рассчитать непосредственно по времени прибытия.Здесь I обозначает интенсивность флуоресценции, а индексы a и b могут обозначать данные, полученные в одном канале (т.е. a = b для автокорреляции) или в разных каналах детектора, соответствующих разным цветам. или поляризации (взаимная корреляция). Обсуждения о том, как вычислять корреляционные функции по временам прихода фотонов, существуют в литературе, 4 , но ни одно из них не доступно на уровне бакалавриата.

    Примеры более продвинутых биофизических измерений с использованием этой системы обсуждаются в пп.IV B и IV C. При резонансном переносе энергии флуоресценции (FRET), описанном в гл. IV B к биомолекуле присоединяются два разных красителя, а не один краситель. Изменение расстояния между молекулами красителя регистрируется как изменение их относительной интенсивности флуоресценции, являющееся результатом резонансного диполь-дипольного взаимодействия. Комбинируя FRET с FCS, 9 , временной масштаб и характер флуктуаций молекулярной структуры, происходящих в нанометровом масштабе, можно определить с временным разрешением, ограниченным только электроникой.

    Для обеспечения быстрого многоканального обнаружения и управления несколькими источниками возбуждения флуоресценции (например, лазерными линиями с разной длиной волны для возбуждения разных красителей) электроника основана на программируемой пользователем вентильной матрице (FPGA). Используя ПЛИС, электронику легко сконструировать, как обсуждалось в разд. II и в дополнительных материалах, а также дает возможность изучить инструменты, которые станут хорошим мостом для студентов, заинтересованных в экспериментальных исследованиях.Описанный прибор имеет восемь входных каналов, четыре выхода секвенсора для управления возбуждающим светом и временное разрешение 8 нс без мертвого времени между событиями. Использование ПЛИС обеспечивает гибкость конструкции; в частности, количество и конфигурация входных и выходных каналов легко модифицируются в соответствии с различными экспериментальными требованиями. Используемая здесь ПЛИС стоит менее 200 долларов. С необходимым генератором, разъемами и коммутационной коробкой общая стоимость составляет менее 400 долларов. Программное обеспечение и прошивка, необходимые для реализации и запуска устройства, включены в дополнительный материал. 10

    Высококачественные системы (например, от Picoquant или Becker & Hickl), предназначенные для более требовательных приложений подсчета одиночных фотонов с временной корреляцией, имеют точность синхронизации, измеряемую в пикосекундах, и стоимость, измеряемую десятками тысяч долларов. Домашние системы на основе карт сбора данных, таких как National Instruments PCI 6602, могут быть построены примерно за 2000 долларов, но обеспечивают разрешение только в микросекундах. 11 Плата с временным разрешением 42 нс и четырьмя входными каналами продается компанией ISS примерно за 15 000 долларов.Ни одна из этих систем не имеет выходных каналов для управления лазером.

    II. ИНСТРУМЕНТЫ

    A. Оптика

    Минимальное оптическое оборудование, необходимое для FCS, состоит из конфокального микроскопа, лазера, фильтров и детектора. Ригер и др. 8 Дайте подробное описание, включая список деталей, для самодельного микроскопа FCS, подходящего для использования в учебных лабораториях, который включает в себя лазер и детектор примерно за 6000 долларов США. Комплект системы FCS с открытой рамой, подходящий как для учебных, так и для исследовательских целей, в настоящее время разрабатывается в сотрудничестве с Thorlabs.Стоимость этой установки, включая лазер DPSS и детектор, может составлять около 10 000 долларов.

    Оптика, использованная в нашем эксперименте, схематично показана на рис. Возбуждающий свет подается в микроскоп через одномодовое оптическое волокно, которое также служит пространственным фильтром вместо точечного отверстия в Rieger et al. 8 Акустооптический настраиваемый фильтр (AOTF, номер детали NEOS 48058-5-.55) используется для переключения между линиями возбуждения, но не обязательно должен быть включен в обучающее устройство, использующее одну лазерную линию.Перед дихроичным зеркалом необходимо установить узкополосный одно- или двухполосный фильтр возбуждения, чтобы устранить утечку из нежелательных лазерных линий или накачки твердотельного лазера с диодной накачкой. Дихроичное зеркало отражает свет возбуждения и пропускает флуоресценцию с большей длиной волны. Телескоп после волоконного коллиматора служит двум целям. Во-первых, он увеличивает диаметр лазерного луча, чтобы он соответствовал размеру задней апертуры объектива. Это гарантирует, что вся числовая апертура (NA) объектива используется для фокусировки лазерного луча, тем самым минимизируя соответствующий фокусный объем.Телескоп также служит для отображения первого зеркала в задней фокальной плоскости объектива, что значительно упрощает юстировку микроскопа. В качестве объектива использовался Olympus UPlanSApo 60× с числовой апертурой 1,2. Для FCS необходима высокая числовая апертура по воде или нефти. Ограниченный дифракцией фокусный объем этих линз обычно составляет 1 фл, что приводит к такому же небольшому и четко определенному объему обнаружения, который удовлетворяет требованиям низкого фона для FCS или обнаружения с одним флуорофором.

    Схема оптики.Объект: цель; AOTF: акустооптический перестраиваемый фильтр; FPGA: программируемая пользователем вентильная матрица; дет: детектор. Детекторы, считающие фотоны, генерируют импульсы уровня ТТЛ, время прихода которых регистрируется ПЛИС. FPGA также контролирует работу AOTF и регистрирует время изменения ее состояния.

    Флуоресценция из фокального (обнаруживающего) объема микроскопа собирается обратно через объектив и визуализируется через точечное отверстие диаметром 50 мкм. Размер точечного отверстия зависит от выбора объектива, диаметра луча и фокусирующей линзы (тубусной линзы) и примерно выбирается в соответствии с размером фокального пятна. 12 Тубусная линза под дихроиком должна быть хорошим ахроматом, чтобы избежать аберраций в пинхоле. Юстировка прибора с одним детектором подробно обсуждается в [1]. 8.

    В описанных здесь экспериментах используются два детектора. В корреляционной спектроскопии флуоресценции (FCS) часто бывает удобно использовать неполяризующий светоделитель между двумя детекторами, чтобы прибор располагался в конфигурации Hanbury Brown and Twiss (HBT) 13 с двумя детекторами, измеряющими один и тот же сигнал. .В этой конфигурации взаимная корреляция нечувствительна к мертвому времени детектора и послеимпульсам. 14 Например, при одноканальном измерении невозможно наблюдать корреляции ниже мертвого времени детекторов, которое обычно составляет десятки наносекунд. Ниже 1 мкс в сигнале преобладают послеимпульсы детектора. В конфигурации HBT синхронизация фотонов между каналами ограничена только скоростью электроники, которая не имеет собственного мертвого времени. 2

    Детекторы также можно настроить для поляризационных и/или двухцветных измерений, заменив неполяризующий светоделитель на поляризационный светоделитель или дихроичное зеркало.Детекторы, используемые в наших экспериментах, представляют собой высокоэффективные модули для подсчета фотонов с низким уровнем темнового счета, такие как фотоумножитель модели H7421-40 компании Hamamatsu или лавинный фотодиод, подсчитывающий одиночные фотоны τ-SPAD компании Picoquant. Менее дорогой альтернативой, подходящей для учебной лаборатории, является Hamamatsu h20682-110 стоимостью около 1300 долларов. Все эти устройства генерируют выходные импульсы уровня ТТЛ.

    B. Электроника

    Схема электроники, используемой в наших измерениях, показана на .Устройство построено на макетной плате KNJN Xylo EM FPGA. Эта плата включает в себя ПЛИС Altera Cyclone II (EP2C5), подключенную к главному компьютеру через USB-интерфейс Cypress FX2. Никаких дополнительных аппаратных средств или модификаций Xylo не требуется, хотя внешний кварцевый генератор на 32 МГц был установлен на чипе и умножен на 128 МГц для достижения временного разрешения 7,8 нс. Обзор работы электроники описан здесь. Подробную информацию о конструкции можно найти в дополнительных материалах. 10

    Схема электроники. Устройство построено на макетной плате KNJN Xylo EM FPGA. Эта плата включает в себя ПЛИС Altera Cyclone II (EP2C5), подключенную к главному компьютеру через USB-интерфейс Cypress FX2. Tagger записывает время прихода фотонов от четырех детекторов на стробоскопических каналах и события секвенсора (Seq) на дельта-каналах. Секвенсор управляет переключением лазерной линии, если это необходимо, через AOTF.

    Аппаратура записывает время прихода импульсов уровня ТТЛ от четырех устройств счета фотонов и обеспечивает четыре цифровых выходных линии для экспериментального контроля.Здесь выходы управляют акустооптическим перестраиваемым фильтром (AOTF), который используется для переключения между длинами волн возбуждения. Для однолинейного возбуждения, обычно используемого в учебной лаборатории, выходные линии не используются.

    Прошивка ПЛИС 15 основана на конструкции детектора множественных совпадений с метками времени, разработанной Поляковым и др. 16 Код был адаптирован и расширен для включения дополнительных входных каналов и цифровых выходов для экспериментального управления и синхронизации.Прошивка разделена на два логических блока: таймер и секвенсор.

    Теггер времени (Tagger in ) отвечает за запись времени поступления событий на набор входов. Входы обозначены как «дельта» и «строб» и требуют сигналов уровня TTL. Дельта-входы фиксируют изменения цифровых выходных каналов (события секвенсора), а стробирующие входы записывают сигналы синхронизации фотонов. Типы данных Strobe и Delta записываются Tagger с использованием формата, показанного на рис. Первые 36 бит содержат время события в тактах, а старшие биты содержат вспомогательную информацию о событии.Для стробирующих событий биты 37–40 указывают исходный канал (или каналы) события. Для дельта-событий биты 37–40 записывают состояние секвенсора сразу после изменения. Бит 46 указывает тип события (строб или дельта). Биты 47 и 48 указывают на переполнение счетчика и события сброшенной записи соответственно.

    Формат записи данных. Первые 36 бит содержат время события в тактах. Старшие биты записи содержат вспомогательную информацию о событии. Биты 37–40 указывают исходный канал (или каналы) события, а бит 46 указывает тип события (строб или дельта).Биты 47 и 48 указывают на переполнение счетчика и события сброшенной записи соответственно.

    Модуль секвенсора предназначен для управления лазерными источниками возбуждения. Каждый канал секвенсора может быть запрограммирован на создание периодического сигнала TTL. Выходы секвенсора можно использовать, например, для управления цифровыми входными каналами AOTF, тем самым контролируя длину волны возбуждающего света. Изменения выходных сигналов секвенсора и, следовательно, длины волны (длин волн) возбуждения записываются на входах дельта-канала тегера событий, как описано выше.Таким образом, переходы выходного состояния секвенсора фиксируются вместе с фотонными событиями, записанными с использованием стробирующих каналов. Это облегчает реализацию переменного лазерного возбуждения, как описано в гл. IV C. С различными электрооптическими элементами стробоскопические каналы также можно использовать для переключения поляризации или фотоактивации.

    Пакеты программного и микропрограммного обеспечения для программирования и запуска электроники на платформе Linux, а также инструкции по установке включены в Дополнительный материал. 10 Эти материалы включают необходимые прошивки (в пакетах « timetag-fpga » и « timetag-fx2 »), пользовательский интерфейс для экспериментального контроля («timetag-tools»), а также средства обработки и анализа данных написан на Python и C++ («фотонные инструменты»).

    III. РАСЧЕТ КОРРЕЛЯЦИОННОЙ ФУНКЦИИ ДЛЯ FCS

    A. Концептуальный обзор

    Корреляционная функция, используемая в FCS, определяется формулой. (2). Интенсивность I ( t ) обычно не является непрерывной функцией времени, а состоит из дискретных событий прибытия фотонов.Средние скорости счета фотонов в FCS обычно находятся в диапазоне от 1 до 100 кГц. Однако временная шкала, представляющая интерес для большинства измерений, часто значительно ниже 1 мс, а данные собираются с точностью синхронизации от 1 пс до 1 мкс. Разреженность данных об интенсивности делает неэффективными традиционные численные схемы хранения данных и выполнения расчетов. Рассмотрим, например, сбор отсчетов фотонов за время 90 453 T 90 454 во временных бинах шириной Δ 90 453 t 90 454 . Для разреженных данных необходимое количество бинов (90 453 T 90 454 /Δ 90 453 t 90 454) намного превышает общее количество полученных фотонов, которое обычно составляет порядка 10 6 –10 8 .В этом случае эффективнее и информативнее регистрировать моменты прихода фотонов напрямую.

    Начнем наше концептуальное обсуждение с обычной дискретизации I ( t ) в массив I ( t i ) с T t 9 элементов. Числитель в уравнении (2) можно считать «запаздывающим точечным произведением». Смысл этого можно понять с помощью , который иллюстрирует случай, когда канал a и канал b имеют по 20 бинов.Каждый элемент матрицы (маленький квадрат) представляет произведение I a ( t i ) I b ( t j ). Числитель уравнения. (2) при τ = 0 представляется суммированием по главной диагонали на диаграмме, для которого j = i . Точно так же при τ = 4 числитель представляется суммированием по пути, параллельному главной диагонали, для которого j = i + 4, как показано на рисунке.

    Графический пример расчета скалярного произведения с запаздыванием в числителе уравнения (2) с различными граничными условиями. Индексы i и j используются для обозначения конкретных ячеек в канале a и b соответственно. Каждый квадрат содержит произведение I a ( t i ) I b ( t j ). Для темных граничных условий скалярное произведение при заданном запаздывании представлено суммой матричных элементов вдоль линии, параллельной главной диагонали.При 20 бинах на канал периодические граничные условия приводят к тому, что матричные элементы при τ = −16 вносят вклад в скалярное произведение при τ = 4. Расширенные граничные условия используют только те матричные элементы, которые находятся внутри заштрихованной области.

    Граничные условия также показаны на . Мы рассматриваем три возможности: периодические границы, «темные» границы и «расширенные» границы. В случае периодических границ с 20 элементами в каждом канале (), оценка числителя в уравнении. (2) для отставания τ = 4 включает как путь с τ = 4, так и путь с меткой τ = −16.При использовании периодических границ всегда будет 90 453 T 90 454 / Δ 90 453 t 90 454 квадратов, вносящих вклад в скалярное произведение с запаздыванием. Это упрощает вычисление знаменателя в уравнении. (2), так как его необходимо вычислить только один раз для конкретного выбора размера ячейки. Однако расчет G (τ) с периодическими границами может иногда давать нефизические результаты, если I ( t ) не является периодическим и имеет корреляции на временных шкалах, не намного меньших, чем T .Периодические границы подразумеваются при использовании преобразования Фурье для вычисления корреляционной функции.

    Для темных граничных условий мы включаем только путь с меткой τ = 4 в вычисление запаздывающего скалярного произведения. Как следствие, количество участвующих квадратов уменьшается по мере увеличения отставания. Знаменатель в уравнении (2) должны отражать средние значения только по той части каждой интенсивности, которая используется в соответствующем числителе и изменяется при каждом τ. То же самое подмножество данных, которое вносит свой вклад в числитель в уравнении.(2) также дает вклад в знаменатель. В некоторых обработках знаменатель в уравнении. (2) написан как < I A ( T )> < I B ( T + τ)> Укажите, что < I A ( T )> вычисляется в диапазоне 0 < t i < T − τ, а 〈 I b ( t + τ)〉 рассчитывается в диапазоне τ < t i Т .

    Для расширенных граничных условий используются только данные внутри заштрихованного параллелограмма. В каждом расчете G (τ) используется одинаковое количество квадратов и примерно одинаковое количество фотонов. Данные в канале a с t i > T − τ max вообще не будут использоваться, где τ max — максимальное вычисляемое время задержки. Подмножество данных в канале b , которое вносит вклад в корреляционную функцию, изменяется с каждым временем задержки: вклад вносят только данные в окне между τ < t j < T + τ − τ max .Знаменатель в уравнении (2) не меняется систематически с τ, но будет колебаться по мере изменения данных, влияющих на числитель. В правильно спланированном эксперименте T ≫ τ max и лишь небольшое количество данных не используется. Здесь реализованы расширенные границы.

    Из видно, что вычисление числителя уравнения. (2) требует примерно 90 453 T 90 454 /Δ 90 453 t 90 454 расчетов при каждом лаге τ ≪ 90 453 T 90 454 . Таким образом, количество операций, необходимых для вычисления G (τ) для всех τ с фиксированным разрешением Δ t , имеет вид ( T t ) 2 .Требуемое время может быть значительно сокращено с помощью алгоритма «мульти-тау», 17 , изначально введенного для аппаратных корреляторов, чтобы уменьшить количество задержек τ, при которых вычисляется G (τ). По мере увеличения интервала между временами запаздывания ширина бина также увеличивается, что приводит к расчету, который требует только ( T t )log( T t ) операций. 17 Стоит отметить, что вычисление G (τ) из преобразования Фурье спектра мощности 18 также масштабируется с ( T t )log( T t ), но сохраняет исходное разрешение Δ t между последовательными τ.

    Пример ребиннинга, необходимого для реализации алгоритма с несколькими тау, показан на . Каждый квадрат содержит произведение I a ( t i ) I b ( t j ). Корреляционная функция при заданном запаздывании представлена ​​суммой матричных элементов вдоль линии, параллельной диагонали, где G (0) задается суммой по диагонали при выбранных граничных условиях. Первые восемь вычислений (0 ≤ τ ≤ 7) используют размер ячейки Δ t .Начиная с τ = 8 размер бина удваивается. По перекрытию малых и больших квадратов при τ = 8 видно, что часть фотонов, давших вклад в сумму при τ = 7, дает вклад и в τ = 8. Это приводит к некоторому сглаживанию корреляционной функции на границах ребиннинга , и будут способствовать корреляциям более высокого порядка, которые могут усложнить анализ неопределенностей. По этим причинам повторный биннинг обычно выполняется только один раз на октаву: при τ = 16 размер бина снова удваивается до 4Δ t .

    Графическое представление вычисления лагового скалярного произведения с повторным объединением для обычных списков с последовательным разделением. Каждый квадрат содержит произведение I a ( t i ) I b ( t j ). Числитель уравнения. (2) при заданном отставании представляет собой сумму элементов матрицы вдоль линии, параллельной диагонали, причем G (0) определяется суммой по самой диагонали. Ссылаясь на гл.III B, в этом примере Γ = 4 и ℓ = 1. На первом этапе расчета 0 ≤ τ ≤ 7. Начиная с τ = 8 размер бина равен ℓ = 2. При τ = 16 размер бина удваивается опять таки. Небольшое количество бинов и относительно большое время задержки используются для упрощения этого примера; в хорошо спланированном эксперименте T ≫ τ max и только небольшая часть матрицы вокруг диагонали дает вклад в сигнал.

    B. Вычисление по временным меткам

    Можно более эффективно вычислять G (τ) путем распознавания и использования разреженного характера данных. 4 Рассмотрим список времен прибытия фотона и связанного с ними счетчиками фотона {( T 1 , μ 1 ), ( T 2 , μ 2 ), … ( T α , μ α )}, часто сокращенно {( t , μ)} с элементами α. Времена прибытия t i измеряются с точностью ℓ, которая кратна времени аппаратных часов Δ t ; для необработанных данных имеем ℓ = Δ t . В этом компактном представлении данных количество фотонов μ i всегда больше или равно единице.Для очень разреженных данных μ i = 1 и количество записей α = M , где M — общее количество обнаруженных фотонов. Для плотных данных времена прихода t i являются последовательными, а μ i — это просто количество фотонов в ячейке i th . Количество записей в списке совпадает с количеством бинов α = N T /л. Если теперь мы рассмотрим два таких списка {( t a , µ a )} и {( t b , µ b 3 ) с элементами α, 9005 3 соответственно уравнение(2) можно аппроксимировать как

    G(τ)=1N∑i,jμiaμjbδti,τ+tjMaNMbN,

    (3)

    где Ma=∑iμia и Mb=∑jμjb — общее количество фотонов в каждом списке, а δ — дельта Кронекера. Пределы суммы по i и j зависят от выбора граничных условий, как обсуждалось выше. Мы предположили, что точность измерения временных меток одинакова в обоих списках. Для разреженных данных каждое вычисление этой суммы требует M a + M b вычислений (общее число фотонов), что может быть на много порядков меньше, чем T t .Сумма в числителе уравнения (3) представляет собой запаздывающее скалярное произведение дискретизированных интенсивностей, выраженное в компактной форме. Наша реализация этого компактного скалярного произведения с запаздыванием описывается псевдокодом, показанным на рис.

    Псевдокод, представляющий запаздывающий скалярный продукт с использованием компактного представления данных, {( t , μ)}, где t — это список меток времени и μ, которые всегда ≥1 , количество фотонов, прибывающих в бин в момент времени t .Список {( t a , µ a )} содержит α элементов, а список {( t b , µ b )} содержит β элементов. τ — время запаздывания, измеряемое в единицах ширины ячейки ℓ. Символ стрелки «←» является оператором присваивания и часто читается как «получает».

    Для реализации мультитау-анализа 17 расстояние между лагами (Δ t ) увеличивается поэтапно с τ, а ℓ также увеличивается, уменьшая N .Размер ячейки ℓ выбран таким образом, чтобы он был достаточно меньше τ, чтобы избежать широко обсуждаемой треугольной ошибки в аппроксимации уравнения. (2). 19 Наша реализация шага округления (т. е. повторного биннинга) для анализа с несколькими тау описывается псевдокодом, показанным на рис.

    Псевдокод для изменения размера бина (который совпадает с разрешением временных меток t ) в два раза. Символ «←» является оператором присваивания и часто читается как «получает», а «⌊⌋» означает нижнюю границу.Поскольку метки времени t являются целыми числами, деление на два с последующим оператором нижней границы эффективно увеличивает размер ячейки в два раза.

    Полный расчет G (τ) описывается псевдокодом, показанным на рис. Расчет организован в несколько этапов. Минимальное временное разрешение или размер ячейки ℓ = Δ t используется только для первых 16 возможных времен запаздывания, где 0 ≤ τ ≤ 15Δ t . После этого размер бина и шаги по Δτ увеличиваются в два раза в начале каждого этапа.После первых 16 лагов новая стадия начинается при каждом удвоении времени лага, т. е. на каждой октаве по τ. На каждом этапе, кроме первого, оцениваются Γ различных равноотстоящих значений τ; по умолчанию Γ = 8. После оценки первых 16 лагов размер ячейки удваивается для следующих 8 лагов, 16Δ t ≤ τ ≤ 30Δ t (8 ≤ τ g ≤ 15, где τ г выражается в единицах нового размера бункера ℓ = 2Δ t ). Размер ячейки продолжает удваиваться с каждой октавой в τ.

    Псевдокод для расчета уравнения (3) с ребиннингом, как описано в тексте; τ — это время задержки, измеряемое в единицах ширины ячейки ℓ, а ← — оператор присваивания, который часто читается как «получает». После первого этапа расчета G (τ) оценивается при Γ различных равноотстоящих значениях времени запаздывания τ в диапазоне от Γτ до (2Γ − 1)τ для каждой октавы в время задержки. Здесь N T /л, M a и M b — общее количество фотонов в каждом списке, а T — общее время измерения, которое предполагается быть одинаковым в обоих каналах.

    Знаменатель в уравнении. (3) дается произведением общего числа фотонов в каждом компактном списке на N 2 . Общее время измерения T эксперимента обычно одинаково в обоих каналах, в этом случае N = T /л также одинаково в обоих каналах. При заданном размере бина ℓ и для большинства экспериментальных условий (т. е. T ≫ τ max и система в равновесии) знаменатель будет изменяться лишь незначительно при каждом τ (если вообще изменится) в способ, который зависит от граничных условий.

    C. Расчет неопределенности корреляционной функции

    Наиболее простым методом определения экспериментальной неопределенности корреляционной функции является вычисление стандартного отклонения среднего значения нескольких измерений. 20 Обычно одна серия данных содержит 10 6 –10 7 фотонов. Разделив данные на 90 453 Q 90 454 последовательных подмножеств (где обычно 90 453 Q 90 454 = 10), мы вычисляем

    σ(τ)=〈G(τ)2〉−〈G(τ)〉2Q−1,

    (4)

    который работает до тех пор, пока G (τ) → 1 при больших временах задержки и выборка находится в равновесии (дрейф сигнала от подмножества данных к подмножеству данных отсутствует).

    Статистическая неопределенность и погрешность в G (τ) были подробно рассмотрены и обсуждены Саффарианом и Элсоном, 21 , которые основывают большую часть своего обсуждения на более ранней работе Шатцеля. 19,22 Хорошее понимание неопределенности в данных корреляции требует модели лежащей в основе фотофизики сигнала. Расчет неопределенности с использованием уравнения. (4) не дает полной картины неопределенности корреляционной функции; в частности, вычисление стандартного отклонения не описывает сильно коррелированный шум при различных временах задержки, который следует ожидать при коротких задержках. 23

    IV. ПРИМЕРЫ

    В этом разделе мы опишем несколько измерений, выполненных с использованием аппаратного и программного обеспечения, описанного в этой статье. Первый пример, как и примеры в Rieger et al. , 8 подходит для использования в учебной лаборатории. Другие примеры более сложны для реализации, но служат введением ко многим другим методам биофизических измерений, которые возможны с этой системой. Эти примеры также могут быть интересны аспирантам и исследователям, заинтересованным во внедрении этой недорогой системы в своих лабораториях.

    A. Измерение гидродинамического радиуса флуоресцентного белка

    Флуоресцентные белки, которые были впервые выделены из медузы Aequorea victoria , стали одним из наиболее распространенных зондов экспрессии, локализации и транспорта белков в живых клетках. 24 Желтый флуоресцентный белок (YFP, молекулярная масса 27 кДа) можно приобрести в лиофилизированной форме у Biovision Inc. Кроме того, его можно экспрессировать с использованием плазмиды pEYFP-C1, доступной через Clontech.

    YFP готовили до конечной концентрации белка 5,0 нмоль/л в 50 ммоль/л глицина (pH = 7) и 0,16 ммоль/л детергента Tween 20. Детергент помогает предотвратить агрегацию белков и поверхностную адсорбцию. Подготовка и загрузка ячейки образца, покрытой бычьим сывороточным альбумином (БСА), описана Rieger et al. 8 Образец помещается на предметный столик микроскопа, а фокус располагается приблизительно на 30 мкм выше поверхности покровного стекла. YFP возбуждали линией 514 нм аргон-криптонового лазера.Интенсивность линии, измеренная перед объективом, составляла 10 мкВт. Флуоресценцию YFP обнаруживали в одном канале (канал 0) с использованием APD (модель Perkin Elmer SPCM-AQRH-15).

    Данные были собраны с использованием графического пользовательского интерфейса прибора для измерения времени, который можно загрузить и установить из пакета «инструменты для определения времени» в дополнительных материалах. 10 После запуска щелчком по значку «Timetag UI» пользователь может установить время сбора данных или остановить и начать сбор данных вручную.Графический пользовательский интерфейс также можно использовать для контроля скорости счета детектора, и он постоянно обновляет корреляционные функции в ходе измерения.

    Пример типичных данных, полученных с помощью этой системы, показан на рисунке, где время прихода фотонов на детектор канала 0 нанесено на график в зависимости от количества фотонов в течение периода в одну секунду. Гистограмма временных меток в интервалах по 1 мс дает более знакомый график зависимости интенсивности (в фотонах/мс) от времени, показанный на рис. Функция корреляции создается с помощью команды fcs-corr в пакете photon tools , представленном в дополнительном материале 10 , и показана на рис.

    Пример одноканального набора данных. Образец представляет собой YFP с концентрацией 5 нмоль/л, как описано в тексте. (a) Небольшой сегмент набора данных 3,2 × 10 6 фотонов, показывающий время прибытия фотонов в зависимости от числа фотонов для фотонов, прибывающих между 3 и 4 с после начала сбора данных. (b) Гистограмма данных временной метки, показанная в (a), отображающая количество фотонов, прибывающих в каждый бин 1 мс. (c) Ромбики: корреляционная функция и неопределенности, рассчитанные по полному набору данных. Планки погрешностей, которые меньше, чем символы, за исключением короткой задержки, рассчитываются с использованием уравнения.(4). Линия является результатом подгонки с использованием уравнения. (6); параметры наилучшего соответствия: n = 1,68 ± 0,02, τ D = 209 ± 3 мкс, τ dk = 50 ± 1 мкс, F = 0,42 ± 0,01. χ 2 на степень свободы для этой подгонки составляет 0,94.

    Как описано в Ref. 8, корреляционные данные часто можно аппроксимировать с помощью модели, предполагающей свободную диффузию флуорофора.

    GD(τ)=1n[1+ττD]−1[1+τw2τD]−1/2,

    (5)

    где n — среднее число частиц в объеме обнаружения, τ D — время диффузии через среднеквадратичное значение перетяжки пучка, а w — отношение сторон объема обнаружения, которое аппроксимируется цилиндрической симметричная трехмерная гауссова с ω02=ωz2/w2, где w — отношение сторон объема, а ω z — осевой радиус.Поскольку данные корреляции, показанные здесь, рассчитаны с более короткими задержками, чем это возможно в Ref. 8, мы также должны учитывать существование «темнового» состояния, скорее всего, фотоизомера 25 , которое вызывает флуктуации флуоресценции в более коротком временном масштабе, чем диффузия частиц. Предполагая, что переходы в темное состояние и из темнового состояния не влияют на диффузию, можно разделить диффузионную и фотофизическую динамику так, что

    г ( τ ) = г 3 г D 3 ( τ ) G D K ( τ ),

    (6)

    куда

    Gdk(τ)=[1−F+F exp(−ττdk)].

    (7)

    Здесь F — вероятность нахождения молекулы в темновом состоянии при равновесии в поле возбуждения, а τ dk — кинетическое время когерентности, связанное с накоплением этой популяции. 26 Используя калибровочное измерение, как описано в гл. VB Rieger et al. , 8 находим для нашего прибора w = 10,3 ± 3 и ω 0 = 278 ± 13 нм.

    Чтобы найти гидродинамический радиус белка, мы подгоняем уравнение.(6) к данным на рис. Для броуновского движения в двух измерениях время диффузии определяется как τ D = ω 0 /4 D , из которого можно определить D . Используя уравнение (1) и распространяя неопределенности в w и τ D , находим29 ± 0,12 нм. Это согласуется с ранее опубликованными значениями гидродинамического радиуса близкородственного зеленого флуоресцентного белка (GFP). 27

    показаны типичные данные, полученные для белковых агрегатов, меченных YFP, получение которых описано в дополнительных материалах. 10 В этом случае диффузия по объему образца медленная, а поскольку в белковых частицах присутствует несколько флуорофоров, сигнал намного ярче. Отдельные частицы могут быть обнаружены как большие яркие всплески в .Из корреляционной функции, показанной с помощью корреляционной функции мономера YFP, сразу видно, что время диффузии для этих агрегатов с их большими значениями R ч намного больше, чем время диффузии для YFP.

    Образец агрегированного белка. (a) Небольшой сегмент набора данных 2,8 × 10 6 фотонов, показывающий время прибытия фотонов в зависимости от количества фотонов для фотонов, прибывающих между 3 и 4 с после начала сбора данных. (b) Гистограмма данных временной метки, показанная в (a), отображающая количество фотонов, прибывающих в каждый бин 1 мс.Здесь заметные пики соответствуют отдельным, очень ярким белковым скоплениям, диффундирующим через объем обнаружения. (c) Квадраты: корреляционная функция, рассчитанная по агрегированному образцу белка, часть которого показана на (a) и (b). Треугольники: корреляционная функция YFP, увеличенная для сравнения с агрегированным белком. Линии соответствуют формуле. (6) к данным.

    B. Двухканальный эксперимент, демонстрирующий FRET

    Пример двухканальных данных, полученных с помощью этой системы, показан на рис.Образец, используемый в этом измерении, представляет собой двухцепочечную ДНК, дважды помеченную парой красителей, цианином 3 (Cy3) и цианином 5 (Cy5), подходящим для демонстрации переноса энергии флуоресцентного резонанса (FRET). ДНК, которая описана в разделе ДНК, описанном в дополнительных материалах, 10 , была разбавлена ​​до 6,6 нмоль/л в 20 ммоль/л Hepes-NaOH ( p H = 7,5) и 50 ммоль/л NaCl.

    Пример двухканальных данных. Образец представляет собой олигонуклеотид ДНК с концентрацией 6,6 нмоль/л, описанный в тексте.( а ) Гистограмма данных временной метки, показывающая количество фотонов, прибывающих в каждый бин 1 мс за интервал 1 с. Для наглядности оба канала немного смещены от нуля, а донорский канал изображен инвертированным. (б) Ромбики: корреляционная функция акцепторного канала; Треугольники: корреляционная функция донорских каналов; Квадраты: функция взаимной корреляции. Планки погрешностей рассчитываются с использованием уравнения. (4).

    FRET описывает безызлучательный перенос энергии, который происходит между возбужденным диполем (донором, здесь Cy3) и другим диполем (акцептором, здесь Cy5), когда спектр поглощения акцептора и спектр излучения донора перекрываются. 28 Вероятность передачи энергии, также называемая эффективностью FRET E , зависит от расстояния R между двумя диполями и может быть выражена как

    Расстояние Ферстера R 0 можно рассчитать по спектральным свойствам донора и акцептора и их взаимной ориентации. 28–30 Типичное значение R 0 для свободно вращающихся красителей составляет 5 нм, что делает FRET чувствительной «спектроскопической линейкой» 29 в небольшом диапазоне около R 0 .В двухканальной FCS наличие FRET приводит к антикорреляции между сигналами донора и акцептора, которая подавляет амплитуду взаимной корреляции: высокий FRET означает, что сигнал донора подавляется в присутствии акцептора.

    Для данных, показанных в , донор возбуждался линией 514 нм аргон-криптонового лазера. Мощность возбуждения перед входом в микроскоп номинально составляла 10 мкВт. Флуоресценцию Cy3 и Cy5 регистрировали в отдельных каналах с использованием дихроичного зеркала между двумя детекторами в .Данные были получены в течение 10 минут, и было собрано более 4,1 × 10 6 фотонов в акцепторном канале и 1,6 × 10 6 фотонов в донорном канале.

    показывает типичный интервал данных продолжительностью в одну секунду, гистограммированный в интервалах по 1 мс. показывает функции авто- и кросс-корреляции для всего набора данных. Автокорреляция донорного канала показана треугольниками, а акцепторного канала – ромбами. В отсутствие акцептора неизбежные перекрестные помехи из канала Cy3 в канал Cy5 приводят к корреляции сигнала между этими каналами.В этом случае все авто- и кросс-корреляции имеют примерно одинаковую амплитуду, отражая в первую очередь концентрацию доноров Cy3. Наличие пары FRET приводит к антикоррелированному сигналу, который проявляется как существенно подавленная взаимная корреляция [квадраты в ]. Взаимная корреляция также свободна от большого пика послеимпульса детектора, который доминирует над автокорреляциями для τ < 2 мкс.

    C. Переменное лазерное возбуждение и FRET одной молекулы

    Более мощный метод измерения FRET использует чередующееся лазерное возбуждение (ALEX) донорного и акцепторного красителей и достаточно низкую концентрацию образца, чтобы никогда не было более одной молекулы в объеме обнаружения. 31 Детекция, чувствительная к отдельным молекулам, позволяет различать субпопуляции биомолекул, а ALEX позволяет различать состояния с низким FRET и сигнал, возникающий от биомолекул с неактивными или отсутствующими акцепторными красителями («донорный» сигнал) . Для реализации ALEX мы использовали AOTF для переключения между донорной и акцепторной линиями возбуждения.

    ALEX продемонстрирован при использовании той же ДНК с двойной меткой, что и в экспериментах, описанных в разд. IV B, за исключением того, что проба разбавляется до такой степени, что в объеме обнаружения никогда не бывает более одной молекулы за раз (50 пмоль/л).Cy3 возбуждался при 514 нм при 205 мкВт, а Cy5 при 647 нм при 42 мкВт. Свет возбуждения переключался каждые 50 мкс с использованием выходов секвенсора для управления AOTF. Флуоресценция Cy3 и Cy5 была обнаружена в каналах 0 и 1 соответственно. Флуоресценцию, полученную при возбуждении на длине волны 514 нм (возбуждение донора), можно отличить от возбуждения на длине волны 647 нм (возбуждение акцептора). В , метки времени, равные одной секунде, гистограммируются с интервалами в 1 мс. Три отдельные кривые представляют (а) фотоны донорного канала во время возбуждения донора, (б) фотоны акцепторного канала во время возбуждения донора (от FRET) и (в) фотоны акцепторного канала во время возбуждения акцептора.Всплески фотонов, представляющие одиночные флуоресцентные молекулы, пересекающие объем обнаружения, очевидны во всех трех измерениях. Для каждого фотона (строб-события) канал обнаружения записывается битами Канала, а источник возбуждения определяется состоянием битов Канала в предшествующем дельта-событии. В общей сложности 663 656 фотонов было получено во всех трех каналах в течение 465 с этого измерения. Наборы данных ALEX обычно содержат столько же или более дельта-событий от секвенсора, сколько и строб-событий от детекторов; эти два отличаются битом типа записи в слове данных ().

    Демонстрация FRET с АЛЕКСОМ. Панели (a)–(c) представляют собой гистограммы данных временной метки, показывающие количество фотонов, прибывающих в каждый бин 1 мс в интервале 1 с: (а) флуоресценция в донорном канале при возбуждении донора, (б) флуоресценция в акцепторном канале при возбуждении донора и (в) флуоресценция в акцепторном канале при возбуждении акцептора. Пики соответствуют отдельным молекулам, пересекающим объем обнаружения микроскопа. ( d ) График рассеяния стехиометрии в зависимости от отношения близости.(e) Гистограмма коэффициента близости. Большой пик справа соответствует FRET; меньший пик слева представляет молекулы с темными или фотообесцвеченными акцепторами.

    Полезность ALEX становится очевидной на графике разброса стехиометрии в зависимости от коэффициента близости. 31 Стехиометрия определяется соотношением интенсивностей

    S=(IDA+IDD)/(IDA+IDD+IAA),

    (9)

    где нижние индексы обозначают источник возбуждения, а верхние индексы обозначают канал детектирования: D указывает на донор, а A указывает на акцептор.Коэффициент близости определяется как

    и связан с E уравнения. (8), но отсутствуют поправки на фон, перекрестные помехи между двумя каналами, относительный квантовый выход/эффективность детектора и прямое возбуждение акцептора, необходимые для количественного измерения 31 E . В , S и P рассчитаны для всех фотонных всплесков с более чем 30 фотонами; интенсивности I представляют число фотонов в любой конкретной вспышке.Алгоритм байесовского вывода используется для поиска всплесков фотонов непосредственно по временным меткам, 32 , но также можно использовать более простую схему, которая применяет порог к объединенным данным, показанным на рис. Преимущество такого двумерного представления данных заключается в том, что оно позволяет сразу идентифицировать пики, связанные с отсутствующим или фотообесцвеченным донорным или акцепторным красителем. Значения S , близкие к 1, указывают на отсутствие акцептора (только донорный пик), в то время как очень низкие значения S соответствуют отсутствующему донору (только акцепторный пик).Построив данные таким образом, мы сразу же увидим, что низкое значение P с пиком около 0,15 является артефактом фотообесцвечивания акцептора и не связано с конфигурацией молекулы. представляет собой гистограмму коэффициента близости независимо от S ; широкий высокий пик P — это то, что ожидается от этого гибкого олигонуклеотида.

    V. ОБСУЖДЕНИЕ

    В настоящее время доступен широкий спектр флуоресцентных методов для изучения организации, структуры и структурных изменений молекул как в живых системах, так и in vitro .Среди них FCS и FRET, чувствительные к отдельным молекулам, и их варианты, возможно, наиболее широко используются. Хотя оба метода существуют уже много лет, появление и широкое распространение оптических приборов, чувствительных к отдельным молекулам, открыло новую эру в молекулярной биофизике. Мы представили простую и недорогую электронику и программное обеспечение с открытым исходным кодом, которые предоставляют самые современные возможности как для учебных, так и для исследовательских лабораторий. Предоставляя выходы для управления лазером, эта система позволяет проводить эксперименты с несколькими красителями в нескольких модальностях без каких-либо физических изменений в аппаратуре или необходимости перепрограммирования.Это существенно увеличивает информативность данных и упрощает план эксперимента и контроль.

    В дополнение к измерениям, рассмотренным в гл. IV, отметим, что эта система может с равным успехом использоваться в студенческой лаборатории для измерения кинетики межмолекулярных взаимодействий, 8 для выполнения коррелированных по времени экспериментов по подсчету одиночных фотонов, относящихся к основам квантовой механики, 33 и для изучения фазы переходы или измерить размер частиц с помощью динамического светорассеяния. 34

    Электроника, описанная в этой статье, может быть использована в исследовательской лаборатории, так как имеет несколько входных и выходных каналов. Например, трех- и четырехцветный FRET 35 с многоцветным ALEX 36 и измерения совпадений с несколькими красителями легко реализовать, как и использование фотоактивации. Добавляя соответствующие электрооптические элементы, электронику можно использовать для переключения поляризации вместо длины волны, облегчая поляриметрические измерения, которые используются при изучении вращения отдельных молекул.

    Использование ПЛИС обеспечивает гибкость: с некоторыми изменениями каналы управления также могут использоваться для запуска сканера для приложений конфокальной визуализации. Системы TCSPC высокого класса обычно включают в себя один или несколько преобразователей времени в цифру (TDC) с временным разрешением всего в несколько пикосекунд, подходящих для таких приложений, как время жизни флуоресценции или время жизни поляризационной анизотропии, а также демонстрации предотвращения группирования. Схемы реализации TDC 37 на FPGA теперь могут достигать разрешения 6 пс 38 и станут следующей очевидной модификацией этой системы.

    Благодарности

    Эта работа была поддержана грантом NSF MCB-09. Авторы благодарят доктора Догерти за подаренную плазмиду pYpet-His. Работа над WNV MTase была поддержана грантами № AI07079201A1 и AI09433501 от NIH.

    Информация для участников

    Бенджамин Д. Гамари, факультет физики Массачусетского университета, Амхерст, Массачусетс 01002.

    Дайанвэнь Чжан, факультет физики, Массачусетский университет, Амхерст, Массачусетс 01002.

    Ричард Э. Бакман, факультет физики Массачусетского университета, Амхерст, Массачусетс 01002.

    Пекер Милас, факультет физики, Массачусетский университет, Амхерст, Массачусетс 01002.

    Джон С. Денкер, AT&T Laboratories Research (в отставке) .), Florham Park NJ, 07932.

    Hui Chen, Wadsworth Center, Департамент здравоохранения штата Нью-Йорк, 120 New Scotland Ave, Albany, New York 12208.

    Hongmin Li, Wadsworth Center, Департамент здравоохранения штата Нью-Йорк, 120 New Scotland Ave, Albany, New York 12208 и Департамент биомедицинских наук, Школа общественного здравоохранения, Университет штата Нью-Йорк в Олбани, P.O. BOX 509, Олбани, Нью-Йорк 12201-0509.

    Лори С. Голднер, Факультет физики Массачусетского университета, Амхерст, Массачусетс 01002.

    Ссылки

    1. Эйд Дж.С., Мюллер Дж.Д., Граттон Э. Карта сбора данных для флуктуационной корреляционной спектроскопии, обеспечивающая полный доступ к обнаруженной последовательности фотонов . преподобный наук. Инструм. 2000;71(2):361–368. [Google Академия]2. Валь М., Ран Х.Дж., Грегор И., Эрдманн Р., Эндерлейн Дж. Прибор для подсчета фотонов с оптимизированным мертвым временем, коррелированным по времени, с синхронизированными независимыми временными каналами.преподобный наук. Инструм. 2007;78(3):033106. [PubMed] [Google Scholar]3. Фелекян С., Кухнемут Р., Кудрявцев В., Сандхаген С., Беккер В., Зайдель С.А.М. Полная корреляция от пикосекунд до секунд за счет обнаружения одиночных фотонов с временным разрешением и корреляцией по времени. преподобный наук. Инструм. 2005;76(8):083104. [Google Академия]4. Мельцер Д., Мандель Л. Определение корреляционных функций интенсивности по распределениям фотоэлектрического счета. IEEE J. Quantum Electron. 1970;6(11):661–668. [Google Scholar]Мацумото Г., Симидзу Х., Симада Дж.Компьютерная система счета фотоэлектронов. преподобный наук. Инструм. 1976; 47 (7): 861–865. [Google Scholar] Магатти Д., Ферри Ф. Программный коррелятор 25 нс для фотонной и флуоресцентной корреляционной спектроскопии. преподобный наук. Инструм. 2003;74(2):1135–1144. [Google Scholar] Уол М., Грегор И., Пэттинг М., Эндерляйн Дж. Быстрый расчет данных корреляции флуоресценции с асинхронным коррелированным по времени подсчетом одиночных фотонов. Опц. Выражать. 2003;11(26):3583–3591. [PubMed] [Google Scholar]5. Лоуренс Т.А., Форе С., Хузер Т.Быстрый и гибкий алгоритм расчета фотонных корреляций. Опц. лат. 2006;31(6):829–831. [PubMed] [Google Scholar]6. Гесс С.Т., Хуанг С.Х., Хейкал А.А., Уэбб В.В. Биологические и химические применения флуоресцентной корреляционной спектроскопии: обзор. Биохимия. 2002;41(3):697–705. [PubMed] [Google Scholar] Томпсон Н.Л., Лието А.М., Аллен Н.В. Последние достижения в корреляционной спектроскопии флуоресценции. Курс. мнение Структура биол. 2002;12(5):634–641. [PubMed] [Google Scholar] Виденгрен Дж., Риглер Р. Обзор – Флуоресцентная корреляционная спектроскопия как инструмент для исследования химических реакций в растворах и на клеточных поверхностях.Клетка. Мол. биол. 1998;44(5):857–879. [PubMed] [Google Scholar]7. Эйнштейн А. Движение элементов, взвешенных в статических жидкостях, как утверждается в молекулярно-кинетической теории тепла. Анна. Физ.-Берлин. 1905; 17 (8): 549–560. [Google Scholar] Сазерленд В. Динамическая теория диффузии неэлектролитов и молекулярная масса альбумина. Филос. Маг. 1905; 9 (49–54): 781–785. [Google Академия]8. Ригер Р., Рокер С., Ниенхаус Г.У. Флуктуационная корреляционная спектроскопия для передовой физической лаборатории. Являюсь.Дж. Физ. 2005;73(12):1129–1134. [Google Академия]9. Виденгрен Дж., Швайнбергер Э., Бергер С., Зайдель CAM. Две новые концепции измерения передачи энергии резонанса флуоресценции с помощью корреляционной спектроскопии флуоресценции: теория и экспериментальные реализации. Дж. Физ. хим. А. 2001;105(28):6851–6866. [Google Scholar] Уоллес М.И., Ин Л.М., Баласубраманиан С., Кленерман Д. Спектроскопия флуктуаций FRET: изучение конформационной динамики шпильки ДНК. Дж. Физ. хим. Б. 2000;104(48):11551–11555. [Google Scholar]Joo C, Balci H, Ishitsuka Y, Buranachai C, Ha T.Достижения в методах флуоресценции одиночных молекул для молекулярной биологии. Анну. Преподобный Биохим. 2008; 77: 51–76. [PubMed] [Google Scholar] Kuhnemuth R, Seidel CAM. Принципы многопараметрической флуоресцентной спектроскопии одиночных молекул. Один мол. 2001;2(4):251–254. [Google Академия] 11. Лоуренс Т.А., Капанидис А.Н., Конг XX, Чемла Д.С., Вайс С. Распределение интервалов времени прибытия фотонов (PAID): новый инструмент для анализа молекулярных взаимодействий. Дж. Физ. хим. Б. 2004;108(9):3051–3067. [Google Академия] 12. Гесс С.Т., Уэбб В.В.Оптика фокального объема и экспериментальные артефакты в конфокальной флуоресцентной корреляционной спектроскопии. Биофиз. Дж. 2002;83(4):2300–2317. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]13. Браун Р.Х., Твисс Р.К. Корреляция между фотонами в двух когерентных пучках света. Природа. 1956; 177 (4497): 27–29. [Google Академия] 14. Чжао М., Джин Л., Чен Б., Дин Ю., Ма Х., Чен Д.Ю. Послеимпульсный эффект и его коррекция в экспериментах по корреляционной спектроскопии флуоресценции. заявл. Опц. 2003;42(19):4031–4036. [PubMed] [Google Scholar] 17.Шетцель К. Методы корреляции в динамическом светорассеянии. заявл. физ. Б- 1987;42(4):193–213. [Google Академия] 18. Чу Б. Рассеяние света. 2-й. Нью-Йорк: Academic Press, Inc.; 1991. [Google Scholar]19. Шетцель К. Методы однофотонной корреляции. В: Браун В., редактор. Динамическое рассеяние света: метод и некоторые приложения. Кларендон, Оксфорд: 1993. [Google Scholar]21. Саффариан С., Элсон Э.Л. Статистический анализ флуоресцентной корреляционной спектроскопии: стандартное отклонение и погрешность.Биофиз. Дж. 2003;84(3):2030–2042. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]22. Шетцель К., Древел М., Стимак С. Измерения фотонной корреляции при больших временах запаздывания – повышение статистической точности. Дж. Мод. Опц. 1988;35(4):711–718. [Google Академия] 23. Шетцель К., Петерс Р. Шум в данных корреляции множественных фотонов тау. проц. ШПАЙ. 1991;1430:109–115. [Google Академия] 24. Цзянь РИ. Зеленый флуоресцентный белок. Анну. Преподобный Биохим. 1998; 67: 509–544. [PubMed] [Google Scholar] 25. Швилле П., Куммер С., Хейкал А.А., Мёрнер В.Е., Уэбб В.В.Корреляционная спектроскопия флуоресценции выявляет быструю внутримолекулярную динамику желтых флуоресцентных белков, обусловленную оптическим возбуждением. проц. Натл. акад. науч. США 2000;97(1):151–156. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]26. Виденгрен Дж., Риглер Р., Мец У. Мониторинг триплетного состояния с помощью флуоресцентной корреляционной спектроскопии. Дж. Флуоресц. 1994; 4: 255–258. [PubMed] [Google Scholar] 27. Хинк М.А., Грип Р.А., Борст Дж.В., ван Хук А., Эппинк М.Х.М., Шотс А., Виссе Аджвг. Структурная динамика зеленого флуоресцентного белка отдельно и слитого с одноцепочечным белком Fv.Дж. Биол. хим. 2000;275(23):17556–17560. [PubMed] [Google Scholar]Ускова М.А., Борст Дж.В., Хинк М.А., Ван Хук А., Шотс А., Клячко Н.Л., Виссер А. Динамика флуоресценции зеленого флуоресцентного белка в обращенных мицеллах АОТ. Биофиз. хим. 2000;87(1):73–84. [PubMed] [Google Scholar] 28. Клегг РМ. Резонансный перенос энергии флуоресценции и нуклеиновые кислоты. Методы Энзимол. 1992; 211:353–388. [PubMed] [Google Scholar] 30. Форстер Т. Energiewanderung und fluoreszenz. Натурвиссеншафтен. 1946; 33: 166–175. [Google Академия] 31.Lee NK, Kapanidis AN, Wang Y, Michalet X, Mukhopadhyay J, Ebright RH, Weiss S. Точные измерения FRET в отдельных диффундирующих биомолекулах с использованием переменного лазерного возбуждения. Биофиз. Дж. 2005;88(4):2939–2953. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]Капанидис А., Ли Н.К., Ван Ю, Лоуренс Т.А., Дуз С., Мишалет Х, Маргит Э., Мухопадхьяй Дж., Эбрайт Р.Х., Вайс С. Точное измерение расстояний и взаимодействий с использованием переменного лазерного возбуждения одиночных биомолекул. Биофиз. Дж. 2005;88(1):660А–661А.[Google Академия] 32. Гамари Б., Бакман Р., Милас П., Голднер Л.С. (неопубликовано) [Google Scholar] 33. Пирсон Б.Дж., Джексон Д.П. Практическое введение в одиночные фотоны и квантовую механику для студентов. Являюсь. Дж. Физ. 2010;78(5):471–484. [Google Академия] 34. Голдбург Висконсин. Динамическое рассеивание света. Являюсь. Дж. Физ. 1999;67(12):1152–1160. [Google Академия] 36. Ли Н.К., Капанидис А.Н., Кох Х.Р., Корланн Ю., Хо С.О., Ким Ю., Гассман Н., Ким С.К., Вайс С. Возбуждение одиночных молекул трехцветным переменным лазером: мониторинг множественных взаимодействий и расстояний.Биофиз. Дж. 2007;92(1):303–312. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]37. Калиш Дж., Шплет Р., Пасиербински Дж., Понецкий А. Преобразователь времени в цифру на основе программируемой вентильной матрицы с разрешением 200 пс. IEEE транс. Инструм. Изм. 1997;46(1):51–55. [Google Scholar]Сонг Дж., Ан Кью, Лю С.Б. Преобразователь времени в цифру с высоким разрешением, реализованный в программируемых вентильных матрицах. IEEE транс. Нукл. науч. 2006;53(1):236–241. [Google Академия] 38. Bayer E, Traxler M. 48-канальный время-цифровой преобразователь (TDC) с высоким разрешением (<10 пс RMS), реализованный в программируемой пользователем вентильной матрице (FPGA) IEEE Trans.